• 제목/요약/키워드: $\beta$-Xylosidase Gene

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효모염색체내에 다양한 유전자발현 cassette의 반복적 integration을 위한 system 구축 (System for Repeated Integration of Various Gene Expression Cassettes in the Yeast Chromosome)

  • 김연희
    • 생명과학회지
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    • 제28권11호
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    • pp.1277-1284
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    • 2018
  • 본 연구에서는 효모염색체내에 다양한 유전자 발현 cassette를 도입하기 위해 Cre/loxP system을 가진 repeated yeast integrative plasmid (R-YIp)를 구축하였다. R-YIp는 반복적으로 형질전환체를 선별할 수 있는 selective marker (CgTRP1)와 loxP 서열, 그리고 integration을 위한 목적서열을 함유하고 있어 같은 염색체의 동일한 위치에 여러 개의 유전자 발현 cassette를 도입하는 것이 가능하다. 따라서 xylan/xylose 대사에 관련된 endoxylanase (XYLP), ${\beta}$-xylosidase (XYLB), xylose reductase (GRE3) 그리고xylitol dehydrogenase (XYL2)의 효모염색체내에 도입을 시도하였다. 먼저 XYLP, XYLB, GRE3그리고 XYL2 유전자의 효율적인 발현을 위한 promoter를 선별하기 위해 pGMF-GENE과 pAMF-GENE plasmid를 구축하였고, 각 유전자들의 발현에 GAL10 promoter가 적합함을 확인하였다. 다음으로 GAL10p-GENE-GAL7t cassette를 가진 pRS-GENE plasmid (R-YIp)를 구축하여, 반복적 integration 과정과 selective marker의 제거를 통해 각각의 R-YIps를 효모 7번염색체에 순차적으로 도입하였다. R-YIp system을 통해 효모염색체내에 도입된 유전자들은 모두 안정적으로 발현되었고, 활성형의 재조합효소를 생산함을 확인할 수 있었다. 따라서 다수의 외래유전자를 효모염색체내 도입함에 있어 selective marker와 숙주세포 선택의 한계를 R-YIp system을 통해 어느 정도 극복할 수 있을 것이라 기대한다.

Simultaneous and Sequential Integration by Cre/loxP Site-Specific Recombination in Saccharomyces cerevisiae

  • Choi, Ho-Jung;Kim, Yeon-Hee
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제28권5호
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    • pp.826-830
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    • 2018
  • A Cre/loxP-${\delta}$-integration system was developed to allow sequential and simultaneous integration of a multiple gene expression cassette in Saccharomyces cerevisiae. To allow repeated integrations, the reusable Candida glabrata MARKER (CgMARKER) carrying loxP sequences was used, and the integrated CgMARKER was efficiently removed by inducing Cre recombinase. The XYLP and XYLB genes encoding endoxylanase and ${\beta}$-xylosidase, respectively, were used as model genes for xylan metabolism in this system, and the copy number of these genes was increased to 15.8 and 16.9 copies/cell, respectively, by repeated integration. This integration system is a promising approach for the easy construction of yeast strains with enhanced metabolic pathways through multicopy gene expression.

Characterization of the xaiF Gene Encoding a Novel Xylanase-activity- increasing Factor, XaiF

  • Cho, Ssang-Goo;Choi, Yong-Jin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제8권4호
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    • pp.378-387
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    • 1998
  • The DNA sequence immediately following the xynA gene of Bacillus stearothermophilus 236 [about l-kb region downstream from the translational termination codon (TAA) of the xynA gene]was found to have an ability to enhance the xylanase activity of the upstream xynA gene. An 849-bp ORF was identified in the downstream region, and the ORF was confirmed to encode a novel protein of 283 amino acids designated as XaiF (xylanase-activity-increasing factor). From the nucleotide sequence of the xaiF gene, the molecular mass and pI of XaiF were deduced to be 32,006 Da and 4.46, respectively. XaiF was overproduced in the E. coli cells from the cloned xaiF gene by using the T7 expression system. The transcriptional initiation site was determined by primer extension analysis and the putative promoter and ribosome binding regions were also identified. Blast search showed that the xaiF and its protein product had no homology with any gene nor any protein reported so far. Also, in B. subtilis, the xaiF trans-activated the xylanase activity at the same rate as in E. coli. In contrast, xaiF had no activating effect on the co-expressed ${\beta}-xylosidase$ of the xylA gene derived from the same strain of B. stearothermophilus. In addition, the intracellular and extracellular fractions from the E. coli cells carrying the plasmid-borne xaiF gene did not increase the isolated xylanase activity, indicating that the protein-protein interaction between XynA and XaiF was not a causative event for the xylanase activating effect of the xaiF gene.

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Aspergillus niger에 있어서 섬유질 분해효소계의 동질효소 양상에 미치는 기질의 영향 (Influence of Substrates on the Isozyme Patterns of Cellulase and Xylanase Complexes in Aspergillus niger)

  • 노재랑;이영하;정재훈
    • 한국균학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.209-217
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    • 1990
  • Aspergillus niger에 있어서 여러가지 섬유질 기질이 세포내외의 섬유질 분해효소계의 생합성 및 동질효소의 양상에 미치는 영향을 조사하였다. Cellulase 및 xylanase 효소계의 생합성은 사용된 기질에 따라 큰 차이가 있었으며, 특히 cellulase 효소계의 CMCase와 ${\beta}-glucosidase$는 혼합기질의 사용시 효소활성이 증진되는 기질의 공조효과를 보였다. 또한 기질에 따라 섬유질분해효소계 동질효소의 생성 양상이 다르게 나타났으나 세포내외간 동질효소 양상의 차이는 발견되지 않았으며 배양시간에 따른 동질효소의 변화도 없었다. 이러한 결과들은 A. niger의 cellulase 및 xylanase효소계의 생합성은 기질에 의한 효소의 유도 수준에서 상호 연관적으로 조절되어짐을 보여주며, 세포외 효소에서 나타나는 multiple-isozyme의 형성이 합성되어진 효소의 post-secretional modification에 의한 결과라기 보다는 각각의 유전자 발현 결과에 의한 것임을 시사한다.

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