• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2003.05b
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• pp.927-930
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• 2003

Automated sequencer로부터 얻게된 서열은 PCR이나 sequencing의 영향 등으로 기존의 자료 또는 분자생물학자가 원하는 서열과는 조금씩 차이점을 나타내게 되고, 이를 보정하기 위해 수작업으로 처리하게 된다. 이는 아주 간단함 작업임에도 불구하고 30분에서 1시간, 많게는 몇 시간씩 걸리는 불편함을 감수하고 있다. 본 논문에서는 분자 생물학자들이 효율적으로 서열을 분석하게 하는 sequence finishing program의 구현에 관하여 논의하였다.

• The Science & Technology
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• v.33 no.10 s.377
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• pp.80-81
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• 2000

바이오산업 분야에서 국내 최대의 연구성과를 올리고 있는 성창근교수 연구팀. 최근 각종 성인병 예방과 치료에 탁월한 효능을 보이는 '홍버섯쌀'을 국내 최초로 개발했다. 성교수 연구팀은 이런 연구업적을 바탕으로 실험실 벤처기업 (주)대덕바이오를 설립했으며 이 회사를 통해 홍버섯쌀은 곧 시판될 계획이다. 이밖에도 '참맛쌀', '효소과자', '환경정화제', '숙취제거제'등 특허를 신청한 기술이 14개에 이른다.

• Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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• 2002.06a
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• pp.64-88
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• 2002

생물체의 유전자 서열들간의 유사성을 서로 비교해보는 일은(sequence alignment)는 분자생물학 연구에서 아주 기본적인 작업에 속한다. 이 작업은 컴퓨터 과학적 입장에서 살퍼보면 일종의 스트링 분석작업인데, 그 과정에는 매우 복잡한 생물학적인 가정이 내포되어 있다. 본 발표의 목적은 크게 두가지인데 하나는 컴퓨터과학 연구자들에게 서열정렬(sequence alignment)이 가지는 분자생물학적 의미에 대하여 개략적인 이해를 돕도록 하는 것이며, 다른 한편으로 분자생물학자들에게는 스트링처리방법을 이용한 서열정렬 문제에서 어떤 기술적인 한계가 있으며 그 한계를 극복하기 위한 새로운 방법론에 대하여 소개하여 컴퓨터과학적 이해의 폭을 넓히는 것이다. 그리고 생물체의 서열정보의 정렬과 매우 유사한 개념으로 각종 선형구조체(linear object)를 추상화 할 수 있른데, 그들간의 유사성도 같은 분자생물학적 방법론을 차용하여 분석할 수 있음을 보인다. 동시에 이것을 이용하여 각종 인터넷 문서나 프로그램, 등의 표절과 무단도용 등을 추적할 수 있는 방법론을 기존의 genomic sequence alignment tool을 차용해서 매우 효율적으로 할 수 있음을 보인다.

• Prospectives of Industrial Chemistry
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• v.23 no.3
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• pp.42-55
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• 2020

다양한 분석물을 탐지하기 위해 타겟 특이적이며 높은 안정성과 효율을 지닌 화학센서 개발은 화학자들의 숙원이다. 그들의 노력으로 지난 수십 년간 많은 센서들이 개발되었으며 화학, 생물학, 약물학, 생리학, 환경 화학 등 여러 분야에서 응용이 되고 있다. 본고에서는 화학센서 개발의 디자인 원리와 발광 메커니즘(ICT, FRET, PeT, AIE)에 대해 알아보고 최근 개발된 유기·무기분자 기반 탐침과 나노물질 및 고분자를 이용한 센서 동향에 대해 다루고자 한다. 나아가 여전히 존재하는 개발 과제는 어떠한 것들이 있는지 짚어보고, 앞으로 화학센서 개발이 나아갈 방향에 대해 예상해보고자 한다.

• Journal of the Korea Convergence Society
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• v.8 no.1
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• pp.115-121
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• 2017

AHR is a transcription factor activated by aryl hydrocarbons, regulating the expression of XMEs (xenobiotics Metabolizing Enzymes). Even though the role of AHR in human physiology has been intensively investigated for the past decades, our understandings are still largely limited due to the deficiency of adequate chemical agents. In addition, it has been demonstrated that AHR correlates to pathogeneses for some diseases. Furthermore, emerging data suggest that the study on the AHR may provide a valid therapeutic target. Classical antagonists in current use are reported to be partial agonistic whereas a pure antagonist is demanded. In this study, o-toluidinyl ring structure of 2-methyl-4-(2-methylphenyldiazenyl)phenyl picolinamide has been modified into various structures to optimize the AHR antagonistic activity by means of convergence study of organic synthesis and molecular biology.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2001.10b
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• pp.1151-1154
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• 2001

외판원 문제(Traveling Salesman Problem)는 주어진 n개의 도시들과 그 도시들간의 거리비용이 주어졌을 때, 모든 도시들을 정확히 한번씩만 방문하면서 걸린 비용이 최소가 드는 경로를 찾는 문제로 최적해(optimal)을 구하는 것은 전형적인 NP-완전 문제중의 하나이다. 따라서 외판원 문제를 해결하는 다양한 알고리즘들이 개발되고 있다. 특히 요즈음은 실제 생체 분자(bio-molecule)를 계산의 도구로 사용하는 새로운 계산 방법인 DNA 컴퓨팅은 DNA 분자가 잠재적으로 가지고 있는 막대한 병렬성을 이용해서 NP-완전 문제들을 해결하고자 하는 연구들이 땀이 진행되고 있다. 그러나 아직 실제 생체 분자의 특성을 잘 반영하는 계산 모델이나 분자 생물학에서 사용하는 연산들이 많이 개발되지 알아 계산 효율이 비교적 좋지 않다. 따라서 본 논문에서는 외판원 문제를 해결하기 위한 DAN컴퓨팅의 새로운 중합 효소 연쇄 반응(Polymerase Chain Reaction, PCR) 연산을 개발하였다.

• The Korea Journal of Herbology
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• v.24 no.4
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• pp.1-8
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• 2009

Objectives : This study was carried out to discriminate origin and molecular marker of oriental medicine "Cnidii Rhizoma" be circulated between Korea and China, which is difficult to discriminate from morphological distinction because of a fragmental materials of roots. Methods : Materials were collected randomly from a medicinal herb markets in Korea and China and be analyzed with ITS (internal transcribed spacer) regions of nuclear ribosomal DNA (nrDNA). Results : As a results, ITS regions of nrDNA was shown to be identify as three molecular markers. "Cnidii Rhizoma" was made up syster group of the genus Ligusticum L. and divided into three groups with "Tou-chun-gung", "IL-chun-gung" and "China-chun-gung". Conclusions : From the analysis of ITS regions of nrDNA, we presumed that it is the same origin of "Cnidii Rhizoma" from Korea and China because of phylogenetic tree consisted of sister groups with the genus Ligusticum than the genus Cnidium.

• Korean Journal of Biological Psychiatry
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• v.7 no.2
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• pp.115-122
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• 2000

The development of molecular biology has brought many changes in psychiatry. Molecular biology makes us possible to know the cause of mental disorders that provide the way to prevent the disorders, and to develop various accurate diagnostic and treatment methods for mental disorders. The author discusses the concept, cause, and treatment of mental disorders in the aspect of molecular biology. Importing the methods of molecular biology into psychiatry, we can anticipate to get a number of the goals of psychiatric genetics, including identification of specific susceptibility genes, clarification of the pathophysiological processes whereby these genes lead to symptoms, establishment of epigenetic factors that interact with these genes to produce disease, validation of nosological boundaries that more closely reflect the actions of these genes, and development of effective preventive and therapeutic interventions based on genetic counseling, gene therapy, and modification of permissive or protective environmental influences. In addition to their capacity to accelerate the discovery of new molecules participating in the nervous system's response to disease or to self-administered drugs, molecular biological strategies can also be used to determine how critical a particular gene product may be in mediating a cellular event with behavioral importance. Molecular biology probably enables us discover the environmental factors of mental disorders and allow rational drug design and gene therapies for mental disorders, by isolation of gene products that facilitate a basic understanding of the pathogenesis of these disorders. A specific genetic linkage may suggest a novel class of drugs that has not yet been tried. With respect to gene therapy, the hypothetical method would use a gene delivery system, most likely a modified virus, to insert a functional copy of a mutant gene into those brain cells that require the gene for normal function.

• The Korean Journal of Mycology
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• v.49 no.4
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• pp.531-537
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• 2021

Styrax japonicus is a deciduous shrub or a small tree belonging to the family Styracaceae. Since 1990, a rust fungus has continuously been found on S. japonicus leaves across the country. The morphological characteristics of the rust fungus were most consistent with those of Pucciniastrum styracinum reported on Styrax obassia in Japan. The species identification was confirmed by molecular phylogenetic analysis of the internal transcribed spacer and large subunit rDNA sequences. The current study provides mycological information with morphological measurements and molecular phylogenetic data of P. styracinum found on S. japonicus in Korea. Therefore, this is the first confirmed report on the presence of P. styracinum on S. japonicus in Korea.

• Journal of the Korean Society of Radiology
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• v.8 no.3
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• pp.123-136
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• 2014

In this paper, we study to classify molecular imaging and applications to predict future. Molecular imaging in vivo at the cellular level and the molecular level changes taking place to be imaged, that is molecular cell biology and imaging technology combined with the development of the new field. Molecular imaging is used fluorescence, bioluminescence, SPECT, PET, MRI, Ultrasound and other imaging technologies. That is applied to monitoring of gene therapy, cell tracking and monitoring of cell therapy, antibody imaging, drug development, molecular interaction picture, the near-infrared fluorescence imaging of cancer using fluorescence, bacteria using tumor-targeting imaging, therapeutic early assessment, prediction and therapy. The future of molecular imaging would be developed through fused interdisciplinary research and mutual cooperation, which molecular cell biology, genetics, chemistry, physics, computer science, biomedical engineering, nuclear medicine, radiology, clinical medicine, etc. The advent of molecular imaging will be possible to early diagnosis and personalized treatment of disease in the future.