• Title/Summary/Keyword: 바이오 칩

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Particle Swarm Optimization Clustering Algorithm for cluster DNA Chip data (바이오칩 데이터의 군집화를 위한 Particle Swarm Optimization Clustering 알고리즘)

  • Meang, Bo-Yeon;Choi, Ok-Ju;Lee, Yoon-Kyung;Lee, Min-Soo;Yoon, Kyong-Oh;Choi, Hye-Yeon;Kim, Dae-Hyun;Lee, Keun-Il
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2008.06c
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    • pp.60-63
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    • 2008
  • 바이오칩을 이용하여 유전자를 분석하는데 이때 바이오 칩 분석 시스템을 이용한다. 바이오 칩은 유전자와 실험의 두 축으로 이루어져 있으며 바이오 칩 분석 시스템을 사용하여 바이오 칩에서 자료를 추출하고 필요한 정보를 얻기 위해 데이터를 분석하는 시스템이다. 데이터를 분석하는 기법 중 클러스터링을 사용하는데 유사한 유전자들을 찾아 내어 정해놓은 클러스터로 정의한다. 같은 클러스터 안에 있는 유전자들은 서로 비슷한 성질을 가지고 있기 때문에 사용자들은 이 바이오 칩 으로부터 나온 정보를 효율적이게 사용할 수 있다. 더욱 효율적으로 사용하기 위해 본 논문에서는 방대한 양의 데이터의 최적화에 효율적인 생태계 모방 알고리즘 Particle Swarm Optimization을 이용하여 데이터들을 클러스터링을 하여 분류하는 시스템을 기술하고 있다.

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최신특허 동향 바이오칩

  • 이한영
    • BT NEWS
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    • v.11 no.2
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    • pp.35-40
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    • 2004
  • ‘바이오칩(biochip)’ 이란 컴퓨터 칩(computer chip)에서 유래되어 바이오(bio)와 관련된 어떤 집적회로의 요소와 관련된 용어로 지칭되어 왔으나, 최근 몇년 동안 기술개발이 구체으로 이루어 지면서, DNA를 포함한 생체분자(biomolecule)에 대하여 생화학적 분석에 사용되는 프로브(probe)를 정렬(array)시킨 물질 및 장치라고 정의되고있다.(중략)

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Evaluation of Fermentation Extinction Rate of Food Waste according to the Various Types of Wood Chip with Different Pore Structures (목질세편 세공구조에 따른 음식물쓰레기의 발효·소멸효율 평가)

  • Oh, Jeong-Ik;Kim, Hyo-Jin
    • Land and Housing Review
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    • v.3 no.3
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    • pp.299-305
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    • 2012
  • Various types of bio wood chip for fermentation-extinction of food waste was investigated by comparing their different pore structure with the performance of weight loss rate and microbial activity. The fermentation-extinction of food waste with bio wood chip was examined by adding 700~1,500g of food waste every day during 15 days to the fermentation-extinction reactor with condition of $30{\sim}50^{\circ}C$ temperature and 30~70% humidity, where 1,500g of bio wood chips were existed. The bio wood chips used in this experiment were categorized into 4 different types; microbial-mixing type(A biochip), macro pore type(B biochip) under $2{\mu}m$ of pore size, micro pore type of wood-chips(C biochip) under $0.1{\mu}m$ of pore size, viscous & sticky type(D biochip). As a result, A, B, C, D bio wood chip exhibited 85%, 63%, 92%, 73% weight loss of food waste with fermentation-extinction. The maximum weight loss of food waste was obtained at the fermentation-extinction experiments by using C bio wood chip. On the other hands, the maximum ratio of ATP to COD and TN was obtained from $3.00{\times}10^{-10}$ and $2.31{\times}10^{-11}$ in the case of C bio wood chip, comparing with other types of bio wood chip. Consequently, the performance of weight loss rate was affected with the micro pore structure of bio wood chip which have an advantage of extensive microbial activity space in the fermentation-extinction of food waste.

Characteristics of the Gasification from Mixed Fuels of Charcoal and Undried Woodchip (미건조 우드칩과 숯 혼합에 따른 가스화 특성 분석)

  • Wang, Long;Kang, Ku;Lee, Tae Ho;Choi, Sun Hwa;Hong, Seong Gu
    • Journal of The Korean Society of Agricultural Engineers
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    • v.57 no.5
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    • pp.81-88
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    • 2015
  • 바이오매스는 유망한 신재생 에너지이다. 바이오매스는 액체 및 기체 연료로 전 환 할 수 있고, 다양한 공정을 통해 열 및 전력을 생산시키는데 사용된다. 바이오매스 가스화 공정은 바이오매스를 일산화탄소, 이산화탄소, 수소 및 메탄으로 이루어진 합성 가스로 전환시키는 기술이다. 바이오매스를 이용한 합성 가스 생산 및 활용은 세계적으로 늘어나는 에너지 필요성을 충족시킬 수 있는 대체에너지이다. 현재, 바이오매스 가스화의 주요 원료는 목질계 우드 칩을 주로 사용하고 있지만, 일반적으로 우드칩의 경우 수분을 다량 함유하고 있기 때문에 가스화 공정을 위해서는 별도의 건조처리를 필요로 한다. 우드칩의 건조에는 많은 에너지가 소요되고, 다량의 우드칩 건조에는 시간과 기상 및 공간적인 환경에 영향을 받는다. 본 연구에서는 미건조 우드칩의 가스화 공정을 위하여 미건조 우드칩에 숯을 각각 10, 30, 50 % 비율로 혼합하여 실험을 수행하였고, 실험결과 생산된 합성가스의 CO 농도 는 숯의 비율에 따라 14.9 ~ 25.6 % 증가되는 경향을 나타내었지만, 반대로 $CO_2$$CH_4$ 농도는 감소하였다. 이에 따라 합성가스 생산을 위한 미건조 우드칩과 숯의 최적혼합비율은 약 30 %로 판단되며, 발열량은 $1285.7kcal/Nm^3$, Gas yield는 $2.3Nm^3/kg$ 로 나타났다. 이에 적절한 숯의 혼합사용은 미건조 우드칩의 직접적인 가스화에 도움이 될 것으로 사료되며, 바이오매스 건조 공정에 필요한 에너지를 절약할 수 있을 것으로 판단된다.

첨단과학기술현장 - 바이오칩이 몰고오는 의료혁명

  • Hyeon, Won-Bok
    • The Science & Technology
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    • v.30 no.9 s.340
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    • pp.43-48
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    • 1997
  • 21세기 초, 기침환자를 맞은 의사는 먼저 환자의 목구멍에 면봉을 넣은 다음 면봉에 묻은 무수한 미생물의 유전자를 바이오칩으로 점검한다. 5~6분 뒤 바이오칩은 기침의 '범인'을 밝히고 이 미생물이 특정한 항생제에 저항하는 유전자를 갖고 있는가의 여부도 가려낸다. 그래서 의사는 환자 개개인에게 정확하게 들어맞는 약을 처방할 수 있다.

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Clustering and Classifying DNA Chip Data using Particle Swarm Optimization Algorithm (Particle Swarm Optimization 알고리즘을 이용한 바이오칩 데이터의 군집화 및 분류화 기법)

  • Lee, Yoon-Kyung;Yoon, Hye-Jung;Lee, Min-Soo;Yoon, Kyong-Oh;Choi, Hye-Yeon;Kim, Dae-Hyun;Lee, Keun-Il;Kim, Dae-Young
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2007.10c
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    • pp.151-154
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    • 2007
  • 바이오 칩 분석 시스템은 다양한 종류의 바이오칩에서 자료를 추출하고 유용한 정보를 얻기 위해 데이터를 분석하는 시스템이다. 데이터를 분석하는 다양한 기법 중 대표적인 것이 클러스터링과 분류화(classification)이다. 클러스터링은 비슷한 개체들을 한 집단으로 묶는 방법이고, 분류화는 미리 정해진 클래스에 데이터를 해당하는 클래스로 분류하는 기법이다. 다양한 알고리즘을 통해서 데이터를 클러스터링 및 분류화를 할 수 있는데 바이오칩과 같이 데이터의 양이 방대한 경우는 생태계를 모방한 알고리즘을 적용하는 것이 효율적이다. 본 논문에서는 생태계 모방알고리즘 중 하나인 PSO 집단 알고리즘을 사용하여 바이오칩 데이터로부터 클러스터의 중심을 찾아 클러스터링을 하교, 분류 규칙을 발견하여 이를 바이오 데이터에 적용, 분류해 주는 시스템을 기술하고 있다.

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Intelligent silicon bead chip design for bio-application (바이오 응용을 위한 지능형 실리콘 비드 칩 설계)

  • Moon, Hyung-Geun;Chung, In-Young
    • Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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    • v.16 no.5
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    • pp.999-1008
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    • 2012
  • Unlike the existing CMOS chip, ISB (Intelligent Silicon Bead) is new concept biochip equipped with optical communication and memory function. It uses the light for power of SoC CMOS and interface with external devices therefore it is possible to miniaturize a chip size and lower the cost. This paper introduces an input protocol and a design of the low power and the low area to transfer the power and the signal through a single optical signal applied from external reader device to bead chip at the same time. It is also verified through simulation and measurement. In addition, low-power PROM is designed for recording and storing ID of a chip and it is successful in obtaining the value of output according to the optical input. Through this study, a new type biochip development can be expected by solving high cost and a limit of miniaturizing a chip area problem of an existing RFID.

Nano-Bio Surface Analysis

  • Lee, Tae-Geol
    • Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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    • 2013.02a
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    • pp.88-88
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    • 2013
  • 최근 각광을 받고있는 나노바이오 질량이미징 분석법의 측정원리를 이해하고, 세포/생체조직/생체샘플/바이오칩의 측정결과를 바탕으로 핵심측정 능력을 파악하여 각자의 연구에 적용 가능성을 탐색할 수 있는 역량을 배양하고자 한다.

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