• Title/Summary/Keyword: 그룹별 분포특성

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Metagenomic Analysis of Jang Using Next-generation Sequencing: A ComparativeMicrobial Study of Korean Traditional Fermented Soybean Foods (차세대 염기서열 분석을 활용한 장류의 메타지놈 분석 : 한국 전통 콩 발효식품에 대한 미생물 비교 연구)

  • Ranhee Lee;Gwangsu Ha;Ho Jin Jeong;Do-Youn Jeong;Hee-Jong Yang
    • Journal of Life Science
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    • v.34 no.4
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    • pp.254-263
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    • 2024
  • Korean jang is a food made using fermented soybeans, and the typical products include gochujang (GO), doenjang (DO), cheonggukjang (CH), and ganjang (GA). In this study, 16S rRNA metagenome analysis was performed on a total of 200 types of GO, DO, CH, and GA using next-generation sequencing to analyze the microbial community of fermented soybean foods and compare taxonomic (biomarker) differences. Alpha diversity analysis showed that in the CHAO index, the species richness index tended to be significantly higher compared to the DO and GA groups (p<0.001). The results of the microbial distribution analysis of the GO, DO, CH, and GA products showed that at the order level, Bacillales was the most abundant in the GO, DO, and CH groups, but Lactobacillales was most abundant in the GA group. Linear discriminant analysis effect (LEfSe) analysis was used to identify biomarkers at the family and species levels. Leuconostocaceae, Thermoactinomycetaceae, Bacillaceae, and Enterococcaceae appeared as biomarkers at the family level, and Bacillus subtilis, Kroppenstedtia sanguinis, Bacillus licheniformis, and Tetragenococcus halophilus appeared at the species level. Permutational multivariate analysis of variance (PERMANOVA) analysis showed that there was a significant difference in the microbial community structure of the GO, DO, CH, and GA groups (p=0.001), and the microbial community structure of the GA group showed the greatest difference. This study clarified the correlation between the characteristics of Korean fermented foods and microbial community distribution, enhancing knowledge of microorganisms participating in the fermentation process. These results could be leveraged to improve the quality of fermented soybean foods.

Spatio-Temporal Distribution of Benthic Polychaetous Community along the South-eastern Coast of Geoje Is. (거제도 남동부 연안 저서다모류군집의 시.공간적 분포)

  • Lim, Kyeong-Hun;Lee, Jung-Ho;Shin, Hyun-Chool
    • Korean Journal of Environmental Biology
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    • v.24 no.4
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    • pp.392-407
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    • 2006
  • This study was seasonally undertaken to investigate the benthic polychaetous community along the South-eastern coast of Geoje Is., in February 2004 to November. The macrobenthic fauna showed mean density of 953 md. $m^{-2}$ in February, 1,193 ind. $m^{-2}$ in May, 1,130 ind. $m^{-2}$ in September and 991 ind. $m^{-2}$ in November. Major faunal groups are polychaetes, crustaceans and mollusks, corresponding to 81.6%, 7.9%, 7.0% in total mean density during the sampling seasons, respectively. There was significant difference (two-way ANOVA, p<0.001) among stations in densities of polychaetes. But no significant relationship could be found between the densities of polychaetes and sampling seasons (two-way ANOVA, p>0.05). The density and the species number of polychaetes were high in the coastal area near the Jisepo port, independent of sampling seasons. Several indicator species for the organically enriched environments such as Lumbrineris longifolia, Tharyx sp., Heteromastus filiformis showed high densities during all study periods. Also Magelona japonica included in Ecolgical group I was the most abundant in the whole study period except for February. Cluster analysis on the basis of the species composition showed that the study area could be divided into 3 regions. The density of benthic polychaetes in the coastal area near Jisepo was higher than that in the other assemblages of the study area, due to some predominant opportunistic species, such as Lumbrineris longifolia, Tharyx sp. and Heteromastus filiformis. In addition, the two-way ANOVA showed significant differences among the distribution of AMBI (AZTI's Marine Biotic Index) values, both in sampling stations (p<0.001) and seasons (p<0.01). According to the classification proposed by Borja et at. (2000), the study area was slightly disturbed site.

The Concentration Distribution and Source Identification of Polychlorinated Biphenyls in River Sediment (하천 퇴적물 중 PCBs 농도분포 및 발생원 해석)

  • Jin, Ronghu;Oh, Jung-Keun;Kim, Jong-Guk;Kim, Kyoung-Soo
    • Journal of Korean Society of Environmental Engineers
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    • v.32 no.11
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    • pp.995-1000
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    • 2010
  • To investigate the relationship between polychlorinated byphenyls (PCBs) sources and concentration level in sediment, total 63 sediment samples with three-time sampling at one site were measured at 21 sites in Nakdong River. As a result of analysis, total concentrations and toxic equivalent (TEQ) concentration of Dioxin-like PCBs were ranged from 3.0 to 6,600 pg/g-dry with a mean value of 440 pg/g-dry and

Lithology Determination by Log Analysis from a Borehole-PABH1 in the Pungam Sedimentary Basin (풍암퇴적분지 내 시추공 PABH1에서의 물리검층에 의한 암상의 판정)

  • 김영화;장승익
    • The Journal of Engineering Geology
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    • v.8 no.2
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    • pp.163-173
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    • 1998
  • Suite of log analysis techniques consisting of geophysical well log, geological core log, and physical core log have been made to understand the well log responses and to determine the lithology of a test borehole-PABH1 located in Pungam sedimentary basin, Sosok, Hongchon-gun, Kangwon Province. Geological core logging has been precisely made over the cores taken between 64 and 124 meters, and 11 groups of rock types were deduced. Using the core samples divided by 11 groups, geophysical property measurements consisting of resistivity, natural gamma and density were made. Each rock group in the area is shown to have its characteristic physical response from geophysical well log and geophysical core logs. The outstanding physical responses particularly shown from siltstone, coarse sandstone to conglomerate, and granitic gneiss in the area were effectively used as keybeds in correlating the geophysical well logs to the result of geological core logs.

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Comparison for Genetic Diversity between Korean Native Commercial Chicken Brand Groups using Microsatellite Markers (Microsatellite Marker를 활용한 토종닭 브랜드 집단 간의 유전적 다양성 분석)

  • Lee, Hak-Kyo;Oh, Jae-Don;Park, Chan-Ho;Lee, Kun-Woo;Lee, Jun-Heon;Jeon, Gwang-Joo;Kong, Hong-Sik
    • Korean Journal of Poultry Science
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    • v.37 no.4
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    • pp.355-360
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    • 2010
  • To estimate the genetic characteristics within two brands of Korean native commercial chicken, we used a total of 302 genomic DNAs from two groups (Woorichicken: 152, Hanhyup3chicken: 150). Sizes of 10 microsatellite markers were decided using GeneMapper Software (v.4.0) after analyzing ABI 3130. Genetic diversity indices including expected heterozygosity (Ex H), observed heterozygosity (Ob H) and polymorphism information content (PIC). Frequencies of microsatellites markers were used to estimate heterozygosities and genetic distances. LEI0073 showed the highest value in all genetic diversity (Ex H, Ob H and PIC). On the other hand, MCW322 showed the lowest value in all genetic diversity. The calculated genetic distance of the two brand groups is 0.199 (standard genetic distance) and 0.132 (DA distance). Genetic distances of the two groups were relatively close to each other. Each individual is ramified to two brand groups in phylogenetic dendrogram.

DEM estimation of mechanical properties of conglomeratic rocks (역암의 역학적 거동 특성 파악을 위한 개별요소법의 응용)

  • Park, Young-Do;Yoo, Seung-Hak;Kim, Ki-Seok
    • Proceedings of the Korean Geotechical Society Conference
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    • 2006.03a
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    • pp.42-50
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    • 2006
  • 역들의 공간적 분포가 불균질하고 역의 크기가 큰 역암의 경우 암석 전체를 대표하는 물성치($E_m,\;c,\;\Phi$ 등) 구하기 위해서는 매우 큰 시험기기가 필요하다. 따라서 커다란 역을 포함하는 역암의 경우 직접 암석실내시험을 통한 물성치 산정은 현실적으로 거의 불가능하다. 이러한 문제를 극복하기 위하여 이 연구에서는 개별요소법을 이용하여 역암의 물성치를 산출하는 방법을 제안한다. 그 방법은다음과 같다. (1) 역암내의 역의 물성과 기질부의 물성을 각각 실내실험을 통하여 파악한 후 이들 (2) 두 물질의 거동양상을 구현할 수 있는 개별요소집합체의 개별요소간의 물성을 결정한다. (3) 역의 함량, 크기 모양 공간적 분포양상등의 역암 조직과 유사한 개별요소 수치해석시료를 만든 후, (4) 이를 수치 해석실험 (이축압축실험)에 사용한다. 이러한 수치해석실험을 통해 현재까지 만들어진 결과는 다음과 같다. 첫째, 역의 강도가 기질의 강도보다 높은 역암의 경우, 역의 양이 증가할수록 일축압축강도, 내부 마찰각, 점착력이 증가하지만 증가 양상은 선형이 아니다. 탄성계수의 경우 역의 양과 상관 없이 변화하지 않는다. 둘째, 역과 기질 사이 표면의 점착력이 약할 경우 이러한 표면에서 최초 미세 균열이 형성되기 시작하므로 이 점착력은 물성치를 산출하는 중요한 인자이다. 따라서, 향후 이에 대한 자세한 연구가 필요하다고 판단된다. 결론적으로,설계 또는 시공시 직접시험에 의한 물성치의 파악이 어려운 역암 또는 직접시험을 위해 대량의 시료를 필요로 하는 함력 미고결지층, 핵석층, 풍화암과 같은 시료의 물성치는 별도로 측정된 물성들 (예, 역과 기질)을 이용한 개별요소법을 통해 구할 수 있다.로 나타났다.TEX>, DIN/DIP비 표층수 $23.91\pm3.42$, 저층수 $23.43\pm3.38$이었으며, 전반적으로 해역별 수질기준 I등급 내지는 II등급을 유지하고 있었고, 공간적으로는 외해측으로 갈수록 외해수와 혼합 확산되어 양호한 수질을 나타내었다. 장기적인 변동특성은 세그룹으로 구분되어진다.기 실험결과 용출용매로 증류수와 해수를 이용했을 때, 제강 슬래그에서 용출되는 납, 구리, 카드뮴, 수은의 용출 경향의 차이를 확인할 수 있었고 이에 따라서, 납, 구리, 카드뮴의 용출 유해성은 낮기 때문에 해양구조물로의 제강슬래그 유효이용은 적합할 것으로 판단되었다.im80%$로 계산되었다. 열형광선량계로 측정된 방사선량은 각각 1.8, 1.2, 0.8, 1.2, 0.8 (70 cm 거리) cGy로 측정되었으며, 환자의 복부 표면에서의 서베이메터를 이용한 측정량은 10.9 mR/h였다. 차폐구조물의 사용 시 전체 치료 동안에 태아선량은 약 1 cGy 정도로 평가되었다. 결론 : AAPM Report No.50의 자료에 따르면, 임산부의 방사선 치료 시 태아의 방사선 피폭선량은 5 cGy 이하일 경우에 방사선 피폭에 따른 태아의 위험이 거의 없는 것으로 제시되고 있다. 본원에서 차폐 구조물을 설치하였을 경우에 측정된 태아선량은 약 1 cGy로 측정되었고, 고안된 차폐구조물은 태아에 도달하는 방사선량을 감소시키기에 적합한 설계임이 입증되었다. 아니라 일반종합병원에서도 CTX-M형 ESBL 생성 E. coli와 K. pneumoniae가 존재하며 확산 중임을 시사한다. 앞으로 CTX-M형 ESBL의 만연과 변종 CTX-M형 ESBL의 출연을 감시하기 위한

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Comparison of Fish Distribution Characteristics by Substrate Structure in the 4 Streams (하상구조에 따른 4개 하천의 어류 분포 특성 비교)

  • Yoon, Seok-Jin;Choi, Jun-Kil;Lee, Hwang-Goo
    • Korean Journal of Environment and Ecology
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    • v.28 no.3
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    • pp.302-313
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    • 2014
  • This study was conducted to compare the characteristics of fish distribution according to sand type stream and cobble type stream the 4 stream selected every season. The collected Korea endemic species during the survey period were 24, including Acheilognathus gracilis. Dominant species of Hongcheon stream and Muju Namdae stream was Zacco koreanus, each accounting for 39.9% and 28.4% in order, and dominant species in Yanghwa stream was Rhodeus notatus, 13.6%, and those in Gap stream was Z. platypus, by 26.0%. As a result of community analysis, dominant index was 0.27~0.63, diversity index was 1.92~2.67, evenness index was 0.6~0.79, richness index was 3.09~3.53, and dominant index was the highest in Hongcheon stream, and the indices of diversity, evenness and richness were the highest in Yanghwa stream. As a result of tolerance guild analysis, Hongcheon stream and Muju Namdae stream with a variety of substrates accounted for relatively higher rate by 50.1% and 46.4% in sensitive species respectively, and Yanghwa stream and Gap stream with greater sand substrates had 0.5% and 5.3% scarce rate of sensitive species. As a result of similarity analysis using the species, population and substrate structures of the fisheries appeared in each stream, cobble type streams such as Hongcheon stream and Muju Namdae stream were the most similar by 50.4% in species and population, 95.2% in bed structure. As a result of IBI analysis, Hongcheon stream and Muju Namdae stream appeared as 'Class A,' Yanhwa stream and Gap stream as 'Class B' and the two groups of cobble type stream and sand type stream were divided as a result of principal components analysis.

Analysis of River Disturbance Using GIS techniques and aerial photographs (항공사진 및 GIS기법을 이용한 하천 교란 실태의 분석)

  • Park, Eun-Ji;Kim, Kye-Hyun;Park, Tae-Og
    • 한국공간정보시스템학회:학술대회논문집
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    • 2007.06a
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    • pp.268-272
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    • 2007
  • 현재 시행되고 있는 하천정비와 하도정비는 하천 흐름의 특성을 간과한 채 일괄적으로 진행되어 왔으며 그 결과로 하천의 인공화는 지금까지 계속되고 있다. 이에 따라 하천 및 하도의 물리, 화학, 생물에 미치는 영향은 심각하며, 그 동안 인위적인 하천교란의 요인과 하천교란에 따른 영향, 즉 하상변동, 외래종 식생 침입, 생태서식처 변화 등의 정량적 평가 기술의 수립은 매우 미흡한 상태이다. 뿐만 아니라 하천 교란 극복을 위한 저감기술, 복원기술 및 적응관리 기술 또한 체계적으로 정리되지 못하여 하천과 댐 관리당국이 어려움을 겪고 있다. 이러한 상황을 극복하기 위해서는 하천 교란에 대항하는 회복관리 기술 개발을 위한 교란 평가 기술이 필요하다. 따라서 본 연구에서는 항공사진 및 GIS기법을 이용하여 국내 주요하천의 원인별 교란실태를 조사하고 분석함으로써 하천교란 조사기술 개발에 응용할 수 있는 방안을 제시하고자 하였다. 분석을 위하여 댐 하류의 하천교란 및 적응현장 시범지역을 선정한 후 대상 지역의 항공사진을 GIS화하여 하천 교란 실태를 분석하는 데에 필요한 자료를 생성하였으며 생성된 자료를 바탕으로 하천의 평면 및 단면의 변화특성을 조사할 수 있었다. 또한 경년별 저수로 형태와 하천 중심선 비교 분석을 통하여 저수로의 이동 및 변화 양상을 규명해 낼 수 있었으며 그 결과 댐 하류지역에서 하도안정문제가 발생하였음을 확인할 수 있었다. 본 연구 결과를 바탕으로 보다 효율적인 하도안정문제에 관한 대책수립이 가능하리라 보며, 이를 위해서는 하천 교란 조사기술 개발에 대한 연구가 뒤따라야 할 것이다.과적임을 알 수 있었다. 실험 결과 본 기법으로 유휴시간에 프로세서를 저전력모드로 바꾸는 기존의 고전적인 전력 관리 기법보다 전체 시스템 전력 소모를 9% 더 절약할 수 있었다. 위성영상과 DEM 개발기술이 87% 이상의 점수를 받아 가장 시장성 및 활용성이 높은 기술로 평가되었으며, 초다분광영상에 대한 기술은 70%를 겨우 넘는 수준에서 평가가 되었다. 멀티센서 공간영상정보 통합처리 기술 개발은 다목적 실용위성의 보유, 국가 NGIS 사업의 결과물이 상당히 축척이 되어 있고, 라이다(LiDAR) 기술의 도입을 위한 환경이 조성되었기에 다른 국가에 비해 멀티센서 기술의 적용과 산업화가 가시화 될 수 있을 것으로 기대된다. 그러나 멀티센서 자료의 수급이 용이하지 못하고, 법 제도적인 한계, 시장의 성숙도가 기대이하라는 점 등의 한계를 노정하고 있다.a var. sieboldii 3. Pinus densiflora, Q. aliena, Q. acutissima, P. thunbergii, Q. acuta 4. Carpinus laxiflora, Camellia japonicas. C. tschonoskii community의 5개 그룹으로 나타났다. 하류의 부착돌말류는 상대적으로 양호한 수질을 가지고 있는 정점 1에서 다양한 생물상을, 탄천의 영향을 받는 정점 2는 상대적으로 수질이 악화되어 호오염성 종들이 높은 분포를 나타내고 있었다. 또한 부착돌말류 중 Cymbella minuta는 다른 부착돌말류에 비해 강한 오염지표성을 나타내고 있었다.p=0.000, $4.76{\pm}3.31$

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Physicochemical Characteristics of Tailings from the Various Types of Mineral Deposits (광상유형에 따른 광물찌꺼기의 물리화학적 특성)

  • Lee, Pyeong-Koo;Youm, Seung-Jun;Jung, Myung-Chae;Lee, Jin-Soo;Kwon, Hyun-Ho
    • Economic and Environmental Geology
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    • v.43 no.3
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    • pp.235-248
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    • 2010
  • To construct the standard methods for evaluation of physicochemical characteristics of tailings in Korea, specific gravity, paste pH, grain size, mineral compositions and heavy metal concentrations of total 26 tailings from 21 metallic mines were analyzed. Specific gravity of tailings ranged from 2.61 to 4.31 (avg. 3.04), and sand and silt grain were dominant in the tailings. Ranges of paste pH were 2.1-9.5 in tailings (7.1-9.2 at magmatic, skarn and hydrothermal replacement deposits and 2.1-9.5 at hydrothermal vein deposits). Additionally, hydrothermal vein deposits could be reclassified into three categories: (1) paste pH>7.0, (2) 4.0

The Classification and Interpretation of Korean Soils Derived from Sedimentary Rocks using Multidimensional Scaling (다차원척도법을 이용한 우리나라 퇴적암 유래토양의 분류 및 해설)

  • Sonn, Yeon-Kyu;Seo, Myung-Chul;Park, Chan-Won;Hyun, Byung-Keun;Zhang, Yong-Seon
    • Korean Journal of Soil Science and Fertilizer
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    • v.41 no.6
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    • pp.387-392
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    • 2008
  • It is very important to characterize five major properties of topography, drainage class, soil texture, available soil depth, and gravel content for soil survey. We used multidimensional scaling method for analyzing five major properties for the soils originated from sedimentary rocks to understand their relationships. We simplified 5 major characteristics on soils derived from sedimentary rocks. That is, topographic factor was 15 to 9, soil texture was 32 to 6, drainage class was 6 to 5, available depth was 4, and gravel content was 3. For the viewpoint of eigenvector, from dimension 2, 3 to dimension 1, 4, mountain soils and more fine soils dominated. By eigenvalue, there was no tendency, but in details, was some tendency between small groups. Like this, closely observe exceptional distribution of soils, we need improved intra-group homogeneity based on weight control of soil factor, addition and subtraction of soil factors. Also, we carefully analyzed soil characteristics involved intra-group, then we need reconsideration of past classification units.