• Korean Journal of Microbiology
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• v.55 no.3
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• pp.296-299
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• 2019

The genus of Bacteroides has been isolated from vertebrate animal feces. Bacteroides sp. KGMB 02408 was isolated from fecal samples obtained from a healthy Korean. The wholegenome sequence of Bacteroides sp. KGMB 02408 was analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises a 5,771,427 bp chromosome with a G + C content of 39.50%, 5,005 total genes, 18 rRNA genes, and 74 tRNA genes. Furthermore, we found that strain KGMB 02408 had some genes for oxidoreductases and menaquinone biosynthesis in its genome based on the result of genome analysis.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.55 no.2
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• pp.160-163
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• 2019

Senegalimassilia sp. KGMB 04484 was isolated from fecal samples obtained from a healthy Korean. The whole-genome sequence of Senegalimassilia sp. KGMB 04484 was analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises a 2,748,041 bp chromosome with a G+C content of 61.18%, 2,300 total genes, 2,139 protein-coding gene, 21 rRNA genes, and 51 tRNA genes. Also, we found that strain KGMB 04484 had some genes for hydrolysis enzyme, fatty acid biosynthesis and metabolism in its genome based on the result of genome analysis. Those genes of KGMB 04484 may be related to regulation of human health and digest.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.54 no.4
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• pp.456-459
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• 2018

The genus of Olsenella has been isolated from vertebrate animal mouth, rumen, and feces. Olsenella sp. KGMB 04489 was isolated from fecal samples obtained from a healthy Korean. The whole-genome sequence of Olsenella sp. KGMB 04489 was analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises a 2,108,034 bp chromosome with a G + C content of 65.50%, 1,838 total genes, 13 rRNA genes, and 52 tRNA genes. Also, we found that strain KGMB 04489 had some genes for hydrolysis enzymes, and antibiotic biosynthesis and resistance in its genome based on the result of genome analysis.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.55 no.3
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• pp.289-292
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• 2019

Lachnospiraceae bacterium KGMB03038 (=KCTC 15821) belonging to the class Clostridia in phylum Firmicutes, was isolated from a stool sample of a healthy Korean. Herein, we report the complete genome sequence of strain KGMB03038 analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises of 3,334,474 bp with G + C content of 47.8%, which includes 3,099 predicted protein-coding genes, 12 ribosomal RNAs, 54 transfer RNAs, and 4 ncRNAs. Genome analysis revealed that strain KGMB03038 possesses a number of genes involved in hydrolysis of carbohydrates, including mono-, di-, and oligo-saccharides, and biosynthesis of various amino acids.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.55 no.3
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• pp.274-277
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• 2019

Ruminococcus sp. KGMB03662 was isolated from fecal samples obtained from a healthy Korean. The whole-genome sequence of Ruminococcus sp. KGMB03662 was analyzed using the PacBio Sequel platform. The genome comprises a 2,707,502 bp chromosome with a G + C content of 43.09%, 2,484 total genes, 2,367 protein-coding gene, 14 rRNA genes, and 53 tRNA genes. In the draft genome, genes involved in the hydrolysis enzyme, fatty acid biosynthesis, fatty acid metabolite, antibiotic biosynthesis, and antibiotic resistance have been identified. Those genes of KGMB03662 may be related to the regulation of human health and disease.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.55 no.2
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• pp.171-173
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• 2019

The genus Cohnella, which belongs to the family Paenibacillaceae, inhabits a wide range of environmental niches. Here, we report the complete genome sequence of Cohnella sp. HS21, which was isolated from the rhizospheric soil of Korean fir (Abies koreana) on the top of Halla Mountain in the Republic of Korea. Strain HS21 features a 7,059,027 bp circular chromosome with 44.8% GC-content. Its genome contains 5,939 protein-coding genes, 78 transfer RNA (tRNA) genes, 27 ribosomal RNA (rRNA) genes, 4 noncoding RNA genes (ncRNA), and 90 pseudogenes. The bacterium contains antibiotic-related gene clusters and genes encoding plant cell wall-degrading enzymes.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2019.10a
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• pp.42-42
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• 2019

한국생명공학연구원은 1985년 설립된 이후로 현재까지 국가적 연구개발 수요에 대응하여 바이오 분야의 기초 원천 연구, 인프라 구축 및 운영을 통하여 우리나라 생명과학기술 발전에 힘써왔다. 특히 2006년부터는 해외생물자원의 중요성에 주목하여 차세대 국가 핵심 전략 BT산업의 필수 원자재인 생물소재의 범지구적 확보, 보존 및 관리를 위하여 해외생물소재센터를 설치하였다. 이후 차례로 중국, 코스타리카, 인도네시아, 베트남의 4개 거점 센터를 개소 및 운영하여 권역별 해외생물소재의 공동연구 및 국제협력 네트워크를 구축하고 효과적인 소재 확보 및 관리를 도모하고 있다. 이와 같이 확보된 소재는 36개국에서 채집된 약 318과 3,406속의 36,500여점 (2019년 9월 기준)에 달하고 소재의 확증표본은 해외생물소재센터 식물표본관(KRIB)에 보관 중이다. KRIB표본관은 2000년 Index Herbariorum에 등록되었으며, 약 80,000여점의 건조표본을 소장하고 있다. 분류군수는 과별로 콩과>국화과>꼭두서니과 순으로 많았으며, 국가별로는 중국>베트남>코스타리카 순으로 조사되었다. 한국생명공학연구원 해외생물소재센터 및 식물표본관은 소재의 정확한 동정을 위한 분류학적 시설로서의 역할뿐 아니라 누구에게나 개방된 홈페이지를 통하여 해외소재의 표본정보, 표본이미지 및 민속학적 정보와 활성 등 가치 있는 정보를 제공하여 연구자들에게 다양한 활용지원 서비스를 제공하고 있다.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2019.10a
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• pp.99-99
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• 2019

한국생명공학연구원 해외생물소재센터는 해외생물소재 확보 및 활용연구를 통하여 차세대 국가핵심전략 BT산업의 필수원자재인 생물소재의 범지구적 확보와 보존 관리의 임무를 수행하고 있다. 이를 위해 권역별 해외생물소재 공동연구센터(중국, 코스타리카, 인도네시아, 베트남) 및 37개국과의 국제협력 네트워크를 구축하고 있다. 세계적 수준의 생물소재 국가 인프라 구축을 목표로 국내 산 학 연 연구자들에게 다양한 해외생물소재 공급을 통한 지속 가능한 바이오 경제 기반 구축을 지원하고 있다. 해외생물소재센터에서는 2006년부터 특히 천연물 의약품 개발 분야에 많이 사용 되고 있는 해외 식물소재를 지속적으로 확보하고 있으며, 확보된 식물소재의 추출물 제조 및 추출물 은행을 구축, 이에 대한 생물활성 평가를 실시하며 연구자들에게 기초 자료로 제공하고 있다. 현재까지 총 36,500종의 해외식물소재를 확보하였으며, 추출물 약 320만점을 확보하였다. 확보된 소재의 분양활동을 통해 산 학 연 연구자들에게 180만여 점을 분양하였으며, 이를 활용한 다수의 논문과 특허를 획득하였고 중대형 기술이전을 실시하였다. 해외생물소재센터는 홈페이지 기반 분양 신청 시스템[https://www.ibmrc.re.kr]을 통하여 해외식물소재(Powder 와 Extact 형태) 분양서비스를 제공하고 있다. 또한 소재가치제고 연구를 통한 산업화 지원과 해외생물소재의 표본정보 서비스, 해외거점센터를 활용한 현지정보 제공 서비스를 지원하고 있다.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2010.10a
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• pp.8-8
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• 2010

식물거점센터는 교과부 지정 식물소재은행들의 생물자원의 체계적 통합 및 관리, 소재은행들과 연구소재 네트워크 형성, 표준화 관리 시스템 구축을 통한 소재의 효율적 관리, 인적 물적 자원 지원, 식물학, 농학, 생명공학, 유전학 등의 연구 기반 활성화 도모, 소재의 공동 영구보관 시스템 구축, 각 생물체별 데이터베이스 공동 구축, 공동 매뉴얼 작성 및 관련 연구, 공동 정보구축 지원, 중단소재은행의 자료 관리 시스템 구축을 목적으로 하여 2007년 4월 교육과학기술부에 의해 지정되어 출범하게 되었다. 식물거점센터는 한국배추게놈소재은행, 한국의 식물 DNA 은행II, 인삼유전자원소재은행, 감귤육종소재은행, 한국감자육종소재은행, 한약자원향장소재은행, 천연물 신약 표준화 소재은행, 대사질환소재은행 등 8개 소재은행으로 구성되어 있으며, 거점센터의 주요 역할은 OECD가 규정하는 resource center의 역할로 연구소재의 확보, 분류와 동정, 보관, 분량, 인력 양성, 컨설팅 등의 기능을 수행하고, 지점 소재은행은 연구소재 확보와 연구, 보관까지 수행하도록 하고, 지점센터의 데이터와 소재를 거점 은행에 제공하여 네트워크를 구축함으로써 전체적인 소재의 수급과 부족 상태를 파악하고 앞으로의 소재확보를 위한 전략 및 대책을 세울 수 있도록 하는 것이다. 이러한 역할을 통하여 가장 효과적으로 식물소재은행을 운영할 수 있는 방법을 함께 논의하여 공동으로 적용함으로써 연구 소재의 질과 식물소재은행의 운영을 표준화 할 수 있을 것이며 모든 소재은행과 함께 소재의 체계적인 기록 관리를 수행함으로서 소재의 이용과 신뢰성을 확보하고 연구자가 마음 놓고 연구를 수행할 수 있도록 자료를 제공할 수 있도록 함으로서 국가 경쟁력을 제고하도록 노력하고 있다.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2019.04a
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• pp.19-19
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• 2019

전 세계 고등 식물자원은 약 350,000종, 한반도 식물자원은 약 4.500~5,000종 이라고 알려져 있습니다. 2018년 8월부터 국내에도 나고야의정서 발효되어 국내 산학연 연구자들의 해외생물자원 활용을 통한 연구개발에 장벽이 높아졌습니다. 저희 한국생명공학연구원에서는 지난 2001 ~ 2010년 동안 자생식물이용기술개발사업단을 운영하여 국내 유용식물자원을 확보하여 추출물 또는 건조시료 형태로 연구자들에게 분양을 해오고 있습니다. 또한 해외생물소재센터에서는 2006년부터 현재까지 해외 36개 국가와 국제공동연구협약을 체결 하여 ABS 규정에 따라 약 35,000종의 식물자원을 확보해 오고 있습니다. 또한 해외 4개 국가(중국, 베트남, 인도네시아, 코스타리카)에 거점센터를 구축하고 박사급 연구자를 파견하여 열대식물 자원전문가로 양성해오고 있습니다. 4개 거점센터에서는 국내 바이오 기업들의 산업화 지원을 위하여 야생종의 대량재배 시스템 구축 및 원료 표준화 작업을 지원해오고 있습니다. 현재까지 산학연 연구자들에게 누적 3,000,000점(1점 : 20mg)이상의 해외추출물을 분야하여 식물자원을 활용한 연구개발을 지원해 오고 있습니다.