• Journal of the Korean Association of Geographic Information Studies
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• v.11 no.4
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• pp.101-111
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• 2008

To provide more natural elements in the harsh urban environment, 'planting trees as urban forests' has been emphasized as having an important role, and trees are expected to be as functional as the trees under more natural conditions in rural areas, and provide people with benefits. To do this, urban forest policies needed a better idea of planting methods and management of trees through the theory of landscape ecology, and also the feedback system according to the evaluation and assessment of urban forests. In this case study, a new principle and assessment indices for the evaluation are applied for the 4 urban forests in two Korean metropolitan cities, Daejeon and Ulsan. The evaluation of Korean urban forest-function as biotope and the assessment for the classification of biotope diversity types are carried out. The AUEM(Adding Up Estimation Matrix) is applied for the analysis of urban forests. Unlikely previous researches on the other Korean metropolitan cities, the size of urban forest has less influence on the vegetation diversity. The most frequent biotope grade is the 3rd grade at Namseon park and Mt. Hamwol, while Mt. Bomun and Mt. Yeompo show the 4th grade. The grades of forest-function as biotope are from 3rd to 5th in which lower than average in forest-function grades. This means that the 4 sites are still not-matured forests and less-functional forests as the urban biotope.

• Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
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• v.21 no.5
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• pp.575-580
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• 2011

With the increasing expectation on personalized medicine, it is getting importance to analyze medical information in molecular biology perspective. Gene expression data are one of representative ones to show the microscopic phenomena of biological activities. In gene expression data analysis, one of major concerns is to identify markers which can be used to predict disease occurrence, progression or recurrence in the molecular level. Existing markers candidate identification methods mainly depend on statistical hypothesis test methods. This paper proposes a search method based decision tree induction to identify candidate markers which consist of multiple genes. The propose method discretizes numeric expression level into three categorical values and allows candidate markers' genes to be expressed by their negation as well as categorical values. It is desirable to have some number of genes to be included in markers. Hence the method is devised to try to find candidate markers with restricted number of genes.

• Journal of Aquaculture
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• v.22 no.1
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• pp.92-99
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• 2009

Population dynamics and sexual maturity of Neomysis japonica (Ishikawa and Oshima, 1951) were investigated from a shrimp farm in Tae-an, Korea. N. japonica was collected monthly at the shrimp farm belonging to the Marine and Fisheries Research Institute, the Soonchunhyang University from October 2002 to September 2003. The proportion of female was higher than that of male. The mean carapace length of male (2.42 mm) was larger than that of female (2.31 mm). Brood size increased with increasing female body size. The size of N. japonica at 50% sexual maturity was approximately 4.4 mm. N. japonica females grew faster and reached larger size than males. The mortality rate (z) calculated by length-converted catch curves was $3.46\;yr^{-1}$. The annual recruitment pattern of N. japonica had two major peaks. Log-transformed total length was significantly related with log-transformed carapace length.

• The Journal of Korean Institute of Electromagnetic Engineering and Science
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• v.12 no.1
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• pp.84-91
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• 2001

In in vitro cell experiments for the biological assessment of electromagnetic (EM) field, exposure system (ES) must be analyzed in terms of current density (J) and induced electric field intensity (E). Although in uniform B field, E and J in the sample medium are not distributed uniformly because of conductivity in sample dish. Thus, the precise estimation for E and J induced by uniform ELF within sample media is very important keys for successful in in vitro experiments. In this paper, we designed in vitro ELF ES with electromagnetic analysis using MATLAB simulator. Then we calculated from the measured B field to verify induced E & J distribution for random locations of cells within media in two cases of samples existence or not. ES with B field ranging from 0 to 20G consists of Helmholz coil and current generator based on the microprocessor. Also, we developed ELFES for each B field generation as uniform and non-uniform modes.

• Journal of the Society of Disaster Information
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• v.13 no.4
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• pp.442-454
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• 2017

Biological weapon is manipulated and produced from microorganisms such as bacteria, virus, rickettsia, fungi etc. It is classified as one of the Weapons of Mass Destruction (WMD) along with chemical weapon and radiological weapon. Biological weapon has a number of operational advantages over the other WMDs including ease of development and production, low cost and possibility of covert dissemination. In this study we analyze the history of biological weapon's development and the existing biological threats. Then, we predict the social impact of biological attack based on the physical properties of biological agent and infection mechanisms. By analyzing the recognition, dispersion pattern of agents, characteristics of the diseases in the biological weapon related historical events such as Sverdlovsk anthrax accident, 2001 anthrax attack, we found out some of the facts that biological attack would not likely to be recognized rapidly, produce large number of the exposed, increase number of paients who suffed from severe respiratory illness. It would lead the public health and medical service providers to be struggled with hugh burden. Base on the facts that we found from this case study, we suggested the main capabilities of public health required to respond to bioterrorism event efficiently. Syndromic surveillance and other reporting system need to be operated effeciently so that any suspicious event should be detected promptly. the pathogen which suspected to be used should be identified through laboratory diagnostic system. It is critical for the public health agency to define potentially exposed population under close cooperation with law enforcement agencies. Lastly, massive prophylaxis should be provided rapidly to the people at need by operating human and material resources effeciently. If those capacities of public health are consistantly fortified we would be able to deal with threat of bioterrorism successfully.

• Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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• 2003.10a
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• pp.114-119
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• 2003

단백질 구조를 비교하는 방법은 단백질 구조를 표현하는 기술에 따라 다양하게 존재한다. 일반적인 단백질 구조 정렬방법은 단백질 구조를 원자 또는 Residue를 기준으로 표현하고, 표현된 두 구조사이의 일치된 부분을 찾는 방법과 단백질 구조를 단백질 이차구조요소로 표현하고 표현된 두 단백질 구조를 정렬하는 방법으로 크게 구분된다. 이러한 단백질 구조 비교 방법은 단백질 구조의 유사성을 측정하는 과정에서 많은 시간을 요구할 뿐만 아니라 PDB에 저장된 데이터가 증가함에 따라 보다 많은 단백질과 비교가 요구된다. 따라서 대용량의 단백질 구조 데이터베이스를 대상으로 효율적으로 단백질의 유사 부분구조를 찾을 수 있는 방법이 필요하다. 본 논문에서는 단백질 구조 비교를 보다 빠르고 효과적으로 수행하기 위하여, 기존의 단백질 이차구조 기반의 구조 표현 방법인 PSAML을 확장하여 단백질 이차구조가 가지는 공간상의 정보를 내포한 Topology String을 생성하고 이를 이용하여 대용량의 단백질구조 데이터베이스에서 유사성이 높은 단백질 구조를 필터링하는 방법에 대하여 기술한다. Topology String은 단백질 이차구조를 하나의 문자로 기술하여 아미노산 순서와 위상학적인(공간적인) 정보를 바탕으로 단백질 구조를 표현하여, 단백질 이차구조를 이용하여 구조 비교를 수행하기 이전에 유사성이 높은 단백질 구조를 신속하게 찾아내는데 효과적으로 적용될 수 있다.

• Proceedings of the Korean Institute of Intelligent Systems Conference
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• 2007.11a
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• pp.145-148
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• 2007

생명과학분야에서 마이크로어레이 기술은 세포에서의 RNA 발현 프로파일을 관찰할 수 있도록 함으로써 생명현상의 규명 및 약물개발 둥에서 분자수준의 생명현상에 대한 관찰과 분석이 가능 해지고 있다. 마이크로어레이 데이터분석에서는 특정한 처리나 과정에서 현저한 특성을 보이는 유전자를 식별하기 위한 분석뿐만 아니라 유전자 전체인 게놈수준에서의 분석도 이루어진다. 최근 유전자의 발현이 다양한 조절, 신호전달 및 대사경로에 의해서 영향을 받고 있다는 관점에서 게놈수준의 분석에 관심이 증가하고 있다. 약물반응 실험에서는 약물에 대한 게놈수준의 발현 프로파일을 관찰하는 것도 많은 정보를 제공할 수 있다. 약물실험에서는 대조군과 실험군들간에 관심 있는 상대적인 발현특성을 갖는 유전자군을 전체적으로 추출하는 것이 필요한 경우가 있다. 예를 들면 정상군은 두개의 실험군에 대해서 중간청도의 발현정도를 갖는 유전자군을 식별하는 분석을 하는 경우, 생물학적인 데이터의 특성상 절대값을 비교하는 방법으로는 유용한 유전자들을 효과적으로 식별해 낼 수 없다. 이 논문에서는 정상군과 실험군들의 발현정도값의 경향을 판단하기 위해서 각 유전자에 대해서 집단별 대표값을 선정하여 퍼지집합으로 집단의 값의 범위를 결정하고, 이를 이용하여 특정 패턴을 갖는 유전자들을 식별해내는 방법을 제안하고, 실제 데이터를 통해서 실험한 결과를 보인다.

• The Science & Technology
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• v.33 no.5 s.372
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• pp.68-73
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• 2000

10여년간에 걸쳐 30억달러의 자금이 투입된 인간게놈계획사업(genome project)은 유전자의 배열상태를 우선 밝히는 역사적인 작업을 마무리했다. 2000년 3월 14일에는 클린턴 미국대통령과 블레어 영국수상이 그동안의 인간게놈계획의 연구결과를 전 세계 과학자들에게 무료로 공개한다고 발표하여 세계과학자들의 기대를 부풀게 했다. 그러나 30억 이상의 유전정보를 해독하는 사업은 이제 겨우 시작에 지나지 않다는 것도 사실이다. 인간게놈의 배열을 가려내는 것은 사전으로 비유할 때 모든 낱말의 알람표를 만들었을 뿐이며 그 낱말들(배열)이 무슨 뜻을 갖고 있는 것인지 밝히는 일은 지금부터 풀어야 할 과제이다. 세계 주요 의약계는 먼저 인간게놈에 내포된 10만개 이상의 유전자가 어떤 기능을 갖고 있는가 해독하는데 필요한 툴(연장)을 고안하여 유전자에서 얻는 지식을 이용하여 신약을 개발하는 불꽃튀는 경쟁에 뛰어 들었다. 그러나 이것은 간단한 일이 아니다. 신약개발에는 평균 15년이란 오랜 세월이 걸리고 당초의 유효성분의 발견이 약으로써 상품화되는 비율은 5% 이하다. 잠재적인 신약후보는 독성부작용을 알아보기 위해 동물을 이용한 생물학적 검사와 수년간에 걸친 인간에 대한 임상실험을 거쳐야 한다. 아무리 게놈기술이 탁월하다고 해도 이 과정을 단축시킬 방법이 없다. 그러나 게놈프로젝트의 열매가 우리의 의학 및 약학발전사에 중대한 이정표를 세울 것만은 틀림없다. 세계의 대표적인 연구기관을 통해 2050년까지의 의약발전상을 미리 내다본다.

• Proceedings of the Korean Environmental Sciences Society Conference
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• 2002.05b
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• pp.209-212
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• 2002

The heavy use of petroleum products in modern livings has brought ubiquitous environmental contaminants of aromatic compounds, which persist in aquatic and geo-environment without the substantial degradation. The persistence and accumulation of the aromatic compounds, which include xylene, phenol, toluene, phthalate, and so on are known to cause serious problems in our environments. Some of soil and aquatic microorganisms facilitate their growth by degrading aromatic compounds and utilizing degrading products as growth substrates, the biodegradation helps the reentry of carbons of aromatic compounds, preventing their accumulation in our environments. The metabolic studies on the degradation of aromatic compounds by microoganlsms were extensively carried out along with their genetic studies. A Rhodococcus sp. isolated in activated sludges has shown the excellent ability to grow on phenol as a sole carbon source. In the present study investigated a gene encoding phenol-degrading enzymes from a Rhodococcus sp.

• Food Industry
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• s.212
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• pp.68-74
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• 2009

기후변화(Climate change) 문제가 세계적인 초미의 관심사로 대두되고 있다. 특히 기후변화의 주범이 인간활동인 것이 밝혀지면서(IPCC, 2007), 국제사회는 기후변화협약(UNFCCC), 온실가스 배출량 규제 등 21세기 인류가 직면한 최대 위기인 기후변화를 극복을 위한 완화(mitigation)와 적응(adaptation) 전략을 수립하고 시행하기 위하여 총력을 기울이고 있다. 기후변화는 인류와 관련된 모든 분야에 다양하면서 광범위한 영향을 준다. 특히 기후변화로 인한 기온, 습도, 강수량 등의 변동은 식품과 관련된 생물학적, 화학적 및 물리적 위해인자들의 변화를 초래할 것이고, 이는 곧 식품안전 사건과 사고와 직결된다. 우리나라의 기후변화가 이미 국제적 기후변화의 수준을 추월하였고, 향후 급속한 기후변화가 전망됨에 따라(국립기상청, 2009) 기후변화로 인한 식품안전 분야의 적절한 사전예방적 대책 마련이 필요한 상황이다. 이러한 대책의 수립이 시급함에도 불구하고, 기후변화와 식품안전에 대한 과학적으로 증명되어야 할 불확실한 부분이 많이 내재되어 있는 것도 사실이다. 따라서 본고에서는 기후변화로부터 식품안전을 확보하기 위한 제도 정책적 전략 수립에 도움을 주고, 기후변화에 따른 식품안전 분야의 영향에 대한 정보를 국민에게 정확하게 전달할 수 있는 홍보 교육 자료의 개발에 활용할 목적으로 수행된 "기후변화와 식품안전에 대국민 인지도 설문조사" 내용 중 종요한 부분을 발취하여 정리하였다. 이 설문조사는 전국 16대 광역시도에 거주하는 만 13세 이상의 국민을 대상(유효 응답자수 1,036명)으로 "기후변화 인식수준", "식품안전 인식 수준", "식품안전 지식 수준"에 대한 16가지 질문을 전화 면접조사를 통해 설시되었다(표준오차 3.04%, 95% 신뢰수준).