• 제목/요약/키워드: 생물학적 정보

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모티프 서열에서의 특징추출 및 빈발패턴 분석 (Feature selection and frequent pattern analysis in protein motif sequence)

  • 김대성;이범주;류근호
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2007년도 춘계학술발표대회
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    • pp.10-13
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    • 2007
  • 모티프는 진화과정을 거치면서 단백질 서열상에서 부분적으로 높게 보존된 지역을 의미한다. 이러한 모티프는 단백질의 기능과 구조를 예측하거나 생물학적으로 관련성이 있는 단백질의 공통적인 특성을 기술하는데 사용된다. 또한, 모티프와 단백질 서열의 상관관계는 생물학적 기능 예측에 필수적이며, 이러한 예측 문제는 모티프 검색을 통해 서열에 존재하는 빈발한 서열패턴과 구조패턴을 통해 단백질 서열에 대한 분석이 가능하다. 이 논문에서는 단백질 서열에 존재하는 2차 구조 특성과 빈발패턴을 검색하고 추출된 정보를 이용하여 단백질 기능 분류에 활용하고자 한다.

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다중서열수집 및 변환을 위한 효과적인 바이오인포메틱스 도구 (An Effective Bioinformatics Tool for Multiple Sequence Acquisition and Translation)

  • 이혜리;이승희;이건명;김성수;이찬희;이성덕
    • 한국지능시스템학회논문지
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    • 제18권1호
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    • pp.27-31
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    • 2008
  • 많은 바이오인포매틱스 관련 데이터베이스와 도구가 네트워크를 통해서 제공되고 있고, 이들을 효과적으로 활용하면 생물학적 분석을 적은 비용으로 우수한 결과를 얻을 수 있다. 이 논문에서는 주어진 질의에 대해서 잠재적으로 관련된 DNA 서열 정보를 획득하고, 분석자가 관심 있는 항목을 선택하면, 선택된 항목에 대한 모든 DNA 서열 정보를 확보하고, 이들에 대해서 아미노산 서열로 자동변환하여 ORF라는 정보를 활용하여 가장 가능성이 큰 것을 추천하는 도구를 소개한다. 해당 도구에는 웹 로봇 기법과 ORF 검색등을 위한 생물학적 지식을 활용한다.

리드 시퀀싱 시뮬레이터 비교 분석 (Analysis of Read Sequencing Simulator)

  • 탁해성;이상민;박기정;이도훈;조환규
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2013년도 추계학술발표대회
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    • pp.1203-1206
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    • 2013
  • 차세대 유전자 서열 시퀀싱 기법이 등장함에 따라 참조 유전자 서열로부터 리드를 생성하는 시퀀서의 기술이 다양화 되었다. 이전 시퀀싱 방식에 비해 비용 및 시간 측면에서 효율성이 증대 되었으나, 매핑도구의 검증을 위해서 다양한 생물학적 특이성을 반영하거나 비용이 소요되지 않는 방법을 연구하는 과정에서 리드 시퀀싱 시뮬레이터가 개발되었다. 본 논문에서는 현재 사용되고 있는 리드 시퀀싱 시뮬레이터에서 반영된 시퀀싱 기법을 분석하고 시뮬레이터의 기능적 특성을 분석하고자 한다. 이는 시뮬레이터 개발에 필요한 기능 설계 및 생물학적 특성을 반영하는데 활용하고자 한다.

바이오인포매틱스 인프라 구축

  • 손현석
    • 지식정보인프라
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    • 통권12호
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    • pp.52-57
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    • 2003
  • 바이오인포매틱스 시스템은 생명공학, 의학, 약학 등의 바이오인포매틱스 관련 산.학.연 연구자들의 연구개발의 기반이 되는 대용량의 생물정보를 효율적으로 저장하는 데이터베이스 구축 및 운영에 필요한 검색 처리 및 분석 시스템을 구축하는 정보인프라로서 21세기 가장 각광 받는 분야로 자리잡고있다. 최근 기하급수적으로 증가하고 있는 유전정보와 특정그룹이나 개인별 유전자 변화와 질병 감수성과의 관계 및 특정 질병과 관련된 유전자에 대한 생물학적 2차, 3차 분석정보 등 바이오인포매틱스 연구의 확대 필요성이 증가하고 있으나, 대부분의 생명공학 관련 산.학.연 연구자들은 연구분야에 적합한 IT기술을 적용할 수 있는 적절한 방법을 보유하고 있지못한 실정이다.

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시각정보처리과정을 이용한 인공시각시스템 (Artificial Vision System using Human Visual Information Processing)

  • 서창진
    • 디지털융복합연구
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    • 제12권11호
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    • pp.349-355
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    • 2014
  • 본 논문은 인간의 생물학적 시각정보처리과정 특성과 웨이블릿을 이용한 인공시각시스템을 제안한다. 인공시각시스템은 인간의 생물학적 시각정보 처리과정을 이용하며 맹인의 인공시각시스템 제작 및 일반적인 인식시스템에 적용할 수 있다. 본 논문에서는 인간의 망막에서 신경절 세포까지 정보 처리과정을 모델링하여 구성하였고 신경절 세포에서 후두엽 초기시각피질까지 전달되는 정보 복원과정을 모델링하여 초기시각피질에 표현되는 영상정보를 구성하였다. 실험과정은 인간의 시각정보 처리과정 특성인 저주파, 고주파 분해를 웨이블릿 변환으로 시각 정보를 구현하였고 이를 이용하여 인식 시스템에 적용하였다. 실험에 사용한 데이터는 AT&T 얼굴데이터베이스를 사용하였다. 그리고 제안하는 인간의 시각정보처리 과정 특성을 이용한 방법이 영상인식 시스템의 정확성을 향상시킬 수 있음을 실험을 통하여 증명하고자 한다.