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Jung, Tae-Sung;Ahn, Myung-Sang;Cho, Wan-Sup
- Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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- 2005.07b
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- pp.238-240
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- 2005
유전자의 생물학적 기능을 밝히고 세포 내 상호작용을 이해하는 것은 post-genome era의 가장 중요한 작업 중 하나이다. 세포는 서로 다른 컴포넌트들의 상호작용에 의해 아주 복잡한 네트워크를 구성한다. 생화학적 네트워크에는 metabolic, regulatory, signal transduction과 같은 세포의 프로세스를 포함한다. 이러한 생화학적 네트워크들은 서로 다른 정보체계를 가지고 각기 다른 데이터베이스에 분산되어 저장관리 되고 있다. 따라서 생화학적 네트워크 데이터를 체계적으로 효율적으로 저장, 관리하기 위한 데이터베이스에 대한 필요성이 증대되고 있다. 본 논문에서는 기존의 생화학적 네트워크 데이터베이스의 장.단점을 분석하고 객체지향 방식에 입각한 새로운 생화학적 네트워크 데이터의 통합을 위한 시스템 모델을 제시한다. 제안된 시스템 모델은 생화학적 네트워크 데이터에 대한 생물학전 관계를 자연스럽게 표현할 수 있는 객체지향 모델을 사용하였다. 또한 생화학적 네트워크 모델을 묘사하기 위한 응용프로그램 사이의 데이터 교환의 표준언어인 SBML[2]스키마를 기반으로 하고 있다.
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Kim Dae-Soo;Jo Un-Jong;Huh Jae-Won;Choe Eun-Sang;Cho Byung-Wook;Kim Heui-Soo
- Journal of Life Science
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- v.16 no.3 s.76
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- pp.472-476
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- 2006
We have built a database server called HorseDB which contains the genome annotation information and biological information for horse from public database entries. The aims of HorseDB are the integration of biological information and horse genome data on genome scale using bioinformatic methods. To facilitate the extraction of useful information among collected horse genome and biological data, we developed a user-friendly interface system, HorseDB; an Integrated Horse Resource and web Service. The database is categorized by the general horse information data, a sequence annotation data, and a world-wide web analysis program interface. The database also provides an easy access for user to find out the useful information within horse genomes and support analyzed information, such as sequence alignment and gene annotation results. HorseDB can be accessed at http://www.primate.or.kr./horse.
https://doi.org/10.5352/JLS.2006.16.3.472 인용 PDF KSCI