• 정보처리학회논문지D
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• 제19D권1호
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• pp.21-28
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• 2012

모노머 단백질의 상호작용 사이트 예측은 기능을 알지 못하는 단백질에 대해서 이것과 상호작용하는 단백질로부터 기능을 예측하거나 단백질 도킹을 위한 검색 공간의 감소에 중요한 역할을 한다. 그러나 상호작용사이트 예측은 대부분 단백질 상호작용이 세포 내에서 순간적 반응에 일어나는 약한 상호작용으로 실험에 의한 3차원 결정 구조 식별의 어려움이 따르며 이로 인해 3차원의 복합체 데이터가 제한적으로 양산된다. 이 논문에서는 모노머 단백질의 3차원 패치 계산을 통하여 구조가 알려진 복합체의 상호작용사이트와 비상호작용사이트에 대한 패치 속성을 추출하고 이를 기반으로 Support Vector Machine (SVM) 분류기법을 이용한 예측 모델 개발을 제시한다. 타겟 클래스의 데이터 불균형 문제 해결을 위해 under-sampling 기법을 이용한다. 사용된 패치속성은 2차 구조 요소와 아미노산 구성으로부터 총 9개가 추출된다. 147개의 단백질 복합체에 대해서 10 fold cross validation을 통해서 다양한 분류모델의 성능 평가를 하였다. 평가한 분류 모델 중 SVM은 92.7%의 높은 정확성을 보이고 이를 이용하여 분류 모델을 개발하였다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2003년도 봄 학술발표논문집 Vol.30 No.1 (A)
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• pp.94-96
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• 2003

차세대 통신에서는 컴퓨터자원들이 지속적으로 대용량화 고속화되는 추세이며 특히 생명공학, 유전공학, 유체역학 기상기후 예측 동 여러 과학 분야에서 단일자원으로는 제공하기 힘든 계산 및 저장자원을 요구 하고 있다. 이러한 문제를 해결하기 위해서 지리적으로 분산 되어있는 자원들을 연결하여 마치 단일 차원을 사용하는 것처럼 해주는 서비스인 그리드가 대두 되었다. 그러나 그리드 사용자가 작업을 수행시키기 위해서는 자신의 DN(Distinguished Mame)을 Remote Machine상에 Local User Account를 바인딩 시켜줘야 한다. 따라서 각 사이트 관리자는 그리드 서비스를 제공하기 위해 수많은 그리드 사용자의 DN과 Local User Account를 바인딩 처리를 해 주어야 한다. 그러나 사실상 현실적으로 불가능하다. 이러한 문제를 해결하기 위해서 본 논문에서는 그리드 사용자에 대한 정책기반 접근 제어 시스템을 설계 및 구현했다.