• Title/Summary/Keyword: 생물학적 정보

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에이전트를 이용한 사용자 중심의 개인용 생물학 검색시스템 (User-Centric Personal Biological Retrieval System Using Agents)

  • 김영억;정광수;류근호
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2005년도 한국컴퓨터종합학술대회 논문집 Vol.32 No.1 (B)
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    • pp.76-78
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    • 2005
  • 생명정보 분야의 발전과 더불어 과거 축적되어 온 방대한 양의 생물학 데이터들이 이질적인 형태로 데이터베이스화 되어있다 특히, 인간게놈프로젝트의 완료 후에 유전자 및 단백질의 기능을 밝히기 위한 지노믹스 및 프로테오믹스 연구가 활발해졌다. 새로운 생물학적 과정을 탐색하기 위해서는 기존에 존재하는 생물학 데이터베이스의 데이터를 수집하기 위한 기술적인 검색 능력이 필요하다. 전산지식이 부족한 대부분의 생물학자들은 공개용 데이터베이스로부터 필요한 정보를 획득하는데 어려움을 격고 있다. 각 분야의 생물학자들이 공개용 데이터베이스로부터 자신의 분야에 관련된 데이터를 검색?추출하는 작업을 수월하게 해 줄 검색 시스템이 필요하다. 따라서, 에이전트를 이용하여 공개용 데이터베이스로부터 정보를 수집하는 사용자 중심의 개인용 검색시스템을 제안하고자 한다. 또한, 검색시스템을 이용하여 생물학자가 지노믹스와 프로테오믹스의 실험적인 접근을 위해 원하는 많은 양의 특정 도메인의 데이터를 검색하고 질의된 결과를 개인 컴퓨터에 2차 데이터베이스를 만들어 저장한다. 사용자에 의해 생성된 특정 분야의 도메인인 2차 데이터베이스를 통해 데이터의 접근의 편리성과 생물학 정보의 분석의 용이성을 얻을 수 있다.

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확률적 그래프 모델을 이용한 세포 간 정보 네트워크 추론 (Informatics Network Representation Between Cells Using Probabilistic Graphical Models)

  • 나상동;신현재;차월석
    • KSBB Journal
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    • 제21권4호
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    • pp.231-235
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    • 2006
  • 유전자 생물학 분야에서 적용가능 한 세포간 네트워크를 입증하는 고처리 정보공학에 응용하려는 수치학적인 표현 모델을 분석 연구한다. 확률적 그래프 모델을 사용하여 데이터 네트워크로부터 생물학적 통찰력을 확률적 함수적으로 응용해 복잡한 세포간 네트워크보다 단순한 하부모델로 구성하여 유전자 베이스네트워크 논리를 유전자 표현 레벨로 나타낸다. 유전자 데이터로부터 확률적 그래프 모델들을 분석하여 유전자 표현 데이터를 정보공학 네트워크 모델의 방법으로 확장 추론한다.

The Development of Herbal Medicine Network Analysis System

  • Ho Jang
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제28권10호
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    • pp.113-121
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    • 2023
  • 한의학 및 중의학 분야에서 네트워크 약리학은 계산학적인 방법을 통해 한약의 분자생물학적인 기전을 연구하기 위해 널리 활용된다. 개별 연구를 위해 사용되는 데이터베이스, 분석기법, 분석기준 등은 다양하나, 대부분의 한의학 네트워크 약리학 연구들은 약재-성분 네트워크 구축, 성분-표적 네트워크 구축, 표적의 해석이라는 유사한 단계로 수행된다. 효율적이고 일관성있는 한의학 네트워크 약리학 분석을 위해서, 우리는 일반적으로 적용할 수 있는 한의학 네트워크 분석 파이프라인 시스템을 설계하고 구현하였다. 우리는 이 시스템의 신뢰성을 약재의 네트워크 약리학 분석을 위해 널리 사용되는 데이터베이스를 활용해서 확인하였다. 제안된 시스템은 다양한 한약에 대한 네트워크 약리학적 분석을 용이하게 하고, 일관성 있는 분석을 도울 것이다.

마케팅 메시지로서의 지식: 유비쿼터스 개인지식관리 환경을 중심으로

  • 이경전;전정호
    • 한국경영정보학회:학술대회논문집
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    • 한국경영정보학회 2008년도 춘계학술대회
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    • pp.86-90
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    • 2008
  • 본 연구는 개인이 이른바 '유비쿼터스 개인지식관리 시스템'을 갖추고 있을 때 발생하게 될 것으로 예상되는 마케팅 메시지로서의 지식의 역할에 대한 개념적 연구를 수행한다. 기존의 마케팅 광고 메시지는 인간의 생물학적인 감각과 인지, 기억 능력에 의존하였기 때문에 반복적이고 자극적이어야만 했다. 그러나 유비쿼터스 환경에서는 UPA(Ubiquitous Personal Assistant)를 활용하여 개인이 소비하는 컨텐트를 이음매 없이(Seamless) 습득, 저장할 수 있게 되며, 이러한 변화는 마케팅과 광고의 방법에도 변화를 가져오게 될 것으로 판단된다. 이에 본 연구에서는 유비쿼터스 환경에서의 개인지식관리를 통하여 변화되는 마케팅과 광고의 모습을 나타내고자 하며, 이를 위해 시나리오를 제시하고 분석한다.

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DNA 마이크로어레이 데이터의 계층적 클러스터링에 대한 리프오더링 알고리즘 개발 (A Heuristic Leaf Ordering Algorithm for Hierarchical Clustering of DNA Microarray Data)

  • 여상수;이정원;김성권
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2002년도 봄 학술발표논문집 Vol.29 No.1 (A)
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    • pp.706-708
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    • 2002
  • DNA 마이크로어레이 실험으로 나온 데이터들을 클러스터링하는 것은 유전자의 기능과 유전자의 네트워크를 파악해 나가는데 도움을 주게 된다. 계층적 클러스터링(hierarchical clustering) 방법은 그러한 실험 분석에서 가장 보편적으로 사용되는 방법이다. 본 논문에서는 계층적 클러스터링을 통해서 나온 결과 트리에 대해서, 트리의 리프 노드들을 재배열함으로써, 인접한 리프 노드들간의 거리의 종합이 최소가 되도록 하는 문제인 리프오더링 방법을 다루었고, 새로운 리프오더링 알고리즘을 제안하였다. 그리고, 이를 포함한 여러 리프오더링 방법들에 대한 실험 및 생물학적인 분석을 하였다.

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국내 생체인식 표준화 작업의 필요성과 고려사항 (Consideration of Korean Biometric Standardization)

  • 김경원;박연규;김종희;이필중
    • 한국정보보호학회:학술대회논문집
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    • 한국정보보호학회 2001년도 종합학술발표회논문집
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    • pp.469-472
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    • 2001
  • 생체인식은 인간의 측정 가능한 생물학적인 또는 행동상의 특징을 이용하여 신원을 확인, 검증하는 방법이다. 현재 국외의 경우, 생체인식 관련 표준화 부분에 있어서 상당한 진척을 보이고 있다. 그러나 국내의 경우 아직 표준화 관련 작업이 미흡한 실정이다. 따라서 본 논문에서는 국제 표준화 동향에 대해 살펴보고 국내 생체인식 표준화의 필요성과 고려사항을 제시한다.

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신약설계를 위한 화합물 DB-chemical Database for Drug Design-

  • 이성광;노경태
    • 지식정보인프라
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    • 통권5호
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    • pp.41-50
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    • 2001
  • 화학구조 D B는 그 목적에 다양하게 분류될 수 있는데, 유사한 약효를 검색하기 위한 유사도 검색(similarity search) DB와 유기합성을 위한 reaction DB, 실험이나 계산으로 얻은 물성을 모은 property DB, 생물학적 검증 데이터를 모은 activity DB등이 있다. 이러한 화학 D B는 신약을 설계하는 입장에서 볼 때, 앞에서 말한 다양한 D B로서의 목적을 모두 충족시킬 수 있는 유기적인 설계가 바람직하다.

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개인인식을 위한 DNA Genotyping의 전처리 기법 (Preprocessing technology on DNA genotyping for personal verification)

  • 임효빈;오옥균;공은배
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2004년도 봄 학술발표논문집 Vol.31 No.1 (B)
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    • pp.586-588
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    • 2004
  • 최근 DNA 관련 기술의 개발이 활발하게 이루어지고 있고, 그에 따라 DNA를 개인인식에 사용마고자 하는 시도가 실시간 이용가능성이 높은 DNA 칩 기술과 합쳐져 매우 중요한 이슈로 떠오르고 있다. DNA를 분석하기 위해서는 생물학적 실험이 필수적으로 따르게 되는데 이러한 실험 결과를 인식에 적용하기 위해서는 적절한 전처리가 필요하다. 본 논문에서는 여러 장점들로 인해 최근 DNA분석 기술로 주목받고 있는 모세관 전기영동법을 사용하여 DNA를 분석하고, 그 분석물을 개인인식을 위해 genotyping하는 과정에서 전처리가 요구되는 각 경우들에 대해 논하고 적절한 필터링 기법들을 제시한다.

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단백체학과 생물정보학을 이용한 자궁 내 환경의 이해 (Understanding of Intrauterine Environment Changes based on Proteomics and Bioinformatics during Estrous Cycle)

  • 이상희;이승형
    • 생명과학회지
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    • 제29권5호
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    • pp.621-630
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    • 2019
  • 암컷의 자궁에서 일어나는 수정은 새로운 생명의 시작점이다. 암컷의 번식기관은 난소, 난관, 자궁, 자궁경부 및 질로 구성되어 있으며, 이들기관은 발정주기에 따라 생리학적인 역할이 조절된다. 자궁은 수정란의 발달과 착상이 이루어지는 곳이기 때문에, 수정란과 자궁 환경의 상호작용은 안정적인 임신을 위한 필수적인 조건으로 알려져있다. 자궁내막은 자궁의 한 부분으로써 이들의 형태학적인 특징은 호르몬에 의해 반복적으로 변화되며, 자궁내막으로부터 분비되는 자궁액 역시 그 특징이 변화하게 된다. 최근, 자궁내막 및 자궁액 내 포함된 대량의 단백질을 단백체학과 생물정보학의 발전에 따라 검출할 수 있게 되었으며, 이러한 기술에 의해 번식학 발전을 가속화하고 있다. 대량의 단백질 정보는 성호르몬 신호기전 및 혈관신생과 같은 이론 등을 깊게 연구할 수 있는 도구로써 이용되고 있다. 본 총설에서는 자궁내막의 재구성, 자궁선 및 자궁액에 대한 기초적인 생물학적인 지식을 바탕으로, 단백체학과 생물정보학을 활용한 자궁내막 및 자궁액 연구에 대해서 소개하고자 한다. 또한, 생물정보학 도구를 활용하여 단백체학에서 탐색된 자궁내막 및 자궁액 관련 단백질들의 상호작용 알아보는 방법에 대해서도 소개하였다. 따라서, 본 총설의 내용은 발정주기동안 자궁내막 안에서 일어나는 새로운 세포 신호기전을 탐색하는데 큰 도움이 될것이라 생각된다.