• Title/Summary/Keyword: 유전체 분석

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Analysis of the Phase Locked Microwave Oscillator Characteristics on the P-HEMT Gate-Bias Tuning (P-HEMT Gate-바이어스 튜닝에 의한 위상동기 마이크로파 발진기 특성분석)

  • 정인기;민상보;이영철
    • Proceedings of the IEEK Conference
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    • 2000.11a
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    • pp.369-372
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    • 2000
  • 본 논문에서는 P-HEMT Gate-바이어스 튜닝에 의한 위상동기 마이크로파 발진기를 설계하였다. 설계된 유전체 발진기는 병렬궤환공진 형태로서 P-HEMT의 게이트단에서 전압을 제어하여 전압제어발진기 형태로 주파수를 가변시키므로서 안정된 위상동기신호를 나타나도록 하였다. 위상동기방식은 외부에서 제공되는 125㎒의 기준주파수를 SRD로 체배시켜 하모닉 신호를 이용한 마이크로파 샘플링 위상검파 방식으로 설계하였으며, 유전체 발진기의 자유발진신호와 샘플링 신호사이의 위상비교에 의하여 ±1㎒ 범위의 고안정 특성을 갖는 13.25㎓대역의 위상고정 발진기의 동기화와 저 위상잡음을 나타내었다.

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Distribution Evolution Visualization of Nucleotide Sequence Data (염기서열 데이터 분포 변화량의 시각화 방법)

  • Lee, Il Seob;Lee, Keon Myung
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2017.04a
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    • pp.442-444
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    • 2017
  • 유전체는 생명체의 구성에 관련된 모든 정보를 포함하고 있다. 특정 종을 하나의 유전체로 표현하지만, 해당 종에 속하는 개체의 염색체는 조금씩 차이가 있어 개체별로 고유의 특성이 나타난다. 바이러스와 같이 개체 변이가 많이 일어나는 종에서는 종내에서 변이가 심할 수 있다. 종내에서 변이에 따른 특성을 파악하기 위해, 각 염기 위치별로 염기분포를 관찰하는 연구들이 진행되고 있다. 이 논문에서는 염기분포의 변화를 쉽게 분석할 수 있도록, 각 염기 위치에서의 분포변화를 시각화하는 방법을 제안하고 구현 결과를 소개한다.

Genomic Applications of Biochip Informatics (유전체 발현의 정보학적 분석과 응용)

  • Kim, Ju-Han
    • KOGO NEWS
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    • v.5 no.4
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    • pp.9-16
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    • 2005
  • Bioinformatics is a rapidly emerging field of biomedical research. A flood of large-scale genomic expression data transforms the challenges m biomedical research into ones in bioinformatics. Clinical informatics has long developed technologies to imp개ve biomedical research by integrating experimental and clinical information systems. Biomedical informatics, powered by high throughput techniques, genomic-scale databases and advanced clinical information system, is likely to transform our biomedical understanding forever much the same way that biochemistry did to biology a generation ago. The emergence of healthcare and biomedical informatics revolutionizing both bioinformatics and clinical informatics will eventually change the current practice of medicine, including diagnostics, therapeutics and prognostics.

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Study on Inclination Sensor by Capacitance Measurements (전기용량 측정에 의한 기울기 센서연구)

  • Kim, Han-Jun;Lee, Rae-Duk;Kang, Jeon-Hong;Semenov, Yu. P.;Han, Sang-Ok
    • Proceedings of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers Conference
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    • 2003.07b
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    • pp.807-810
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    • 2003
  • 금속 평행판 전극 사이에 주입된 액체 유전체의 움직임에 의해서 발생되는 차동 전기용량 변화를 이용하여 기울기 측정센서를 개발하였다. 기울기 $0^{\circ}{\sim}{\pm}90^{\circ}$의 범위에서 직선에 대한 상관계수가 0.999 99로 분석이 되어 우수한 선형성을 보였다. 센서의 전극구조를 완벽한 3-전극형 전기용량기로 설계하였기 때문에 외부로부터의 전자기 잡음 및 전기장의 영향에 관계없이 기울기를 정밀하게 측정할 수 있었다. 또한 안정된 디지털 출력을 이용하여 기울기의 정밀측정 뿐만 아니라 장치나 구조물 등의 기울기를 원격조정 또는 monitoring에도 적용이 가능하다.

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Effect of Calcination Temperatures on Microwave Dielectric Properties of (${Zn}_{0.8}{Mg}_{0.2}$)${TiO}_{3}$ (하소온도에 따른(${Zn}_{0.8}{Mg}_{0.2}$)${TiO}_{3}$계의 마이크로파 유전특성)

  • 심우성;방재철
    • Proceedings of the KAIS Fall Conference
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    • 2003.06a
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    • pp.91-94
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    • 2003
  • 하소온도에 따른 (Zn/sub 0.8.Mg/sub 0.2/)TiO₃ 마이크로파 유전체 세라믹스의 소결거동과 마이크로파 유전특성의 변화를 연구하였다. 저온소결을 위하여 0.45 wt.%Bi₂O₃와 0.55wt.%V₂O/sub 5/를 첨가하였으며, 1000℃이하의 온도에서 소결하여 치밀한 소결체를 얻을 수 있었다. 800℃~1000℃의 범위의 여러 온도에서 하소를 하고 소결 전ㆍ후의 존재상과 미세구조의 분석을 통하여, 하소한 분말에 존재하는 미반응상 및 이차상이 최소화 될 때 높은 Q×f/sub o/값을 갖는 것을 알 수 있었다. 1000℃에서 하소한 후 900℃에서 소결했을 때, 주상이 Hexagonal이고 미세구조가 균일하였으며, 이때 Q×f/sub o/ = 42,000㎓, ε/sub r/ = 22를 나타냈다.

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Genome-wide Association Study of Berry-related Traits in Grape Seedlings (포도의 교배집단을 이용한 과립 형질에 대한 유전체 전장 연관 분석)

  • Ryu, Hyang Hwa;Hur, Youn Young;Im, Dong Jun;Kim, Su Jin;Park, Seo-Jun;Lee, Dong hoon;Choi, Kyeong Ok
    • Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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    • 2019.10a
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    • pp.19-19
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    • 2019
  • 유전체 전장 연관분석 (GWAS)은 단일염기다형성(SNP)의 유전자형과 표현형 간의 통계적인 연관성을 분석함으로써 품종 선발용 SNP Marker 개발에 응용되고 있다. 본 연구에서는 Tano Red와 Ruby seedless 교배실생 278 계통을 대상으로 여러 과실 특성에 따른 관련 SNP를 동정함으로써 육종 선발에 필요한 DNA marker 개발에 필요한 기초 유전 자료를 얻고자 하였다. 한 계통 당 5~10개의 포도알을 선택하여 과립중, 과육탄성, 과피탄성, 과육경도, 과피경도, 과립당 종자갯수, 과립당 종자무게 및 인장강도를 측정하였다. 각 개체는 Genotyping by sequencing (GBS) 방법으로 Sequencing하여 Reference genome (Vitis vinifera PN40024 12X v2.)과 mapping 하였다. MAF (Minor allele frequency) >5%, Missing Data <30% 의 조건을 가진 SNPs 만 1차 선발하여 TASSEL과 GAPIT 프로그램으로 GWAS 분석을 하였다. Manhattan plot 결과 과립중 형질에서는 33개, 과립당 종자무게 25개와 인장강도에서는 20개의 통계학적으로 유의한 SNPs 가 선발되었고, 특이적으로 이들 모두 18번 염색체에서 발견되었다. 그러나 나머지 형질에서는 유의한 차이를 보이는 SNPs를 선발하지 못하였다. 과실의 인장강도는 수확 후 저장성과 유통과정에 영향을 미치기 때문에 Marker 개발을 통한 품종선별이 중요하다. 향후 이러한 특성과 본 연구를 통해 동정된 SNPs 의 상관관계를 구체적으로 연구하여 Marker 개발에 활용하고자 한다.

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Expression of Organogenesis-related Genes and Analysis of Genetic Stability by ISSR Markers of Regenerants Derived from the Process of in vitro Organogenesis in Japanese Blood Grass (Imperata cylindrica 'Rubra') (기내배양 홍띠 단계별 재분화체의 기관분화 관련 유전자 발현과 ISSR에 기반한 유전적 안정성 분석)

  • Ye-Jin Lee;In-Jin Kang;Chang-Hyu Bae
    • Korean Journal of Plant Resources
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    • v.36 no.5
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    • pp.496-507
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    • 2023
  • The in vitro organogenesis is one of important issues in plant embryology, and somaclonal variations are existing in calli and/or regenerants induced from a process of the organogenesis with in vitro circumstances. In this study, expressions of organogenesis-related genes were evaluated and genetic stability of regenerants derived from the process of in vitro organogenesis were measured using ISSR markers in Imperata cylindrica 'Rubra', Poaceae. The expressions of organogenesis-related genes were detected all of regenerants at the process of the organogenesis. All ISSR markers produced with an average of 71 bands per in vitro-cultured regenerants, and the scorable bands were varied from two to eight with an average of 5.14 bands per a primer. The polymorphism rates of the in vitro regenerants were higher than that of mother plants (1.4%), showing 4.1% (pot-cultured regenerants), 4.3% (field-cultured regenerants), 4.2% (in vitro-cultured regenerants), 5.6% (calli with green shoots) and 1.4% (calli), respectively. The genetic similarity matrix (GSM) among all accessions ranged from 0.747 to 1.0 with a mean of 0.868. GSM of the regenerants showed differences (from 0.972 to 1.00) compared with that of mother plants (0.991). According to the clustering analysis, two independent groups were divided into; the one is mother plants and regenerants cultured at room and open field, the other is regenerants cultured in vitro. The results give a new insight for understanding the dynamics of organogenesis in monocot plant.

Status of Molecular Biotechnology Research Based on Tissue Culture of Soybean (콩 조직배양 기술에 기반한 생명공학 연구 동향)

  • Seo, Mi-Suk;Cho, Chuloh;Choi, Man-Soo;Chun, JaeBuhm;Jin, Mina;Kim, Dool-Yi
    • Korean Journal of Plant Resources
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    • v.33 no.5
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    • pp.536-549
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    • 2020
  • Soybean (Glycine max (L.) Merrill) is one of the most important crops of the world. With the completion of the soybean genome sequence, the Korean soybean core collection consisted of 430 accessions with genetic and phenotypic diversity was constructed in recent year. The availability of genome sequences and core collection will result in the crop improvement by molecular breeding using the various accessions and genome editing approaches. Efficient tissue culture techniques, such as haploid production, protoplast culture and plant regeneration from various organs are essential for the successful molecular biological approach and crop improvement. However, soybean is still considered to be recalcitrant in tissue culture because of the low frequency of regeneration and limitation of available responsive cultivars. In this study, we discuss the recent studies of tissue culture technology and methodology for efficient tissue culture to genetic improvement and application of molecular biotechnology in soybean.

An Analysis of Ortholog Clusters Detected from Multiple Genomes (다종의 유전체로부터 탐지된 Ortholog 군집에 대한 분석)

  • Kim, Sun-Shin;Oh, Jeong-Su;Lee, Bum-Ju;Kim, Tae-Kyung;Jung, Kwang-Su;Rhee, Chung-Sei;Kim, Young-Chang;Cho, Wan-Sup;Ryu, Keun-Ho
    • Journal of KIISE:Databases
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    • v.35 no.2
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    • pp.125-131
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    • 2008
  • It is very useful to predict orthologs for new genome annotation and research on genome evolution. We showed that the previous work can be extended to construct OCs(Ortholog Clusters) automatically from multiple complete-genomes. The proposed method also has the quality of production of InParanoid, which produces orthologs from just two genomes. On the other hand, in order to predict more exactly the function of a newly sequenced gene it can be an important issue to prevent unwanted inclusion of paralogs into the OCs. We have, here, investigated how well it is possible to construct a functionally purer OCs with score cut-offs. Our OCs were generated from the datasets of 20 procaryotes. The similarity with both COG(Clusters of Orthologous Group) and KO(Kegg Orthology) against our OCs has about 90% and inclines to increase with the growth of score cut-offs.