• Title/Summary/Keyword: 유전자지도

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한우 6번 염색체의 Bootstrap기법을 이용한 우수 DNA 탐색

  • Lee, Je-Yeong;Yeo, Jeong-Su;Kim, Jae-Woo;Lee, Yong-Won;Kim, Mun-Jeong
    • 한국데이터정보과학회:학술대회논문집
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    • 2003.05a
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    • pp.41-47
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    • 2003
  • 한우 6번 염색체 유전자 지도에서 한우의 질을 높이기 위한 QTL(quantitative trait loci)분석을 실시하여 선별된 Loci 값을 Permutation Test를 이용하여 계산하였다. 한편, 경제적으로 주요한 한우의 특성부위(질적부위와 육량등)에 따른, 우수 경제형질 DNA marker를 K-평균 군집법을 실시 파악하였다. 이들 QTL과 K-평균법에 의해 한우의 염색체 6번, ILST035의 주요 경제 형질별 DNA marker들을 선별하여, Bootstrap BCa방법을 이용하여 각 DNA marker들의 신뢰구간을 구했다.

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최근에 연구개발되는 백신에 대하여

  • 한명국
    • KOREAN POULTRY JOURNAL
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    • v.33 no.3 s.377
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    • pp.104-106
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    • 2001
  • 작년 6월에 인간 유전자 지도의 초안이 작성된 이후 지난 2월 11일에 신문과 방송은 사람이 게놈지도가 완성되었다고 주요뉴스로 보도하였다. 1990년 8월에 인간게놈 연구계획이 발표된지 11년여간의 연구 끝에 이룩한 연구결과이다. 최근, 학문의 급속한 발전으로 질병의 진단과 치료에 새로운 지평이 열리고 있다 수의분야에서도 예외는 아니다. 특히 질병예방에 있어 중요한 백신의 연구개발에 있어서도 괄목할 만한 발전이 있었다. 유전공학의 발전과 여러 병원체의 병원성 인자와 체내의 면역기능과의 관련성 연구결과로 여러질병이 백신으로 예방이 가능하게 되었으며 보다 안전하고 효과적인 새로운 개념의 백신도 개발되고 있다. 새로운 백신, 즉 신백신은 유전자 조작(재조합)에 의한 병원성이 약해진 백신에서부터 여러 질병을 동시에 예방하려고 공안된 벡터백신, 그리고 유전자를 접종하는 DNA 백신 등이 대표적이다. 이들 백신은 기존백신에 사용되고 있는 백신보다 안전하고 경제적이며 우수한 효능을 발휘하도록 고안되고 있다.

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인간프로테옴 프로젝트 - 지놈프로젝트 이을 생물공학의 대역사

  • Korean Federation of Science and Technology Societies
    • The Science & Technology
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    • v.33 no.7 s.374
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    • pp.32-36
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    • 2000
  • 2000년 여름 인간 유전자지도 초안 완성과 더불어 마무리 단계에 와있는 인간 지놈프로젝트는 머지않아 생물학의 기본적인 해답을 줄 수 있는 인간 프로테옴프로젝트로 대체될 것이다. 세포의 주요한 기능은 단백질의 복잡한 연쇄작용으로 이뤄지는데 이런 과정을 이해함으로써 암과 당뇨병 치료용의 더 좋은 약품을 개발하는 새로운 전기를 마련할 것이다.

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Molecular Cloning of Antagonistic Genes in Pseudomonas maItophiliQ B-14 (토양병해 길항성 Pseudomonas maltophilia B-14의 길항유전자탐색)

  • 구본성;서영우;윤상홍;박경수;은무영;김용환;오상우;류진창;은무영
    • Microbiology and Biotechnology Letters
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    • v.20 no.6
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    • pp.619-624
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    • 1992
  • Tn5 lac 삽입으로 채소입고병원균에 길항력이 약화된 T-67 및 고추역병균과 참깨역병균에 길항력이 약화된 T-81의 Tn5 lac 유전자 일부와 오른쪽 말단에 있는 길항관련 유전자의 flanking sequence가 cloning된 pAG67 및 pAG81 clone을 선발하였고, pAG67 및 pAG81 clone된 길항관련 유전자의 flanking sequence를 야생 길항균 Pseudomonas maltophilia B-14의 DNA를 probe로 사용하여 Southern hybridization으로 확인하였으며, 제한효소 지도를 작성하여 8Kb 및 4Kb 크기의 flanking sequence가 cloning되었음을 확인하였다. pAG6 및 pAG81의 flanking sequence를 EcoRi-BglII와 EcoRI-MpaI으로 분리하여 유전자 은행으로부터 길항관련 유전자가 cloning된 cosmid clone 7개주를 선발하였다.

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Comparison of clustering with yeast microarray gene expression data (효모 마이크로어레이 유전자발현 데이터에 대한 군집화 비교)

  • Lee, Kyung-A;Kim, Jae-Hee
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • v.22 no.4
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    • pp.741-753
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    • 2011
  • We accomplish clustering analyses for yeast cell cycle microarray expression data. We compare model-based clustering, K-means, PAM, SOM and hierarchical Ward method with yeast data. As the validity measure for clustering results, connectivity, Dunn Index and silhouette values are computed and compared.

Detecting cell cycle-regulated genes using Self-Organizing Maps with statistical Phase Synchronization (SOMPS) algorithm (SOMPS 알고리즘을 이용한 세포주기 조절 유전자 검출)

  • Kang, Yong-Seok;Bae, Cheol-Soo
    • Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
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    • v.13 no.9
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    • pp.3952-3961
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    • 2012
  • Developing computational methods for identifying cell cycle-regulated genes has been one of important topics in systems biology. Most of previous methods consider the periodic characteristics of expression signals to identify the cell cycle-regulated genes. However, we assume that cell cycle-regulated genes are relatively active having relatively many interactions with each other based on the underlying cellular network. Thus, we are motivated to apply the theory of multivariate phase synchronization to the cell cycle expression analysis. In this study, we apply the method known as "Self-Organizing Maps with statistical Phase Synchronization (SOMPS)", which is the combination of self-organizing map and multivariate phase synchronization, producing several subsets of genes that are expected to have interactions with each other in their subset (Kim, 2008). Our evaluation experiments show that the SOMPS algorithm is able to detect cell cycle-regulated genes as much as one of recently reported method that performs better than most existing methods.