• Proceedings of the Korean Institute of Intelligent Systems Conference
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• 2006.11a
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• pp.75-78
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• 2006

계통발생학적 분석은 바이오인포메틱스에서 분류 단위의 진화적인 관계를 추정하는데 있어서 중요한 문제 중 하나이다. 계통발생학적 분석에서 사용되는 계통수는 분류 단위들 사이의 진화 거리에 대한 정보를 표현하기에는 부족하다. 이 논문은 진화거리 표현을 위해 3차윈 공간으로 분류 단위가 표현되기 위한 방법을 제안하고, 2차원 트리 뷰와 함께 3차원 공간에서 분류 단위들을 시각화하기 위한 도구를 개발하였다.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
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• 2019.10a
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• pp.35-35
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• 2019

현호색속은 양귀비과에 속하는 분류군으로서 전 세계에 약 450분류군이 분포하며 한국에는 25분류군이 분포한다. 20분류군의 한국산 현호색속 식물을 대상으로 화부 형태, 밀선의 형태, 밀선의 부착 위치를 비교 분석하였다. 현호색속 식물의 꽃은 좌우대칭하며 외화판의 거(spur)에 위치한 밀선을 갖는데 밀선의 위치, 형태 등은 현호색속의 분류체계를 반영하는 중요한 형질로 판단된다. 관찰결과 현호색절과 가는괴불주머니절의 밀선은 거(spur)의 1/3~2/3 정도 까지 신장되며 신장부는 매우 가늘지만 선단부에서는 다소 부푼 후 뾰족해지고 아래쪽으로 굽으며 분비조직이 위치하고 있는 부분은 녹색, 신장부는 횐색을 띠었다. 들현호색절에서는 거(spur)의 중간 정도에 위치한다. 기부는 두껍고 화색과 같은색을 띠지만 끝부분은 가늘고 굽지 않으며 흰색을 띤다. 자주괴불주머니절의 밀선은 거의 신장되지 않고 주걱형이며 노란색을 띠었다. 산괴불주머니절에서는 거(spur)의 3/4까지 신장되며 선단부는 뾰족하고 녹색을 띠며 아래로 굽는다. 밀선의 형태는 거(spur)의 형태와 관련이 있다. 거(spur)가 주머니처럼 부푸는 절에서 밀선분비조직의 뚜렷한 발달이 관찰되고 거(spur) 안에 분비된 화밀을 저장한다. 비록 현호색절과 산괴불주머니절이 서로 밀접한 계통을 갖지는 않지만 이들이 공유하는 밀선의 형태는 거(spur) 형태의 유사성에서 기인한 것으로 보인다. 한국산 현호색속 밀선의 형질진화 분석을 위하여 mesquite을 이용하여 ancestral reconstruction를 수행하였다. 밀선의 형질진화는 한국산 현호색속 5절의 계통진화를 반영하였다. 현호색속의 화부형질은 매우 복잡하고 다양한 방향으로 진화한 것으로 보이며 이를 이해하기 위해서는 다양한 화부형질의 종합적인 검토가 필요하다. 이번 연구에서 확인된 화부구조와 분비조직의 형질은 현호색속의 계통진화를 잘 반영하고 있었으며 향후 분비조직의 해부형질, 미세형질 등의 추가연구를 통하여 현호색속의 계통연구를 위한 새로운 분류학적 가치를 제공할 수 있을 것이다.

• Proceedings of the KIEE Conference
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• 2005.07a
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• pp.158-161
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• 2005

본 논문에서는 해집단을 다음세대로 진화시킬 때, 유전알고리즘과 진화전략을 동시에 사용하고, 적합도에 따라 복제하는 과정에서 유전알고리즘과 진화전략이 적용될 해집단의 비율이 적응적으로 변경되는 적응진화 알고리즘을 제안하였다. 또한 제안한 알고리즘을 실시간 적용하기 위해 PC 클러스터 시스템으로 병렬처리하여 최적해 탐색 성능 및 탐색속도를 개선하였다. 제안한 알고리즘을 실 배전계통 고장복구 문제에 적용해 본 결과, 유전 알고리즘 또는 진화전략을 단독으로 사용한 경우보다 제안한 방법이 더 빠른 시간내에 우수한 최적해를 탐색하였고, 병렬 연산의 수행 노드수 증가에 따라 최적해 탐색성능은 유지하면서 최적해 탐색시간을 상당히 단축시킴을 확인하였다.

• Proceedings of the KIEE Conference
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• 2005.07a
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• pp.162-165
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• 2005

본 논문에서는 해집단을 다음세대로 진화시킬 때, 유전알고리즘과 진화전략을 동시에 사용하고, 적합도에 따라 복제하는 과정에서 유전알고리즘과 진화전략이 적용될 해집단의 비율이 적응적으로 변경되는 적응진화 알고리즘을 제안하였다. 또한 제안한 알고리즘을 실시간 적용하기 위해 PC 클러스터 시스템으로 병렬처리하여 최적해 탐색 성능 및 탐색속도를 개선하였다. 제안한 알고리즘을 참고문헌의 배전계통 재구성 문제에 적용해본 결과, 유전 알고리즘 또는 진화전략을 단독으로 사용한 경우보다 제안한 방법이 더 빠른 시간내에 우수한 최적해를 탐색하였고, 병렬 연산의 수행 노드수 증가에 따라 최적해 탐색성능은 유지하면서 최적해 탐색 시간을 상당히 단축시킴을 확인하였다.

• Journal of The Korean Association For Science Education
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• v.23 no.5
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• pp.470-483
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• 2003

This study analyzed the evolutionary content in 13 textbooks developed from the first to the 6th high school biology curriculum, The content analysis of textbooks, which were delineated nine component, was performed on the 80 evolutionary categories, According to the result, the proportion of the total evolutionary content in textbook increased from the textbooks developed by the Ist curriculum to the textbooks developed by the 6th curriculum, but the proportion of 'main narrative' in total evolutionary content was gradually decreased. It also showed that biology curriculum and points of view of textbook writers influenced on the proportion of evolutionary contents. On the whole, the topics of analysed textbooks exhibit insufficient diversity, Any categories- 'group selection', 'gene selection', 'gaps in fossil record', 'co-evolution', 'punctuated equilibrium', 'mosaic evolution', 'place of labor in human evolution', 'human race differentiation', 'criticism of "ontogeny recapitulates phylogeny", and 'human activities affecting evolution' - were not treated and others - 'theory of neutralism', 'theories of major episodes(excepting extinctions) found in the geologic time scale', 'sympatric speciation', 'clinal and area-effect speciation', 'polyploidy and evolution', 'gradualism' and 'evolution and origin of mammals' - were treated very lightly, the most emphasized topic was 'phylogeny in general' and 'formation of precells', 'miscellaneous' in the order of emphasis. 'Theory of natural selection' was lightly treated as just one of evolutionary theory though it should be emphasized as major theme of evolution. Also, the law of recapitulation, of which biologists doubt the validity, was discussed as an evidence of evolution in some textbooks. And the agents of genetic equilibrium disruption like genetic drift and migration were treated as of little importance. On the basis of above result, it was suggested that the textbook writers introduced the more meaningful evolutionary topics focused the theory of natural selection in explanation of evolution and evolution theory.

• Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
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• 2001.05a
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• pp.547-548
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• 2001

합계 52개의 형질 중에서 종내변이를 보인 11개의 형질을 제외한 41개의 형질변환계열을 이용하여 촉수과 어류 41종의 분기분석(cladistic analysis)을 실시한 결과, 최절약분기도 (most parsimonious tree, 수장 72, 일치지수 0.74)가 7개 얻어졌다. 그 중, 형질극성의 객관적 결정이 불가능하여 계통해석에 사용하지 않은 안전린(preorbital scales)의 형질진화를 최적으로 설명할 수 있었던 1개의 분기도(지면관계상 생략함)를 촉수과 어류의 계통가설로 채용했다. (중략)

• Korean Journal of Plant Taxonomy
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• v.39 no.1
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• pp.35-41
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• 2009

Astilbe (Saxifragaceae) is a genus well known for its disjunctive distribution in Asia and eastern North America. In this study, we reconstructed a molecular phylogeny of the genus using the sequences of ITS regions of nuclear ribosomal DNA. A total of 17 species representing major lineage of Astilbe and closely related taxa were included in the phylogenetic analyses. We obtained a Bayesian phylogenetic tree in which Saxifragopsis was positioned as a sister group to Astilbe. The Japanese endemic species, A.platyphylla was the most basal lineage within the genus. This species is well known for its distinct morphological features such as unisexual flowers, apetaly, and calyx with 7-11 lobes. Two species, A. biternata, a New World representative of the genus, and A. rivularis widely distributed in S. Asia, branched off early in the evolution of Astilbe. The remaining species formed a strongly supported core clade, which diverged into two robust geographical lineages: the first ("Japonica" clade) of species distributed in Japan, Taiwan, and Philippines and the other ("Rubra" clade), of taxa in China and Korea. The ITS phylogeny indicates that the Bering land bridges were the major route for the origin and dispersal of A. biternata. The two Taiwanese taxa and A. philippinensis were found to derive from the Japanese member, as the genus advanced southwards. The ITS phylogeny suggests that apetaly originated independently at least two times within the genus. Our results do not support Engler's classification system of the genus based on the leaf type (simple vs. compound), but reaffirm Hara's taxonomic idea which primarily considered the features of calyx.

• Proceedings of the Korean Society of Applied Entomolohy Conference
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• 2001.11a
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• pp.27-28
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• 2001

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2002.10c
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• pp.226-228
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• 2002

현재 유전자 서열 분석이 완료된 유전체들이 점점 늘어나고 있다. 따라서 이에 대한 방대한 정보가 생성됨에 따라 다양한 생물체들에 대하여 대사 네트웍을 통한 다차원적 분석이 가능하게 되었다. 대사 네트웍은 단백질 또는 효소들의 전체적인 상호작용을 표현하기 때문에 생물학적 메카니즘에 대하여 보다 풍부한 정보를 제공해 준다. 본 논문에서는 일차원적인 유전자 서열에 의한 종의 계통 분류가 아니라 메타 수준의 생리 구조적 비교를 통하여 계통분류학에 대하여 새로운 방법의 접근을 제안하고자 한다. 제안된 방법은 기존의 상동성 비교에 의한 계통 분류와 함께 좀 더 포괄적이고 거시적인 분석을 가능하게 한다.

• Proceedings of the KIEE Conference
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• 2008.11a
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• pp.290-292
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• 2008

전력계통이 점점 더 복잡해지고 광역화됨에 따라서 최적조류계산(Optimal Power Flow:OPF)은 전력계통에서 여러 가지 제약 조건을 만족하면서 경제적이고 안전하게 계통을 운영하기 위한 기법으로 더욱 중요성이 커지고 있다. 종래의 계산방법에는 비선형 계획법, 선형계획법 같은 수치해석적인 방법을 사용하였다. 그러나, 이러한 방법들은 전역 최적해를 구하기 위해서는 목적함수가 convex해야 한다. 또한, 계통 규모가 클 경우, 최적해 수렴이 안 되거나 수렴이 되더라도 시간이 많이 걸리는 단점이 있다. 최근에는 이러한 문제를 극복하고자 여러가지 진화연산기법들이 최적조류계산 문제에 적용되고 있다. 본 논문에서는 PSO알고리즘을 여러 개선된 형태로 비교 연구하여, 제안한 방법중 가장 최적화된 결론을 도출하기 위하여, IEEE 30,118 모선 계통의 최적조류계산 문제에 적용하였다.