• 제목/요약/키워드: $(GGAT)_4$ sequence

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DNA marker 지문법에 의한 취나물 5종 (청옥취 , 개미취 , 참취 , 수리취 , 곰취)의 비교연구 (Comparative studies of the five edible mountain vegetables by DNA marker fingerprinting)

  • 유기억
    • 한국자원식물학회지
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    • 제9권3호
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    • pp.305-310
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    • 1996
  • 유용 취나물 5종류의 종간 유사도 및 종내 변이를 파악하기 위하여 38개체를 대상으로 PCR 방법을 이용하여 비교분석하였다. 사용된 62가지 primer 중에서 38개체 전체에서 band를 보여준 것은 10가지였고, 이를 통해 얻어진 총 band의 수는 176개로 나타났다. 종내변이는 청옥취가 31.1%에 해당하는 15개의 polymorphic band를 가져 변이가 가장 낮았으며 곰취는 61.1%로 가장 높게 나타났다. 군집분석 결과 조사된 38개체는 유사도 0.93에서 5종의 구분이 가능하였으며 38개체 각각은 유사도 0.62-0.99의 유사성을 갖는 것으로 나타났고 종내변이는 0.93이상으로 높게 나타나 변이가 적은 것으로 나타났다. 이상의 결과에서 PCR방법을 이용한 결과가 취나물 5종류를 구분하는데 유용하게 사용되었으며 군집분석 결과 종내 변이가 매우 낮은 것으로 나타났다.

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Intraspecific variations of the Yam (Dioscorea alata L.) based on external morphology and DNA marker analysis

  • Chang, Kwang-Jin;Yoo, Ki-Oug;Park, Cheol-Ho;Lim, Hak-Tae;Michio Onjo;Park, Byoung-Jae
    • Plant Resources
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    • 제3권3호
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    • pp.211-218
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    • 2000
  • Intraspecific genetic relationship of 19 variation types of the Yam (Dioscorea alata) classified by their external morphological characteristics such as leaf and tuber shape were assessed by DNA using random and specific primer. Twenty two out of 113 primers (100 random[10-mer] primers, two 15 mer [M13 core sequence, and (GGAT)$_4$ sequence]) had been used in PCR-amplification. Only 12 primers, however, were success in DNA amplification in all of the analyzed plants, resulting in 93 randomly and specifically amplified DNA fragments. The analyzed taxa showed very high polymorphisms(69 bands, 71.0 %), allowing individual taxon to be identified based on DNA fingerprinting. Monomorphic bands among total amplified DNA bands of each primer was low under the 50%. Similarity indices between accessions were computed from PCR(polymerase chain reaction) data, and genetic relationships among intraspecific variations were closely related at the levels ranging from 0.66 to 0.90. These DNA data were not matched well with those of morphological characters since they were divided into two major groups at the similarity coefficient value of 0.70. Therefore, Grouping of species into variation types by mainly morphological charactistics was suggested unreasonable.

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도입 마(Dioscorea alata L.)의 특성 분석 (Characteristics of Dioscorea alata L. Introduced from Tropical and Subtropical Regions)

  • 장광진;유기억;박철호;박종인;홍규현;박주현
    • 현장농수산연구지
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    • 제3권1호
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    • pp.48-69
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    • 2001
  • 1997년 부터 한국농업전문학교에서 수집하여 재배되고 있는 마 (Dioscorea alata L.) 계통 중 품질이 우수하고 이용 가치가 기대되는 33개 계통에 대한 특성을 조사하였으며, 형태적 차이를 보이는 19개 계통에 대한 RAPD분석을 실시하였다. 1. 주당 괴경의 전체 무게는 최대 2,147g (No.36), 최소 90g (No.20)으로 평균 610g이었다. 주당 평균 괴경수는 2.8개였으며 최대 4.7개, 최소 1.3개였다. 괴경중은 평균 363g이었으며 최대 1200g, 최소 70g이었다. 2. 괴경의 육질은 백색, 담황색 및 적자색 3가지 패턴을 보였으며, 잎은 녹색, 진녹색 및 담녹색으로 분류되었다. 3. RAPD 분석에 사용된 총 113개 primers 중 12개 primer 만이 모든 분류군에서 증폭되었다. 이를 통하여 93개의 밴드를 얻었으며 69개 밴드는(71.0%) polymorphic 하게 나타났다. 4. 유집분석 결과 19개 계통은 유사도 지수 값 0.66~0.90의 범위로 나타났으며, 크게 2개의 그룹, 즉 인도네시아와 가고시마에서 도입된 8개의 계통이 포함된 그룹과, 유사도지수 0.70~0.90의 범위를 갖는 Nauru, Palau Is., Okinawa와 Papua New Guinea에서 도입된 11 계통이 포함된 그룹으로 대별되었다.