• Title/Summary/Keyword: 변이

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DNA 염기의 토토머화에 의한 염기쌍 변이 연구: 염기쌍의 전이 돌연변이를 중심으로

  • Lee, Yeon-Hui;Lee, Min-Jun;Sin, Seok-Min
    • Proceeding of EDISON Challenge
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    • 2015.03a
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    • pp.99-104
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    • 2015
  • DNA 복제는 굉장한 정확도를 가지고 이루어진다. 하지만 내, 외부적인 여러 요인으로 돌연변이가 일어나기도 한다. 그 중 토토머화에 의해 치환 돌연변이가 일어난다는 가설은 오래전부터 그 가능성이 논의되어 왔고, 직접적인 증거를 찾으려는 노력도 있어 왔다. 토토머화에 의하여 DNA염기가 다른 형으로 변하면 왓슨-크릭 염기쌍 (아데닌-타이민, 시토신-구아닌이 수소결합한 염기쌍)이 아닌 다른 염기쌍이 생성될 수 있다. 이 염기쌍이 기준이 되어 DNA가 복제되기 때문에 결과적으로 전이 돌연변이(transition), 혹은 전환 돌연변이(transversion)된 염기쌍이 생성될 수 있다. 우리는 이런 사례 중에 염기쌍의 전이 돌연변이를 중심으로 연구하고자 한다. A-T염기쌍중 하나가 지배적인 아민형(amine form)이 아니라 이민형(imine form)으로 존재할 때 아민형과는 다른 수소결합이 가능해지며 보통 잘 생성되지 않는 A-C, G-T결합이 생성될 수 있다. 이후 그 염기쌍이 기준이 되어 DNA가 복제될 때에는 왓슨-크릭 염기쌍이 주로 생성되어 A-T염기쌍이 G-C 염기쌍으로 치환되는 DNA가닥이 생기게 된다. 우리는 이러한 과정을 에너지와 반응속도 측면에 집중하여 분석해보았다. 계산 결과, $A-C^*$, $A^*-C$, $G-C^*$, $G^*-C$의 염기쌍 생성이 왓슨-크릭 염기쌍과 비슷하거나 더 큰 정도로 에너지 면에서 유리하였으며 대부분의 돌연변이가 에너지 측면에서 보았을 때 $A-C^*$ 염기쌍을 통하여 생김을 알 수 있었다. 계산된 값은 약 $10^{-6}$ 정도의 빈도를 보였다.

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Variation of the Axillary Arch in Korean Cadaver (한국인 시신에서 랑거겨드랑활의 변이)

  • Jeong, Hyun-Seok;Jo, Seong-Woo;Lee, Jae-Ho
    • Anatomy & Biological Anthropology
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    • v.31 no.4
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    • pp.167-170
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    • 2018
  • Axillary arch is relatively common variation of muscle in the axilla. There were several attentions on axillary arch due to its anatomical and surgical importance. During educational dissection, a variant muscle was found in right arm of 68-year-old female cadaver. The variation of muscle originated from the lateral edge of the latissimus dorsi muscle as muscular form. And then, it crossed the axillary artery and median nerve as tendinous form. Finally it became wide as muscular form and inserted into the pectoralis major. We reported this variant muscle and discussed its clinical significances.

Optimization of the Coupling and the Reflector Material in the DOI PET Detector Module using the WLS Fiber (파장변이섬유를 사용하는 반응 위치 측정 양전자방출 단층촬영기기 검출기 모듈의 연결물질과 반사체 물질의 최적화)

  • Lee, Seung-Jae
    • Journal of the Korean Society of Radiology
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    • v.13 no.1
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    • pp.15-20
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    • 2019
  • We developed a novel depth-of-interaction positron emission tomography (PET) detector using wavelength shifting (WLS) fibers and optimized it. The optimization module was designed by using two scintillators and three WLS fibers and attaching a sensor to the end of the WLS fiber. Optimum combinations were obtained through the light collection efficiency and the light collection ratio between sensors depending on coupling materials and reflectors of scintillators, WLS fibers and sensors. The highest light collection efficiency and the light collection ratio between sensors were obtained in the combination of the epoxy (coupling materials)-diffuse reflector (scintillators)-specular reflector (WLS fibers).

하천변 침수 위험정보 구축을 위한 기초 연구

  • Kim, Jeong Yup;Sung, Jang Hyun;Choi, Hyuk Joon;Park, Sang Geun;Kim, Yang Su
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2016.05a
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    • pp.244-244
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    • 2016
  • 과거부터 지금까지 극한강수의 증가경향이 지속되어 미래에도 극한강수의 규모는 증가하고 빈도 또한 잦아지리라 전망되고 있으며, 특히 짧은 지속시간을 갖는 극한강수(국지성 호우)의 증가 경향이 확연한 편이다. 4대강 살리기 사업 이후 하천에 대한 접근성이 향상되어 하천의 기본 목적과 함께, 하천변의 친수지구로써의 활용이 증대되고 있다. 이렇듯 자연(기후) 및 사회환경 변화로 본류 보다는 작은 규모의 지류하천에 홍수위험도가 증가하겠고, 본류도 고(高)수위 보다는 하천변의 침수가 잦아지리라 전망된다. 홍수통제소는 변화하는 환경에 대응하기 위하여 '홍수예보지점의 확대', '홍수정보의 다양화'을 추진하고 있다. '홍수예보지점의 확대'를 통하여 현재 본류 중심의 홍수관리를 지류까지 확대하고, '홍수정보의 다양화'로 하천변(친수지구) 사용자가 요구하는 정보 컨텐츠를 발굴, 제공하여 홍수예보 및 홍수정보에 대한 맞춤형 서비스를 도입하고 있다. 따라서, 이 연구에서는 수요자 중심의 정보제공을 위하여 이용자가 많은 하천 시설물의 현황을 파악하여 현장조사 및 측량을 실시하였고, 측량결과를 바탕으로 친수지구의 위험이 예상되는 관심수위를 지정하였다. 연구결과, 하천변 용도별 현장조사, 위치, 고도 등이 포함된 DB가 구축되었고, 현장 측량으로 정해진 하천변 침수 관심수위의 재현정도를 조사하여 정보제공이 시급히 요구되는 지점을 결정하였다. 향후 이 결과를 기초로 하여 지형 및 하천특성 등을 추가 수집하고, 취약 구간에 대한 정보 제공 방안을 정형화하여 하천변 홍수피해의 최소화를 하고자 한다.

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Stereo-To-Multiview Conversion System Using FPGA and GPU Device (FPGA와 GPU를 이용한 스테레오/다시점 변환 시스템)

  • Shin, Hong-Chang;Lee, Jinwhan;Lee, Gwangsoon;Hur, Namho
    • Journal of Broadcast Engineering
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    • v.19 no.5
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    • pp.616-626
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    • 2014
  • In this paper, we introduce a real-time stereo-to-multiview conversion system using FPGA and GPU. The system is based on two different devices so that it consists of two major blocks. The first block is a disparity estimation block that is implemented on FPGA. In this block, each disparity map of stereoscopic video is estimated by DP(dynamic programming)-based stereo matching. And then the estimated disparity maps are refined by post-processing. The refined disparity map is transferred to the GPU device through USB 3.0 and PCI-express interfaces. Stereoscopic video is also transferred to the GPU device. These data are used to render arbitrary number of virtual views in next block. In the second block, disparity-based view interpolation is performed to generate virtual multi-view video. As a final step, all generated views have to be re-arranged into a single image at full resolution for presenting on the target autostereoscopic 3D display. All these steps of the second block are performed in parallel on the GPU device.

Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Analysis of the Lisianthus (Eustoma grandiflorum Shinn.) Variants Obtained during Tissue Culture (꽃도라지(Eustoma grandiflorum Shinn.) 조직배양시 발생한 변이체의 RAPD 분석)

  • Cheong, Chang Ho;Yu, Kee Won;Paek, Kee Yoeup
    • Horticultural Science & Technology
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    • v.17 no.3
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    • pp.352-354
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    • 1999
  • Randomly and specifically amplified polymorphic DNA band patterns based on polymerase chain reaction (PCR) analysis were used to assess genetic variation of somaclonal variants obtained from tissue culture of lisianthus (Eustoma grandiflorum). Five different types of variant were classified by morphological characters such as leaflet number, leaf shape, caulicle length, plant height, and leaf area. Five primers out of 20 primers (10 mer) resulted in 34 random amplified DNA fragments with polymorphisms (64.7%) in all tested plants. The dissimilarity coefficient was from 0.71 to 0.91 by UPGMA cluster analysis. Based on the presence of polymorphic bands, normal plant and five somaclonal variants were divided into two groups at the similarity coefficient value of 0.79.

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Year-dependent variations of organic acid contents in pre-matured fruits of 175 Korean Prunus mume landraces. (국내 수집 매실유전자원의 청매실 함유 유기산 함량의 연차 변이)

  • Gwak, Bo-Kyeong;Eom, Soyeong;Wimonmuang, Kanphassorn;Kang, Hee-Kyoung;Lee, Young-Sang
    • Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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    • 2018.10a
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    • pp.115-115
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    • 2018
  • 매실나무(Prunus mume)의 풋과일인 매실은 피로회복, 소화촉진, 살균 및 항균작용 등 다양한 생리활성을 갖고 있다. 본 연구는 국내 수집 매실 유전자원 172점의 핵심 기능성 물질인 유기산의 함량 특성을 평가하고자 2017년과 2018년 2년간 청매실을 수확하여 옥살산(OA), 사과산(MA), 구연산(CA)의 함량을 HPLC를 이용하여 분석하고 그 연차 변이를 평가하였다. 전체 유전자원 매실의 2년간 총유기산(TA) 함량은 평균 5.5% (최소 3.9%-최대 7.8%)이었으며, MA와 CA 및 OA의 평균 함량은 각각 2.7%, 2.8%, 0.1%였다. 대상 자원 내 유기산별 함량 변이는 CA (RSD=30%)가 MA (RSD=21%)보다 높게 나타났다. 2018년산 매실은 2017년산에 비교할 때 MA와 OA는 함량이 낮아 연차 변이가 인정되었으나 CA는 차이가 없었다. 비록 연차 변이는 있었으나 유전자원별 함량은 MA와 CA 및 TA에서 모두 2017년산과 2018년산간 정의 상관이 인정되어 유기산 함량이 높고 낮은 자원의 특성은 유지됨을 알 수 있었다. 대상 유전자원 중 TA함량이 가장 높았던 자원은 구산매, 용흥흥매, 상금백옥매 등이었으며, 함량이 낮은 자원은 한산매, 지곡매 등이었다. 상기 결과를 통해 매실 유기산 함량관련 국내 매실 유전자원의 유전적 다양성과 연차 변이의 영향을 평가할 수 있었다.

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Evaluation of Axial Strains of Reinforced Concrete Columns (철근콘크리트 기둥의 축방향 변형률 평가)

  • Lee, Jung-Yoon;Kim, Min-Ok;Kim, Hyung-Beom
    • Journal of the Korea Concrete Institute
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    • v.25 no.1
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    • pp.19-28
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    • 2013
  • The longitudinal axial strain in the plastic hinge region of reinforced concrete (RC) columns influences on the structural behavior of RC structures subjected to reversed cyclic loading. This strain decreases the effective compressive strength of concrete and increases the lateral displacements between stories by causing the elongation of member length. This paper investigated the effects of the axial force on the elongation of a RC member by using a sectional analysis of RC members. The analytical and experimental results indicated that the axial force decreased the axial strain in the plastic hinge region of RC columns. In this study, a model was proposed to predict the axial strain of RC columns. The proposed model considering the effects of axial force ratio consisted of three path types ; Path 1-loading region, Path 2-unloading region, and Path 3-reversing cyclic loading region. The axal strains predicted by the proposed model were compared with the test results of RC columns with various axial force ratios, and agreed reasonably with the observed longitudinal strains.

Stereoscopic Sequence Coding Using MPEG-2 MVP (MPEG-2 UP를 이용한 스테레오 동영상부호화)

  • Bae, Tae-Min;Park, Jin-U;Lee, Ho-Geun;Ha, Yeong-Ho
    • Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea SP
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    • v.38 no.4
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    • pp.353-361
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    • 2001
  • A new stereoscopic codec. structure using MPEG-2 multiview profile is presented in this paper. In the suggested codec., the left image is coded with motion estimation in the base layer and the right image is coded with disparity estimation in the enhancement layer. Since it is possible to calculate rough motion of the right image sequence with disparity and motion of the left image sequence, motion compensation of the enhancement layer is performed without motion estimation. To apply this mathod to MVP codec., the prediction mode of base layer and enhancement layer is restricted, and B picture mode in the base layer is removed. Since the proposed codec. does not perform motion estimation in the enhancement layer encoding and prediction mode of base layer is restricted, it's structure is simple and reduces the encoding time. We compared the SNR of encoded image with three different structured codec., and the experimental results show suggested codec. have comparable result.

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Numerical Taxonomy of Cirsium japonicum Complex(Asteraceae) in Korea (한국산 엉겅퀴군(국화과) 식물의 수리분류학적 연구)

  • Song, Mi-Jang;Kim, Hyun
    • Korean Journal of Plant Taxonomy
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    • v.36 no.4
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    • pp.279-292
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    • 2006
  • Patterns of morphological variation in Cirsium japonicum complex were examined using numerical analysis, and the delimitation of taxa was evaluated. Principal components analysis of taxa using 24 morphological characters and 11 leaf characters revealed the presence of two major groups; C. japonicum var. japonicum and C. japonicum var. spinosissimum. Circium japonicum f. nakaianum could be included in the category of C. japonicum var. japonicum. In conclusion, Korean C. japonicum complex was composed of two varieties and one form, C. Japonicum var. japonicum, C. japonicum var. spinosissimum, and C. japonicum var. spinosissimum f. alba.