• 정보처리학회논문지:컴퓨터 및 통신 시스템
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• 제4권1호
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• pp.1-4
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• 2015

본 논문에서는 주어진 채널이 변형될 때, 아미노산들의 유효한 사이드 체인 배치(side chain conformation)를 찾는 알고리즘을 제시한다. 제안된 알고리즘은 아미노산의 유연성에 근거하여 사이드 체인 유연성을 가진 단백질 분자를 구현하고, 채널 변화에 영향을 주는 인접 아미노산(adjacent amino acid)을 추출한다. 인접 아미노산과 이웃(neighbor) 아미노산의 충돌 검사를 수행하여 유효하지 않은 사이드 체인 배치를 제거한 후, 회전각 조합 트리(rotation angle combination Tree)를 구성하여 사이드 체인 배치 중 유효한 것들만을 추출한다.

• 한국정보처리학회:학술대회논문집
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• 한국정보처리학회 2015년도 추계학술발표대회
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• pp.156-157
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• 2015

아미노산은 단백질 분자를 구성하는 기본 단위이다. 기하학적 측면에서 원자들을 구로 대응시키면, 아미노산은 구의 집합으로 표현될 수 있다. 본 논문에서는 잔기 유연성을 가진 아미노산의 잔기를 회전하는 구의 집합으로 표현하여, 위치가 고정된 아미노산 백본과 잔기 유연성을 가진 아미노산 잔기 간의 충돌 가능성을 탐지하는 방법을 제안한다.