Protein compositions of filefish (Navoden modestus) skeletal muscle and their changes in postmortem with reference to freshness kept at $0^{\circ}C$ were investigated. The muscle protein was approximately composed of $31\%\;sarcoplasmic,\;55\%$ myofibrillar, $10\%$residual intracellular, and $4\%$stroma protein. The sarcoplasmic and myofibrillar protein decreased while the residual intracellular protein increased with the decline of freshness during post-mortem lapse. In the analysis of electrophoretograms and its densitograms, the myofibrillar protein resembled to other fishes in protein composition: $70\%$ actin and myosin, $20\%$ regulatory proteins, and $10\%$ unknown proteins. And most of the residual intracellular protein was estimated as myofibrillar protein. Troponin T, troponin C and myosin light chain 2 of the myofibrillar protein constituents were decreased during storage. Amino acid composition of the protein from the at-death muscla was similar to those of other fishes except that tryptophan and sulfur-containing amino acids were scant. Proline and cysteine were remarkably decreased whereas leucine, isoleucine and phenylalanine were slightly increased in the protein from the muscle lapsed of 18 days. In free amino acid composition, alanine, glycine, lysine, and especially taurine were rich in the at-death muscle. The muscle lapsed of 18 days showed an increase of taurine, histidine, valine and methionine, and a decrease of lysine, arginine, aspartic acid, threonine, leucine, and isoleucine.
Lee, Chang Woo;Yu, Seung Taek;Choi, Ha Young;Koh, Bun Jeong;Kwak, Yong Guen
Clinical and Experimental Pediatrics
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v.52
no.5
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pp.567-575
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2009
Purpose : Epilepsy affects more than 0.5% of the world's population. It has a large genetic component and is caused by electrical hyperexcitability in the central nervous system. Despite its prevalence, the disease lacks definitive diagnostic serological biomarkers. To identify potential biomarkers for epilepsy by a convenient method, we analyzed the expression of serum proteins, reflecting alterations in the patient's proteomes. Methods : We compared two-dimensional electrophoretic band patterns of human sera from eight patients with temporal lobe epilepsy (TLE) with those of eight control subjects. The differentially expressed bands were identified using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry and electrospray ionization quadrupole time-of-flight mass spectrometry. esults : Twelve proteins were differentially expressed in the TLE group, of which 6 were identified. Expression of haptoglobin Hp2, PRO2675, immunoglobulin heavy chain constant region gamma 2, an unnamed protein, and three unidentified proteins were upregulated in serum from the patients with TLE, whereas those of major histocompatibility complex (MHC) class I antigen, plasma retinol-binding protein precursor, and three unidentified proteins were downregulated in these patients. After resection of the epileptogenic zone, the expressions of MHC class I antigen, immunoglobulin heavy chain constant region gamma 2, two of the downregulated unidentified proteins, and one of the upregulated unidentified proteins returned to the normal range. Conclusion : The 12 serum proteins in this study are potentially useful biomarkers for the diagnosis and monitoring of TLE.
To characterize expression and formation of three type crystal proteins in transformant, Bacillus thruingiensis PT0529 was analysed by transmission electron microscope and SDS-PAGE according to growth. The results showed that the introduced crystal protein genes, rcyIVD and cytA, were well expressed at earlier stage than resident crystal proteins were also expressed with their own morphology. However, resident crystal protein of B. thuringiensis PT0529 was smaller than that of wild type B. thuringiensis NT0423, suggesting that resident crystal protein production was interfered with introduced two type crystal protein genes.
It is the most important step to screen soluble and insoluble proteins when we attempt to improve the solubility of recombinant proteins through directed evolution approach. Here we show that the solubility of a recombinant protein in vivo can be examined by expressing the recombinant protein with beta-lactamase as a fusion partner. First we constructed an expression system which can produc a fusion protein with the C-terminal of beta-lactamase. Two soluble proteins, i.e. adenine deaminase and aspartate aminotransferase, and insoluble GlcNAc-2-epimerase were cloned into the developed expression vector, respectively. We investigated the effect of the expression of the three recombinant fusion proteins on the growth of E. coli, and confirmed that the solubilities of the recombinant proteins correlated with cell growth rates.
한우 난소의 황체는 다양한 세포들로 구성되어 있으며 난소의 생식기능유지와 임신유지에 중요한 인자가 복잡하게 관련되어 있으며 이들 황체에서 분비하는 단백질은 황체기능에 필수적으로 중요한 작용을 한다. 본 연구는 난소의 황체일령에 따른 단백질 분비 패턴을 조사함으로써 황체세포의 기능과 임신 유지에 관련되는 인자들을 조사하기 위하여 수행하였다. 한우에서 채취한 난소에서 황체를 분리, 황체시기별(전기, 중기, 말기)로 구분하여 cytosol을 분리 정제하였다. 황체시기별로 분리된 황체 단백질의 성분을 분석하기 위해 ion-exchange chromatography를 이용하여 단백질 패턴을 조사, 추출된 fraction을 단백질 정량후 SDS-PAGE를 실시하였다. 그 결과 중기에서의 단백질의 농도가 가장 높았으며, 특히 단백질 패턴 또한 다른 양상을 보였다. 시기별로 구분한 각각의 fraction을 SDS-PAGE로 조사했을 때 중기와 말기황체 cytosol의 fraction 3번과 4번에서 다른 양상을 보였으며 SDS-PAGE에서 120kb, 95kb, 34kb, 25kb 등의 단백질 밴드를 확인할 수 있었다. 초, 중기황체에서만 특이하게 검출되는 단백질 band를 확인할 수 있었으며 이 들 단백질을 구체적으로 확인하기 위하여 Two-Dimensional electrophoresis를 이용하여 실험을 수행하였다. 시기별로 분리된 황체를 일반적인 IEF단백질 분리법으로 cytosol을 회수한 후 IPG-system을 이용하여 1차원 전기영동을 한 후, SDS-PAGE로 이차원 전기영동을 실시하였다. 이차원 전기영동 결과, SDS-PAGE의 결과와 비슷한 위치에 부분적으로 다른 spot의 양상을 보였다. 특히 기능황체에서의 특이적 발현 spot을 확인할 수 있었다. 이러한 결과들로부터 황체의 progesterone분비기능의 역할을 수행하기 위한 단백질들이 전, 중기에 발현된다는 것을 알 수 있고 퇴행황체에서는 발현이 안되고 있는 것을 알 수 있다. 이러한 결과를 토대로 다른 양상을 띤 spot을 분리하여 어떤 단백질인지를 분석하여 각각의 황체단백질의 특성을 규명할 수 있을 것으로 사료된다.
Detoxified and deallergenized castor bean protein isolate was prepared from defatted castor bean pomace for use in animal feedstuffs and human foods. Succinylation and acetylation of the ${\varepsilon}-amino$ groups of the protein improved markedly the water solubility of the protein at $pH\;7{\sim}8$. The results of the amino acid analysis of the protein isolate revealed that the sulfur-containing amino acids and L-lysine were limiting amino acids and that succinylation and acetylation caused some little loss of the amino acid content. The L-methionine enriched plastein was synthesized from the protein isolate or the acylated protein isolates and DL-methionine ethyl ester by one step process with papain. By this method the extent of incorporation of L-methionine was about 50%. Pepsin hydrolyzed both unmodified and modified protein isolates at the same rate (about 92%). Tryptic hydrolysis, however, was less for the succinylated protein isolates (about 42%) and less for the acetylated protein isolates (about 26%). The protein efficiency ratio of L-methionine enriched protein isolate (about 2.5 weight %) was 90% that of reference casein. The protein efficiency ratio values of succinylated (88%) and acetylated (84%) protein isolate were 55 and 69% of reference casein, respectively.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2003.04a
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pp.869-871
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2003
단백질 부분 구조는 일종의 단백질 패턴으로써 진화적인 성질을 띄고 있다. 본 논문에서는 단백질 간의 열 안정성과 이러한 단백질 부분 구조 간의 관련성에 대해서 알아보고자 한다. 또한 오류 허용 알고리즘 (FT-Apriori)의 성능을 향상시킬 수 있는 효과적인 기법을 제안한다. 이러한 기법을 단백질 부분 구조에 적용시킴으로써 실제 단백질 데이터에서 그 효용성을 일아본다.
노랑초파리의 난실에서의 단백질 합성을 난자형성과정의 단계별로 자기방사법을 이용하여 관찰하였다 단백질은 영양세포에서 난자형성 초기에 미약한 정도로 함성되는 것으로 나타나지만, 가장 활발하게 합성되는 세포는 여포세포이다. 난모세포와 영양세포에서는 단백질이 거의 합성되지 않고 있다. 여포세포에서 합성된 단백질은 Stage 10 이후의 단계에서만 난모세포로 이동하는 것으로 관찰되었다 난모세포에 괸만하게 분포된 은입자는 난자 형성을 위한 다양한 목적을 위해 여포세포로 부터 이입된 단백질로 짐작된다. 특히 난황립의 형성에 여포세포의 단백질이 최소한도 부분적으로 관여한다는 사실을 알 수 있었다.
Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
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2001.05a
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pp.154-155
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2001
난백과 혈장, 대두단백질은 겔화식품의 겔강화와 단백질 보강의 목적으로 다양하게 사용되고 있으며, 이 때 첨가단백질의 겔화 특성은 가장 중요한 피능적 특성중 하나이다. 이러한 겔화에는 단백질의 종류, 가열온도와 시간, 염의 유무, pH등의 환경이 복합적으로 작용하여, 소수성 상호작용, 공유결합, 이온결합, S-S결합 및 수화력 등이 겔을 형성한다. 단백질의 겔화에 미치는 변수에 대한 많은 연구가 이루어졌지만 단백질의 겔화 특성에 있어 가장 많은 구성비율을 차지하는 수분과 수화력에 관한 연구는 미미한 실정이다. (중략)
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2004.04b
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pp.268-270
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2004
주어진 셀이나 조직에 발현된 단백질 프로파일의 구조적인 분석을 다루는 단백질체학(Proteomics) 연구에 있어서, 질병에 대한 마커 단백질(marker proteins)을 도출(identification)하는 것은 핵심 논점 중 하나이다. 수십 개의 샘플로부터 추출한 셀이나 조직 내에는 수많은 단백질이 포함되어 있으며, 존재하는 단백질의 질병에 의한 발현량(expression level) 변화 및 임상 특성에 의한 영향을 분석하기 위해서 데이터베이스와 데이터 마이닝 기술의 활용이 효과적이다. 본 논문에서는 질병 일 임상 특성에 따른 단백질의 발현량 변화를 분석하기 위한 OLAP 데이터 큐브(Data cube)의 응용 방법과 단백질 데이터의 분석에 적합한 척도(measure)를 제안하고, 유효성을 보인다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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