• Title/Summary/Keyword: 온톨로지 NF$^2$

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Design and Implementation of eBook Annotation Ontology Based on Non-First Normal Form (Non-First Normal Form에 입각한 eBook Annotation 온톨로지의 설계와 구현)

  • Shin Sung-Wook;Kim Jong-Suk;Lim Soon-Bum;Choy Yoon-Chul
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2005.07b
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    • pp.361-363
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    • 2005
  • 본 연구에서는 온라인 다중 사용자 환경의 eBook 어노테이션 시스템 개발에서 데이터를 의미 기반으로 관리하고, 데이터에 대하여 상호 공통적인 이해를 표현하며, 그리고 데이터에 대한 무결성 검사 등을 지원하기 위해서 eBook 어노테이션 온톨로지를 구축하였다. eBook 어노테이션 테이터에 대한 상호 공통적인 이해의 표현을 위해서 한국 전자책 문서 표준인 EBKS(Electronic Book of Korea Standard)를 기반으로 구축 하였으며 구축된 온톨로지는 Conceptual Graph(CG)를 사용하여 표현하였다. 의미 기반의 처리를 위해서 본 온톨로지에서는 다국어(Multilingua) 관계를 고려하였으며 또한 오노테이션 데이터 생성 시 중요도를 표현하기 위해서 중요성 axiom을 고려했고, $NF^2$(Non-First Normal Form)에 입각하여 온톨로지를 설계함으로서 어노테이션 데이터의 검색에 활용도를 높였다. 제안된 온톨로지는 어노테이션 데이터의 재사용성을 높일 수 있고 의미 정보를 활용함으로써 eLearning, cyberclass과 같은 다중 사용자 환경에서 효과적인 협업을 가능하게 한다. 본 연구에서는 구현한 eBook annotation 시스템은 구축한 온톨로지를 사용함으로써 의미 기반의 데이터 관리가 가능하다. 또한 어노테이션 생성 시 온톨로지 구조를 모르더라도 어노테이션을 생성할 수 있는 인터페이스를 구현하였다.

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Effects of Sasa quelpaertensis Extract on mRNA and microRNA Profiles of SNU-16 Human Gastric Cancer Cells (SNU-16 위암 세포의 mRNA 및 miRNA 프로파일에 미치는 제주조릿대 추출물의 영향)

  • Jang, Mi Gyeong;Ko, Hee Chul;Kim, Se-Jae
    • Journal of Life Science
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    • v.30 no.6
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    • pp.501-512
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    • 2020
  • Sasa quelpaertensis Nakai leaf has been used as a folk medicine for the treatment of gastric ulcer, dipsosis, and hematemesis based on its anti-inflammatory, antipyretic, and diuretic characteristics. We have previously reported the procedure for deriving a phytochemical-rich extract (PRE) from S. quelpaertensis and how PRE and its ethyl acetate fraction (EPRE) exhibits an anticancer effect by inducing apoptosis in various gastric cancer cells. To explore the molecular targets involved in this apoptosis, we investigated the mRNA and microRNA profiles of EPRE-treated SNU-16 human gastric cancer cells. In total, 2,875 differentially expressed genes were identified by RNA sequencing, and gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analyses indicated that the EPRE-modulated genes are associated with apoptosis, mitogen-activated protein kinase, inflammatory response, tumor necrosis factor signaling, and cancer pathways. Subsequently, protein-protein interaction network analysis confirmed interactions among genes associated with cell death and apoptosis, and 27 differentially expressed microRNAs were identified by further sequencing. Here, GO and KEGG pathway analysis revealed that EPRE modified the expression of microRNAs associated with the cell cycle and cell death, as well as signaling of tropomyosin-receptor-kinase receptor, transforming growth factor-b, nuclear factor kB, and cancer pathways. Taken together, these results provide insight into the mechanisms underlying the anticancer effect of EPRE.