Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2010.06b
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pp.514-517
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2010
그리드 인프라를 활용하여 대규모 계산 자원이 필요한 가상 스크리닝(Virtual Screening)에 관한 연구가 국제 WISDOM 프로젝트를 중심으로 활발하게 진행 중에 있다. 기존의 연구들은 싱글 클러스터나 개인의 컴퓨터를 중심으로 계산 자원을 활용하는 방식으로 연구가 진행이 되었다. WISDOM을 중심으로 대규모 말라리아(Malaria), 조류 독감(Avian Flu) 에 대한 대규모 신약 후보 탐색에 관한 연구들이 진행이 되었으며 한국과학기술정보연구원(KISTI)의 그리드 개발팀은 2007년도부터 국제 공동 파트너로 연구에 참여하고 있다. 공동연구에 참여하면서 신약 연구 개발자들이 Docking 및 그리드 자원을 활용하기 위한 접근 방식에 있어서 기존 방식들을 활용하기 어려운 점과 검색된 신약 물질을 분석하는 도구의 활용이 어려움이 많아 그리드 기반의 가상스크리닝 도구인 DrugScreenr-G(이하, DSG-G 클라리언트)를 개발하게 되었다. 본 논문은 개발된 DSG-G 클라이언트에 관한 개발 및 구조에 관한 내용이다.
Journal of the Korea Society of Computer and Information
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v.11
no.5
s.43
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pp.87-94
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2006
Grid computing has been developed for resolving large-scaled computing problems through geographically distributed heterogeneous resources. In order to guarantee effective and reliable job processing, grid computing needs resource scheduling model. So, we propose a resource performance measurement scheduling model which allocates job to resources with resource performance measurement. We assess resources using resource performance measurement formula, and implement the resource performance measurement scheduling model in DEVS simulation modeling.
Journal of the Computational Structural Engineering Institute of Korea
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v.20
no.3
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pp.321-327
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2007
This study presents a new gridless finite difference method for solving elastic crack problems. The method constructs the Taylor expansion based on the MLS(Moving Least Squares) method and effectively calculates the approximation and its derivatives without differentiation process. Since no connectivity between nodes is required, the modeling of discontinuity embedded in the domain is very convenient and discontinuity effect due to crack is naturally implemented in the construction of difference equations. Direct discretization of the governing partial differential equations makes solution process faster than other numerical schemes using numerical integration. Numerical results for mode I and II crack problems demonstrates that the proposed method accurately and efficiently evaluates the stress intensity factors.
Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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2002.11c
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pp.2367-2370
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2002
분산되어 있는 고성능 컴퓨팅 자원이나 저장 장치, 과학계산 장비들을 한데 묶어서 활용함으로써, 자원 활용의 효율성을 극대화하기 위한 그리드 관련 기술이 현재 많은 호응을 얻으면서 관련 연구가 한창 진행중에 있다. 이러한 그리드 환경을 보다 쉽게 활용하기 위한 그리드 웹 포탈의 연구도 같이 진행되고 있는데, 본 고에서는 이미 그리드 웹 포탈서비스를 구축 서비스를 하고 있는 사이트들의 동향을 분석하였다.
Proceedings of the Korean Society of Tribologists and Lubrication Engineers Conference
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1998.10a
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pp.151-159
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1998
디젤 엔진의 푸쉬로드 타입의 밸브 트레인에서의 힘의 전달 과정을 기구학적 응용을 통하여 구하였다. 이러한 힘의 최종 전달 단계인 캠과 평판 종동물의 접촉에서의 작용하중과 상대 운동 속도를 계산하였고 접촉면에서의 유막 두께를 고체면의 탄성변형을 고려하여 계산하였다. 특히 탄성 유체 윤활의 해석을 하는데 있어서 안정성과 수렴성이 우수한 멀티그리드 멀티레벨 기법을 사용하였으며 동하중 상태를 고려하여 유막 두께를 계산하고 기존의 정상상태의 해석해와 비교하였다.
Kim Eun-kyung;Kim Yoonhee;Cho Junghyun;Kim Chongam;Lim Sang Beom
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2005.11a
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pp.1039-1041
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2005
가상 풍동 실험은 슈퍼컴퓨터와 같은 고성능의 계산 지원과 실험을 위한 깊은 지식을 요구하여 실험을 수행하는데 많은 어려움이 수반된다. 그리드[1][2]는 산재한 자원을 연계하여 고성능 응용을 위해 효율적으로 활용할 수 있도록 하는 기반구조를 제공한다. 본 논문에서는 그리드 자원을 활용하여 가상 풍동 실험을 빠르고 효과적으로 수행할 수 있는 그리드 웹 포탈 서비스를 제안한다. 통합된 포탈 서비스를 통하여 사용자의 응용 및 실험환경의 요구사항을 반영한 격자생성, 계산 작업, 작업 모니터링, 결과 가시화를 효율적으로 수행한다.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2003.04a
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pp.154-156
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2003
그리드 자원관리 시스템은 사용자로 하여금 지역적으로 분산된 고성능의 자원들을 사용하여 단일자원으로서는 계산할 수 없는 커다란 계산을 가능하게 하는 컷을 목표로 한다. 이를 위해서 사용자에 대한 인증. 사용자 프로그램 분배 및 실행, 작업 모니터링 등 자원을 할당하기 위한 기능들을 제공해야 한다. 특히 자원의 사용에 있어서 자율적이고 안전한 방법으로 접근할 수 있도록 하는 것이 필요하다. 이러한 요구를 고려하여 본 논문에서는 기존의 자원 할당 시스템보다 사용자에게 편리하고 효율적인 그리드 자원관리 시스템을 제안한다. 고안된 시스템은 원격의 계산 자원에서 실행되는 큐에 대안 사본을 클라이언트에 관리함으로써 작업의 관리 및 재실행에 있어서 효율을 높일 수 있게 하였고, 사용된 큐를 캐싱함으로써 자원할당 과정에서 탐색과정을 줄일 수 있도록 하였다.
Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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2003.04a
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pp.61-63
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2003
인터넷 기반의 컴퓨팅 환경이 발전함에 따라 자원과 정보의 공유를 위한 그리드 컴퓨팅이 나타나게 되었다. 그리드 컴퓨팅에서는 그리드 응용 수행시 프로그램과 데이터간의 위치가 다르고 분산되어 있는 경우가 많다. 현재 그리드 미들웨어 시장 표준인 글로버스 둘킷(Globus Toolkit$_{TM}$)에서 사용하는 GASS(Global Access to Secondary Storage)는 원격에 있는 관련 데이터들을 로컬 시스템의 데이터에 접근하는 것처럼 처리하는 것을 지원한다. GASS에서는 원격지의 파일 시스템의 접근시 URL(Uniform Resource Locator)을 이용하는데, 그리드 환경에서의 I/O을 위한 파일 시스템은 복수의 파일 형태로 분산되어있기 때문에 하나의 그리드 응용을 수행할 때 URL을 동적으로 바꿔야 하는 문제점을 갖고 있다. 위치에 상관 없고 고성능을 지향하고 데이터의 성격을 쉽게 표현할 수 있는 이름 체제가 필요하다. 그래서 본 연구는 동적이고 다양한 표현이 가능한 URI(Uniform Resource Identifiers)을 사용하여 그리드 상에서 데이터를 사용하는 방법을 제안하고자 한다.
Journal of the Society of Naval Architects of Korea
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v.31
no.4
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pp.41-50
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1994
An iterative time marching procedure for solving incompressible viscous flows has been applied to the flow around a propeller. This procedure solves three-dimensional Navier-Stokes equations on a moving, body-fitted, non-orthogonal grid using first-order accurate scheme for the time deivatives and second-and third-order accurate schemes for the spatial derivatives. To accelerate iterative process, a multigrid technique has been applied. This procedure is suitable for efficient execution on the current generation of vector or massively parallel computer architectures. Generally good agreement with published experimental and numerical data has been obtained. It was also found that the multigrid technique was efficient in reducing the CPU time needed for the simulation and improved the solution quality.
As large-scale computational applications in various scientific domains have been utilized over many integrated sets of grid computing resources, the difficulty of their execution management and control has been increased. It is beneficial to refer job history generated from many application executions, in order to identify application‘s characteristics and to decide selection policies of grid resource meaningfully. In this paper, we apply a statistical technique, Plackett-Burman design with fold-over (PBDF), for analyzing grid environments and execution history of applications. PBDF design identifies main factors in grid environments and applications, ranks based on how much they affect to their execution time. The effective factors are used for selecting reference job profiles and then preferable resource based on the reference profiles is chosen. An application is performed on the selected resource and its execution result is added to job history. Factor's credit is adjusted according to the actual execution time. For a proof-of-concept, we analyzed job history from an aerospace research grid system to get characteristics of grid resource and applications. We built JARS algorithm and simulated the algorithm with the analyzed job history. The simulation result shows good reliability and considerable performance in grid environment with frequently crashed resources.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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