Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2005.07b
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pp.76-78
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2005
생명정보 분야의 발전과 더불어 과거 축적되어 온 방대한 양의 생물학 데이터들이 이질적인 형태로 데이터베이스화 되어있다 특히, 인간게놈프로젝트의 완료 후에 유전자 및 단백질의 기능을 밝히기 위한 지노믹스 및 프로테오믹스 연구가 활발해졌다. 새로운 생물학적 과정을 탐색하기 위해서는 기존에 존재하는 생물학 데이터베이스의 데이터를 수집하기 위한 기술적인 검색 능력이 필요하다. 전산지식이 부족한 대부분의 생물학자들은 공개용 데이터베이스로부터 필요한 정보를 획득하는데 어려움을 격고 있다. 각 분야의 생물학자들이 공개용 데이터베이스로부터 자신의 분야에 관련된 데이터를 검색?추출하는 작업을 수월하게 해 줄 검색 시스템이 필요하다. 따라서, 에이전트를 이용하여 공개용 데이터베이스로부터 정보를 수집하는 사용자 중심의 개인용 검색시스템을 제안하고자 한다. 또한, 검색시스템을 이용하여 생물학자가 지노믹스와 프로테오믹스의 실험적인 접근을 위해 원하는 많은 양의 특정 도메인의 데이터를 검색하고 질의된 결과를 개인 컴퓨터에 2차 데이터베이스를 만들어 저장한다. 사용자에 의해 생성된 특정 분야의 도메인인 2차 데이터베이스를 통해 데이터의 접근의 편리성과 생물학 정보의 분석의 용이성을 얻을 수 있다.
This study is a numerical representative modeling analysis for the application of the process that unravels networks between cells in genetics to web of informatics. Using the probabilistic graphical model, the insight from the data describing biological networks is used for making a probabilistic function. Rather than a complex network of cells, we reconstruct a simple lower-stage model and show a genetic representation level from the genetic based network logic. We made probabilistic graphical models from genetic data and extends them to genetic representation data in the method of network modeling in informatics
Journal of the Korea Society of Computer and Information
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v.28
no.10
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pp.113-121
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2023
Network pharmacology in traditional Korean and Chinese medicine studies the molecular and biological aspects of herbal medicine using computational methods. Despite variations in databases, techniques, and criteria, most studies follow similar steps: constructing herb-compound networks, compound-target networks, and target interpretation. To ensure efficient and consistent analysis in herbal medicine network pharmacology, we designed and implemented a common analysis pipeline. We showed its reliability with existing databases. The proposed system has a potential to facilitate network pharmacology analysis in traditional medicine, ensuring consistent analysis of various herbal medicines.
본 연구는 개인이 이른바 '유비쿼터스 개인지식관리 시스템'을 갖추고 있을 때 발생하게 될 것으로 예상되는 마케팅 메시지로서의 지식의 역할에 대한 개념적 연구를 수행한다. 기존의 마케팅 광고 메시지는 인간의 생물학적인 감각과 인지, 기억 능력에 의존하였기 때문에 반복적이고 자극적이어야만 했다. 그러나 유비쿼터스 환경에서는 UPA(Ubiquitous Personal Assistant)를 활용하여 개인이 소비하는 컨텐트를 이음매 없이(Seamless) 습득, 저장할 수 있게 되며, 이러한 변화는 마케팅과 광고의 방법에도 변화를 가져오게 될 것으로 판단된다. 이에 본 연구에서는 유비쿼터스 환경에서의 개인지식관리를 통하여 변화되는 마케팅과 광고의 모습을 나타내고자 하며, 이를 위해 시나리오를 제시하고 분석한다.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2002.04a
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pp.706-708
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2002
DNA 마이크로어레이 실험으로 나온 데이터들을 클러스터링하는 것은 유전자의 기능과 유전자의 네트워크를 파악해 나가는데 도움을 주게 된다. 계층적 클러스터링(hierarchical clustering) 방법은 그러한 실험 분석에서 가장 보편적으로 사용되는 방법이다. 본 논문에서는 계층적 클러스터링을 통해서 나온 결과 트리에 대해서, 트리의 리프 노드들을 재배열함으로써, 인접한 리프 노드들간의 거리의 종합이 최소가 되도록 하는 문제인 리프오더링 방법을 다루었고, 새로운 리프오더링 알고리즘을 제안하였다. 그리고, 이를 포함한 여러 리프오더링 방법들에 대한 실험 및 생물학적인 분석을 하였다.
Proceedings of the Korea Institutes of Information Security and Cryptology Conference
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2001.11a
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pp.469-472
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2001
생체인식은 인간의 측정 가능한 생물학적인 또는 행동상의 특징을 이용하여 신원을 확인, 검증하는 방법이다. 현재 국외의 경우, 생체인식 관련 표준화 부분에 있어서 상당한 진척을 보이고 있다. 그러나 국내의 경우 아직 표준화 관련 작업이 미흡한 실정이다. 따라서 본 논문에서는 국제 표준화 동향에 대해 살펴보고 국내 생체인식 표준화의 필요성과 고려사항을 제시한다.
Journal of Scientific & Technological Knowledge Infrastructure
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s.5
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pp.41-50
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2001
화학구조 D B는 그 목적에 다양하게 분류될 수 있는데, 유사한 약효를 검색하기 위한 유사도 검색(similarity search) DB와 유기합성을 위한 reaction DB, 실험이나 계산으로 얻은 물성을 모은 property DB, 생물학적 검증 데이터를 모은 activity DB등이 있다. 이러한 화학 D B는 신약을 설계하는 입장에서 볼 때, 앞에서 말한 다양한 D B로서의 목적을 모두 충족시킬 수 있는 유기적인 설계가 바람직하다.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2004.04b
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pp.586-588
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2004
최근 DNA 관련 기술의 개발이 활발하게 이루어지고 있고, 그에 따라 DNA를 개인인식에 사용마고자 하는 시도가 실시간 이용가능성이 높은 DNA 칩 기술과 합쳐져 매우 중요한 이슈로 떠오르고 있다. DNA를 분석하기 위해서는 생물학적 실험이 필수적으로 따르게 되는데 이러한 실험 결과를 인식에 적용하기 위해서는 적절한 전처리가 필요하다. 본 논문에서는 여러 장점들로 인해 최근 DNA분석 기술로 주목받고 있는 모세관 전기영동법을 사용하여 DNA를 분석하고, 그 분석물을 개인인식을 위해 genotyping하는 과정에서 전처리가 요구되는 각 경우들에 대해 논하고 적절한 필터링 기법들을 제시한다.
Fertilization is the beginning of a new life that occurs in the female uterine. The female reproductive tract is composed ovary, oviduct, uterine, vagina and cervix, their physiological features are regulated by estrous cycle. Of these, uterine is a main point to establish embryo development and implantation, and intercommunication between embryo and uterine environment is necessary for suitable pregnancy. Endometrium is part of the uterine, its morphology is repetitively changed by hormones, and characteristic of uterine fluid from endometrium is also changed. Recently, massive proteins of endometrium and uterine fluid can be detected according to develop proteomics and bioinformatics and have been accelerated the understanding of the reproductive biology fields. Moreover, the massive protein information is actively studying with deeply studied theory such as sex hormone signal pathway and angiogenesis in mammals. In this paper, we review understanding of endometrium remodeling, uterine gland and fluid during estrous cycle, additionally studies on endometrium and uterine fluid based on proteomics techniques. Lastly, we introduced methods of the protein-protein correlation using bioinformatics tool that interaction with hormone receptors, representative angiogenetic factors and detected proteins using proteomics in endometrium and uterine fluid. This review will be useful to understanding the study on search of new cell mechanism in endometrium and uterine fluid.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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