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평행좌표 플롯을 활용한 유전자발현 자료의 시각화 (Applications of Parallel Coordinate Plots for Visualizing Gene Expression Data)

  • 박미라;곽일엽;허명회
    • 응용통계연구
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    • 제21권6호
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    • pp.911-921
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    • 2008
  • 유전자발현 자료로터 유용한 생물학적 정보를 얻기 위해 여러 시각화 방법이 개발되어 왔다. 본 논문에서는 평행좌표 플롯(parallel coordinate plot: PCP)을 이용하여 유전자발현 패턴을 찾아내어 표현하고자 하였다. 평행좌표 플롯의 두 변형인 ePCP(enhanced parallel coordinate plot)와 APCP(Andrews' type parallel coordinate plot)를 림포마(lymphoma) 자료에 적용하여 62개 샘플을 의미있게 배열하고 300개 유전자를 평활 곡선으로 표현하였다.