• Title/Summary/Keyword: 바이오 칩

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Toxicogenomic Analysis of Bacteria and Medaka Fish in Response to Environmental Toxic Chemicals

  • Gu Man-Bock
    • Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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    • 2006.02a
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    • pp.116-123
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    • 2006
  • 생물체의 cDNA를 유리기판위에 고밀도로 첨착 시킨 유전자 칩과 정량적인 방법으로 개별 유전자 발현을 진단 가능한 Real- time PCR (실시간 고분자중합연쇄반응 기술) 기법은 첨단 의학분야와 신약개발 및 독성유전체 연구분야에 활발히 도입되고 있는 기술이다. 본 발표의 첫 번째 부분에서는 유전자칩 에서 얻어진 유전자 발현패턴분석에 기반한 바이오마커 선정 및 real time PCR에 의한 확증 관련 기술 과 유전자칩에서 얻어지는 수많은 데이터를 재정렬 및 다양한 분석기법과 display기술을 활용하여 광범위한 화학물질에 대한 독성효과 분석을 가능하게 해주며, 특정 독성물질에 대한 관련유전자 그룹 발견 및 독성영향에 따른 분류방법에 관한 결과를 발표할 것이다. 또한 바이오마커 활용의 하나로 박테리아세포 기반 바이오센서 제작및 세포칩 개발등에 대한 결과도 추가될 것이다. 두 번째 부분에서는 non-model organism(유전체정보가 확보되지 않은 생물체)인 송사리를 이용하여 새로운 2K 유전자칩을 개발하고, 여기서 각종 화학물질에 대하여 얻어진 수많은 유전자칩 분석 데이타를 활용하여 각각의 화학물질이 보여주는 독성효과를 매우 효과적이고 쉽게 이해할 수 있는 display기술을 개발, 적용함으로써 유전자칩 발현에 기반한 화학물질 독성 screening 및 specificity discrimination을 가능케 하는 예가 발표될 것이다. 이 연구에서 개발한 송사리 유전자칩은 간조직의 RNA를 직접 cDNA화 하는 방식을 취하고 있어 전체 송사리의 유전정보를 필요로 하지 않아 비용 및 효율에서 전체 송사리의 유전정보를 얻는 비용과 노력을 취하지 않고 간에서 발생하는 독성학적 영향 및 유전자의 발현정도를 정밀하고 효율적인 방법으로 얻어 낸다. 현재 2000여개의 cDNA유전자중 50%이상의 유전자가 17베타에스트라디올, 페놀, 노닐페놀, 비스페놀, 감마레이조사, 잔류약품중 이보프란, 다이클로펜악, 농약중의 파라???R, 돌연변이 유발물질 중의 이티비알, 금속류중의 카드뮴을 통해 발현양상과 특정 캐미칼별 발현 특이성이 조사되었고, 이들 유전자는 염기서열 분석을 통해 염기서열이 분석되었으며, 미국 NCBI의 유전자 은행과의 비교를 통해 일부유전자는 새로운 유전자로 밝혀지고 있다. 또한 이 발표에서는 소염진통제계열 의약품인 dichlofenac 이 송사리의 각종 조직에 미치는 독성영향을 Real-time PCR을 이용하여 대표적 스트레스 유전자의 발현에 미치는 영향에 대한 분석 예가 발표될 것이다.

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The Developement of Liver cancer Vital Sign Information Prediction System using Aptamer Protein Biochip (압타머 단백질 바이오칩을 이용한 간암 진단 생체 정보 예측 시스템 개발)

  • Kim, Gwang-Jun;Lee, Hyoung-Keun
    • The Journal of the Korea institute of electronic communication sciences
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    • v.6 no.6
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    • pp.965-971
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    • 2011
  • As the liver cancer in our country cancerous occurrence frequency to be the gastric cancer in the common cancer, If the case which will be discovered in early rising the treatment record was considered seriously about under the early detection. The system which it sees with the system for the early detection of the liver cancer reacts the blood of the control group other than the patient who is confirmed as the liver cancer and the liver cancer to the biochip and aptamer protein biochip profiles mechanical studying leads and it is a system which it classifies. 1149 each other it reacted blood samples of the control group other than the liver cancer patient who is composed of the total 85 samples and the liver cancer which is composed of 310 samples to the biochip which is composed with different oligo from the present paper and it was a data which it makes acquire worker the neural network it led and it analyzes the classification efficiency of the result 95.38 ~ 97.95% which it was visible.

Creating Highly Sensitive and Selective Biochip Sensors for the Detection of Organophosphorus/carbamate Pesticides (고감도 및 고선택성의 유기인계/카바메이트계 농약 검출용 바이오칩 센서)

  • Sim, Hyerim;Kim, Suhee;Lee, Jaeyoung;Lee, Hye Jin
    • Applied Chemistry for Engineering
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    • v.20 no.6
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    • pp.571-580
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    • 2009
  • Biochip sensing technologies offering in-situ, fast and real-time measurements in addition to portability can be powerfully utilized in a wide spectrum of research areas including environmental science, food science, medical diagnostics and drug development. In this article, we introduce current research trends and economic aspects of the development of various optical biochip technologies for the analysis of organophosphorus/carbamate pesticides in environmental samples, which is of global importance with serious consequences for both current and future generations. In particular, we will highlight recent efforts made in the creation of highly sensitive and selective optical biochip sensors in conjunction with nanobiotechnologies and microfabrication for the rapid detection of organophosphorus/carbamate pesticides.

감염성 질환의 진단을 위한 BioMEMS 연구개발 동향

  • Lee, Jin-Gi;Byeon, Do-Yeong
    • Journal of the KSME
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    • v.52 no.8
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    • pp.46-50
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    • 2012
  • BioMEMS(Micro Electro Mechanical System)기술은 MEMS 기술을 바이오 분야에 적용함으로써 극소량의 체액(피 타액 등)으로 각종 진단 검사를 신속하게 처리할 수 있어, 기존 중대형 의료기기의 소형화, 고기능화 및 저렴화가 가능하게 하는 기술이다. 최근 유전자 정보가 규명되면서, 정보통신기술과 접목이 더욱 가속화되고 있고, 인간의 유전자 정보를 활용한 새로운 의약품 개발과 유전자 진단기기나 의료 시술이 눈부시게 발달하고 있다. 이 글에서는 바이오칩에서 큰 주목을 받고 있는 분야인 랩 온 어 칩, 특히 감염질환인 인플루엔자 등의 진단을 위한 연구 동향을 살펴본다.

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Variation of Adenosine tri-Phosphate(ATP) in Fermentation-Extinction of Food Wastes with Wood Bio-Chip (목질바이오칩에 의한 음식물쓰레기 발효-소멸반응에서의 아데노신3인산의 변화)

  • Oh, Jeong-Ik
    • Journal of Korean Society of Environmental Engineers
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    • v.32 no.4
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    • pp.363-368
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    • 2010
  • The overall indicator of microbial activity in the fermentation-extinction reaction of food waste by using bio wood-chips were investigated by considering adenosine tri-phosphate(ATP). Degradation rate of organic compounds, which was represented by chemical oxygen demand(COD) and total nitrogen(TN), was increased with the concentration of adenosine tri-phosphate during fermentation-extinction reaction of food waste by using bio-wood chips. With this view, the ATP would be one of the overall evaluation indicator of organic degradation in the species of bio-wood chip for the fermentation-extinction of food waste.

Technology Level Evaluation Based On Technology Growth Model and Its Implication - In Case of 'Biochip and Biosensor Technology' (기술성장모형에 기반을 둔 기술수준평가 결과 및 시사점 - 바이오칩.센서기술을 중심으로)

  • Han, Min-Kyu;Kim, Byoung-Soo;Ryu, Ji-Yeon;Byeon, Soon-Cheon
    • Journal of Korea Technology Innovation Society
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    • v.13 no.2
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    • pp.252-281
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    • 2010
  • In this paper, we analyze the result of the Technology Level Evaluation of 'Biochip and biosensor (BB) Technology' consisted of 3 sub-categorized technologies; biochip sensing (BS), lab on a chip and high-efficient customized health care technology. As an analysis tool, authors used a delphi (a repeated survey) and dynamic methodology with technology growth model to overcome limits of previous evaluations. As a result, levels of BB were evaluated 51.5% (Korea) and 75.1% (US), and the technology gap between two countries was 6.1 yrs. In 2013, these levels were expected to change to 60.1% (Korea), 78.4% (US) and 4.3 yrs, respectively. In comparison with other biotechnology, the gap of BB was smaller and expected to catch up with US faster. In the case of sub-categorized technologies, they showed the smallest gap and would have faster catch-up speed than other sub-categorized technologies in the Biotechnology field. Based on the result of the survey, relative superiority of BB in Korea was originated from competent researchers and research fund, but weak basic science would be weak points. We think that BB's characteristic as an emerging technology and concentrated research activities on BB are additional strong points. This research proposes the supporting and supplemented points to promote the BB in Korea.

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생체 신호 처리용 칩 기술 동향

  • Lim, Shin-Il
    • Review of KIISC
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    • v.17 no.1
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    • pp.38-46
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    • 2007
  • 유비쿼터스 네트워크(u-network)를 통해 u-health의 개념이 실현됨에 있어 생체 신호를 최초로 측정, 처리하는 부분의 생체 신호 측정용 칩들에 대한 최근 기술 개발 동향을 기술하였다. 이러한 추세에 맞추어 여러 가지 핵심 기술들이 부상하고 있지만, 본 기고에서는 이러한 시스템의 최종 하위 계층, 즉 단말기 등의 부분에 적용되는 bio 관련 시스템 반도체 칩(SoC : system-on-a-chip)에 대해 기술한다. 바이오 칩 중, 기존의 광을 사용하지 않고 값 싸게 구현 할 수 있는 CMOS 기반의 DNA 칩 개발 동향을 살펴보았으며, 신약 개발이나 치료에 사용할 수 있도록 신경 신호 전달을 검출할 수 있는 신경 신호 전달 측정 칩들의 기술 개발도 살펴보았다. 개인의 의료 생체정보를 모니터링 할 수 있도록 심전도, 근전도, 뇌파, 산소포화도, 체지방 등을 측정할 수 있는 의료용 칩들의 개발 현황도 살펴보았다.