• Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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• 2002.06a
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• pp.64-88
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• 2002

생물체의 유전자 서열들간의 유사성을 서로 비교해보는 일은(sequence alignment)는 분자생물학 연구에서 아주 기본적인 작업에 속한다. 이 작업은 컴퓨터 과학적 입장에서 살퍼보면 일종의 스트링 분석작업인데, 그 과정에는 매우 복잡한 생물학적인 가정이 내포되어 있다. 본 발표의 목적은 크게 두가지인데 하나는 컴퓨터과학 연구자들에게 서열정렬(sequence alignment)이 가지는 분자생물학적 의미에 대하여 개략적인 이해를 돕도록 하는 것이며, 다른 한편으로 분자생물학자들에게는 스트링처리방법을 이용한 서열정렬 문제에서 어떤 기술적인 한계가 있으며 그 한계를 극복하기 위한 새로운 방법론에 대하여 소개하여 컴퓨터과학적 이해의 폭을 넓히는 것이다. 그리고 생물체의 서열정보의 정렬과 매우 유사한 개념으로 각종 선형구조체(linear object)를 추상화 할 수 있른데, 그들간의 유사성도 같은 분자생물학적 방법론을 차용하여 분석할 수 있음을 보인다. 동시에 이것을 이용하여 각종 인터넷 문서나 프로그램, 등의 표절과 무단도용 등을 추적할 수 있는 방법론을 기존의 genomic sequence alignment tool을 차용해서 매우 효율적으로 할 수 있음을 보인다.

• The Microorganisms and Industry
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• v.15 no.2
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• pp.13-19
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• 1989

이제까지 벌견된 SKI 유전자는 SKI2, SKI3, SKI4, SKI6, SKI7, SKI8의 5가지로서 이 중 SKI8만이 cloning된 상태이다. 본연구에서는 SKI3 유전자를 cloning한 후 이 유전자의 염기서열 분석을 통해 SKI3 유전자가 coding하는 단백질의 구조를 밝히고 SKI3 유전자의 killer효모 내에서의 분자생물학적 기능을 밝히고자 하였다.

• Journal of Sericultural and Entomological Science
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• v.38 no.1
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• pp.53-56
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• 1996

To investigate the molecular biological marker in insect cells, BmN-4 and Sf-0 cells were analysed by SDS-PAGE and random amplification of polymorphic DNA. The results showed that the patterns of total cell protein and random amplification of polymorphic DNA were distinguished between BmN-4 and Sf-9 cells, suggesting that the unique major bands were useful as molecular biological marker in BmN-4 and Sf-9 cells.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2022.09a
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• pp.50-50
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• 2022

비짜루과 둥굴레속(Asparagaceae: Polygonatum)은 전 세계적으로 약 90여 종이 알려져 있으며, 유럽, 북아메리카, 아시아 등 북반구 온대 지역에 집중적으로 분포한다. 국내 둥굴레속 분류군은 총 16분류군이며, 이중 잎이 호생하고, 난형에서 타원형 모양의 엽질성 포를 가지며, 화피통 내부에 털이 없고, 수술대 표면에 돌기가 나있는 분류군들은 용둥굴레열(series. Bracteata)에 속한다. 그러나 이들은 종간 교잡 또는 주요 기관의 형질 변이가 다양하여 중간형질을 보이는 개체군들에 대한 종 식별에 많은 어려움이 있었다. 경남 창원시에서 채집된 목포용둥굴레(P. cryptanthum) 변이 개체집단는 기존의 목포용둥굴레와 달리 식물체 높이와 화경·소화경이 길며, 포 부착위치의 변이 폭이 넓으며, 포가 타원형이고 밖으로 말리는 습성으로 형태적 차이가 나타났다. 따라서 본 연구에서는 명확한 분류학적 실체를 구명하고자 분자생물학적 계통분석(nrDNA ITS + cpDNA matK, trnK-rps16, rps16, rbcL) 연구를 진행중에 있다.

• Journal of the Korean Chemical Society
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• v.54 no.4
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• pp.363-373
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• 2010

Computational studies were carried out on the opiates morphine, heroin, codeine, pentazocine, and buprenorphine, under the density functional theory. The geometric parameters of the pharmacophore and substituents were evaluated at the B3LYP/6-31+G(d) level of theory. The electronic structure calculations were performed using the same hybrid functional at the B3LYP/6-311++G (d,p) level of theory. The atomic charges were obtained by Mulliken population analysis. Given the reported biological activity, calculated partition coefficients, and electronic and geometric analysis, pentazocine and buprenorphine were chosen as models for proposed analogues. These analogues were then studied and compared with the model molecules. The study reveals that the geometry and electronic structure of the pharmacophore remains consistent in the presence of different substituents. Because the proposed analogues preserve the studied properties of the model molecules, it is likely that these analogues display biological activity.

• Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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• 2012.05a
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• pp.293-294
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• 2012

최근 매우 빠른 속도로 축적되는 생물학적 데이터를 효과적으로 제공하기 위한 연구들이 활발하게 진행되고 있다. 하지만 기존 연구들은 단순하게 데이터를 수집하고 향후 연구에 활용하기 위한 데이터베이스 구축을 중심으로 진행됐다. 따라서 본 논문에서는 분자마커 등에 대한 데이터베이스의 구축으로 생성한 원천 정보에 대한 효과적인 검색 및 데이터 분석을 제공하기 위해, 고추 분자 마커분석을 위한 웹 서비스를 설계하고 구현한다. 고추 분자 마커 분석을 위한 웹 서비스는 웹 기반 사용자 인터페이스를 이용하여 고추분자 마커에 대해 손쉽게 접근할 수 있는 인터페이스를 제공하며, 사용자에게 분석된 분자 마커에 대한 상세 정보를 제공한다.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2018.04a
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• pp.65-65
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• 2018

복분자(Rubus coreanus Miquel)는 anthocyanin, phenolic acid, tannin, flavonoid, stilbenoid와 같은 생리활성물질이 풍부하게 존재하는 것으로 보고되었으며 항염증, 항암활성, 항산화효과 등 다양한 생리활성에 대한 효능이 있어 건강식품으로써 애용되고 있을 뿐만 아니라 약용성 건강보조식품 등으로 각광받고 있다. 생물전환(Bioconversion)은 미생물 또는 효소의 생물학적 촉매 기반 천연소재의 생리활성 물질기능성, 생체이용률, 안전성을 증대시키기 위한 방안으로 많은 연구가 진행되고 있으며 아울러 식품, 의약품, 화장품 등 다양한 분야에서 활성화 되고 있다. 본 연구는 불가사리 발효액으로부터 유산균을 분리하였으며, 유전학적 특성을 확인하기 위하여 16S rDNA 염기서열을 분석하였다. 전북 고창에서 수확된 복분자를 분말상태로 유산균과 발효공정을 수행하였으며, 복분자의 최적 추출조건 선정과 발효공정 전 후의 활성을 관찰하였다. 발효공정 후 추출물의 기능성 평가를 진행하기 위하여 DPPH radical scavenging activity, total polyphenol 함량을 확인하여 항산화 효능 및 유효성분 함량을 평가하였다. 또한 대식세포인 Raw 264.7을 사용하여 MTT assay, Nitric oxide (NO) 생성 억제 효능을 확인하여 세포독성 및 항염증 활성을 평가하였다. 실험결과, 발효기간이 다른 불가사리 비료발효액으로부터 16 종의 다양한 균주를 확보하였으며, 생물전환 공정에 유용 균주를 선정하기 위하여 복분자 분말의 발효공정을 실시한 결과 3 종의 유산균 처리군에서 무처리군 대비 DPPH radical 소거능 및 polyphenol 함량이 증가됨을 확인하였다. 그 중 가장 우수한 활성을 나타내는 균주를 16S rDNA 염기서열 분석한 결과 Lactobacillus coryniformis A6-4로 확인되었으며, 발효공정 후 항산화 활성은 무처리군 대비 약 115%, polyphenol의 함량은 무처리군 대비 약 121%로 증가됨을 확인되었다. 또한 발효공정 후 독성활성이 감소되는 경향을 확인되었으며, 항염증 활성이 유의적으로 증가됨을 확인하였다.

• 한국생태학회:학술대회논문집
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• 1998.05a
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• pp.108-108
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• 1998

• Proceedings of the Korean Institute of Information and Commucation Sciences Conference
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• 2000.10a
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• pp.328-332
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• 2000

As DNA sequences have been known through the Genome project the techniques for dealing with molecule-level gene information are being made researches briskly. It is also urgent to develop new computer algorithms for making databases and analyzing it efficiently considering the vastness of the information for known sequences. In this respect, this paper studies the association rule search algorithms for finding out the characteristics shown by means of the association between promoter sequences and genes, which is one of the important research areas in molecular biology. This paper treat biological data, while previous search algorithms used transaction data. So, we design a transformed association nile algorithm that covers data types and biological properties. These research results will contribute to reducing the time and the cost for biological experiments by minimizing their candidates.

• Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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• v.4 no.4
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• pp.739-744
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• 2000

As DNA sequences have been known through the Genome project the techniques for dealing with molecule-level gene information are being made researches briskly. It is also urgent to develop new computer algorithms for making databases and analyzing it efficiently considering the vastness of the information for known sequences. In this respect, this paper studies the association rule search algorithms for finding out the characteristics shown by means of the association between promoter sequences and genes, which is one of the important research areas in molecular biology. This paper treat biological data, while previous search algorithms used transaction data. So, we design a transformed association rule algorithm that covers data types and biological properties. These research results will contribute to reducing the time and the cost for biological experiments by minimizing their candidates.