Pseudomonas sp. BCNU 106의 persolvent fermentation에 의한 인디고이드계 색소 생산

Production of Indigoid Pigments by Persolvent Fermentation with Pseudomonas putida BCNU 106

Abstract

산업폐수로부터 분리한 Pseudomonas sp. BCNU 106은 다양한 유기용매를 이용하여 인돌로부터 인디고를 합성할 수 있다. BCNU 106은 높은 수준의 인돌과 다량의 p-xylene, propylbenzene 그리고 mesitylene의 존재 하에서 효과적으로 인디고를 생산했다. 본 연구에서 인디고의 최대수율 조건은 20% (v/w)의 p-xylene과 4 g/l의 인돌인 것으로 확인되었다. 이러한 조건에서 인디고의 수율과 인돌의 전환효율은 각각 315.5 mg/l와 97%로 조사되었다. 그 결과 Pseudomonas sp. BCNU 106은 산업적으로 중요한 인디고 생산을 위한 잠재적인 균주가 될 것으로 판단된다.

Pseudomonas sp. BCNU 106 isolated from industrial wastewater was able to produce indigo from indole by utilizing various organic solvents. BCNU 106 produced indigo effectively when grown in the presence of a large volume of p-xylene, propylbenzene, and mesitylene and a high level of indole. The present study demonstrated that the maximal yield was achieved with 20% (v/w) p-xylene and 4 g/l indole. Under these conditions, the indigo yield and the transformation efficiency of indole were 315.5 mg/l and 97%, respectively. The results suggest that Pseudomonas sp. BCNU 106 might be a potential candidate for industrially important indigo production.

서 론

Indigo는 가장 광범위하게 사용되어온 청색 염료 가운데 하나로 전통적으로는 Polygonum tinctorium, Indiofera tinctoria 및 Isatis indigotica 등 식물에서 추출하여 사용하였다[1, 5]. 그러나 이들 식물에서 생산되는 인디고는 대량 생산이 어렵고 추출에 어려움이 있어 주로 화학적인 방법에 의해 대량생산되고 있으며, 이 과정은 고밀도 COD와 aniline, nitrobenzene 그리고 금속염과 같은 환경오염물질을 발생시키고, 고에너지가 요구된다[13]. 따라서 현재는 친환경적이면서 경제적인 방법으로 indigo를 생산하기 위해 미생물을 이용하려는 연구가 이루어지고 있다. 미생물에 의한 indigo 생산은 naphthalene dioxygenase를 발현하는 E. coli에서 처음 보고되었으며[9], 그 이후 Pseudomonas sp. 및 Acinetobacter sp. 균주에서 indigo 생산에 관해 다수 보고가 되고 있다[3 7]. 이들 indigo 생산 균주들은 탄소원과 에너지원으로 방향족 화합물을 이용하여 기질인 indole 및 tryptophan으로부터 indigo 생산을 촉매하는 oxygenase를 발현하는 것으로 알려져 있어, indigo 생산뿐만 아니라 다양한 생물변환반응에도 적용 가능하여 유용성이 높은 균주로 보고되고 있다[9, 16].

따라서 본 연구에서는 indole을 기질로 indigo를 생산하는 유기용매 내성 Pseudomonas sp. BCNU 106 균주[4]를 이용하여 다양한 방향족 화합물과 indole에 대한 생존력을 조사하였으며, 이들 결과를 바탕으로 indigo 및 indirubin 전환율에 대해 조사하여 보고하고자 한다.

 

재료 및 방법

Indigo 생산 균주의 배양조건

대구공단 일대에서 채취한 폐수 및 토양 시료에서 분리한 toluene 내성 세균인 Pseudomonas sp. BCNU 106 균주를 사용하여 indigo 생산여부를 확인하였다. BCNU 106 균주의 전배양은 LB (tryptone 1％, yeast extract 0.5％, NaCl 1％) 배지를 이용하였고, indigo 및 유도체 생산은 conversion medium (Bacto yeast extract 0.2％, NaCl 1％, (NH4)2SO4 0.05%, MgSO4 10 mM)을 사용하여, 30℃, 160 rpm에서 배양하였다[6].

Two-phase system에서의 생존력 조사

전배양한 균 배양액(O.D600=1) 1 ml는 원심분리(8,000 rpm, 10 min)하고 2번 washing 후, 10 ml conversion medium에 접종하였다. 기질로서 다양한 농도의 Indole (5-320 mg)을 첨가하였고, 5종의 유기용매(p-xylene, diphenylmethane, propylbenzene, toluene, mesitylene)는 배지의 20％로 중층한 후 30℃, 160 rpm에서 24 시간 배양한 뒤에 흡광도(OD 600)를 측정함으로써 생존력을 확인하였다.

Indigo 및 indirubin 전환율 조사

다양한 농도의 indole과 20％ (v/w)의 유기용매를 첨가한 two-phase system에서 24 시간 배양한 후, 원심분리(10,000 rpm, 10 min)하여 배지층과 용매층을 분리하였다. 배지층을 사용하여 필터(0.22 µm)한 후 동량의 ethylaceteate로 추출하고 N2 gas로 농축한 뒤 indole 소비량과 isatin 생산량을 측정하였고, 용매층을 사용하여 무수 MgSO4를 첨가하여 탈수시키고, 농축하여 indigo와 indirubin 생산량을 측정하였다[14, 15]. Indole, indigo, indirubin 및 isatin은 high performance liquid chromatography (HPLC; Shimadzu, Japan)로 ODS-1201-H column (200×4.6 mm)을 사용하여, 이동상으로는 acetonitrile과 0.15％ formic acid (30 to 50:50 to 70 v/v)를, flow rate는 0.6 ml/min 조건으로 분석하였다. Indole, indigo 및 isatin은 Sigma-Aldrich에서 구입하였고, indirubin은 Biomol (Biomol Research Laboratories, Plymouth Meeting, PA, USA)에서 구입하였다. PDA detector를 이용하여 시료주입량을 20 µl로 하여 동일 조건 하에서 표준물질과 비교하여 indole 소비량과 indigo, indirubin과 isatin 생산량을 각각의 최대 흡수 파장 (indole, A270; indigo, A612; indirubin, A542; isatin, A412)에서 정량 분석하였다.

 

결과 및 고찰

대구공단 지역의 토양 및 폐수에서 분리한 Pseudomonas sp. BCNU 106은 기연구에서 생리·생화학적 특징 및 염기서열 분석을 통해 Pseudomonas putida의 근연종이며, BTEX (benzene, toluene, ethylbenzene, xylene)을 포함한 다양한 유기용매에 내성이 높은 세균으로 확인되었다[4]. 본 연구에서는 indole을 기질로 사용하여 indigo 및 그 유도체를 생합성하는 능력 또한 뛰어난 균주임이 확인되었다. 20％의 유기용매로 중층한 최소배지에 0.5-32 g/l의 indole을 첨가하여 24 시간 배양하여 BCNU 106의 생존력을 조사한 결과, 유기용매의 종류와 indole 농도에 따라 최적 생존력 및 indigo 생합성 능력이 다르게 나타났다. Mesitylene을 제외한 4 종의 유기용매에서 0.5-8 g/l의 indole 존재하에서도 균의 증식이 우수했으며, 특히 propylbenzene과 p-xylene을 중층한 배양액에서는 8 g/l의 고농도 indole에서도 indole이 들어있지 않은 대조구에 비해 생육에 크게 차이가 없는 결과를 확인할 수 있었으므로 indole에 대하여 내성이 높은 것으로 확인되었다(Fig. 1). 본 실험결과 BCNU 106 균주는 고농도 indole 내성 균주인 Pseudomonas sp. strain ST-200과 비교하여도 유사하게 높은 indole에 대한 내성을 나타내는 것으로 확인되었다[6].

Fig. 1.Growth of BCNU 106 in the presence of indole (0.5-32 g/l) and 20％ (v/w) various kinds of organic solvents. The growth was measured by optical density at 600 nm after 24 hr incubation at 30℃.

각종 농도의 indole에서의 생존과 indole의 변환 정도는 육안으로 확인할 수 있었으며, indigo와 indirubin 생성 정도도 확인 가능하였다(Fig. 2). Diphenylmethane과 p-xylene에서는 16 g/l 농도의 indole에서 생존가능하였고 indigo와 indirubin을 다소 생성하였으며, 4 g/l와 8 g/l의 indole 존재하에서 가장 많은 indigo와 indirubin을 생성함을 확인할 수 있었다(Fig. 2). 또한 indigo, indirubin 및 그 유도체를 생합성할 수 있는 indole의 농도는 유기용매에 따라 차이가 있었으며, p-xylene 과 diphenylmethane의 경우 0.5 g/l에서 16 g/l로 매우 넓은 농도 범위인 것으로 확인되었고, mesitylene은 0.5 g/l에서 4 g/l, propylbenzne은 1 g/l에서 8 g/l 그리고 toluene은 2 g/l에서 8 g/l인 것으로 나타났다. HPLC를 이용하여 정량분석을 실시한 결과, mesitylene과 propylbenzene은 2 g/l의 indole 첨가시 각각 216.9 mg/l와 205.1 mg/l의 indigo를 생산하였고, p-xylene은 4 g/l의 indole을 첨가했을 때 270.09 mg/l의 indigo를 생산함으로써 생산성이 가장 좋은 것으로 확인되었다. 반면에 indirubin은 0.5 g/l의 상대적으로 저농도 indole과 p-xylene을 첨가했을 때 62.3 mg/l로 생산효율이 좋은 것으로 나타났다(Fig. 3). 최종적으로 indigo 생산 효율이 가장 좋은 p-xylene에 대해 indole의 농도와 시간에 따른 생산량 변화를 알아보기 위해 indigo, indirubin 및 isatin의 생산량과 indole 소비량을 측정하였다(Fig. 4). 4 g/l의 indole을 첨가하여 48시간 배양했을 때 315.5 mg/l의 indigo를 생산하였으며, 96시간까지 수율이 276.3 mg/l로 높은 수준으로 유지되었다. Indirubin은 2 g/의 indole에서 48-72 시간 배양시 54.5 mg/l 로 조사되었으며, indirubin은 p-xylene 존재 하에서는 indole 농도가 낮을수록 효율이 증가하는 것으로 나타났다.

Fig. 2.Production of indigoid pigments from indole by BCNU 106. Indole (0.5-16 g/l) was added to conversion medium overlaid with 2 ml of (A) p-xylene and (B) diphenylmethane.

Fig. 3.The bio-indigo and indirubin production by BCNU 106 on indole in the presence of various organic solvent (bar graph, indigo; line graph, indirubin).

Fig. 4.Production of bio- indigo and indirubin in the presence of indole and p-xylene. BCNU 106 was grown at 30℃ in 10 ml of conversion medium overlaid with 20％ of p-xylene containing (A) 2 g/l, (B) 4 g/l of indole. At time, sample was taken from the organic solvent and water phase of the culture.

한편 isatin은 indigo의 생산 조건에서 낮은 비율로 생산되었으며, indigo 생산량이 서서히 감소하는 48 시간 이후부터 서서히 증가하다가 72 시간 이후로는 다시 감소하는 경향을 보여 산화반응에 의해 isatic acid로 전환됨을 확인할 수 있었다[11]. 한편 기질인 indole은 처음 24 시간 동안에 급격히 감소하는 것으로 나타나 초기 효소반응에 의하여 대부분 소모되는 것으로 확인되었다. Indigo 및 indirubin의 생합성 경로는 indole이 산화되면서 cis-indole-2,3-dihydrodiol이 생성되고, 이 화합물이 산화되어 isatin과 isatic acid를 형성한다. 또한 cis-indole-2,3-dihydrodiol의 자발적인 수소 제거반응에 의해 indoxyl와 oxindole이 생성되며, indoxyl는 공기 중에 산화되면서 indigo가 형성되고 indoxyl와 oxindole에 의해 indirubin이 생성되는 것으로 보고되어 있다[8]. 본 실험에서도 indigo, indirubin 및 isatin이 유사한 합성경로로 생성되는 것으로 추정된다.

Comamonas sp.는 에너지원과 기질로 각각 100 ppm의 naphthalene과 300 mg/l의 indole을 이용하여 205 mg/l의 indigo를 생산하였으며, 1 g/l의 indole 첨가시 indigo 생산량이 급격히 감소하는 것으로 보고되었다[19]. 일반적으로 고농도의 indole은 그 독성으로 인해 indigo의 생산을 현저하게 감소시키나, BCNU 106은 8 g/l의 고농도 indole을 첨가시에도 균의 증식이 우수했으며, indigo 생산효율도 뛰어난 것으로 나타났다. Acinetobacter sp. PP-2는 203 mg/l의 indigo 최적생산 조건이 158 ppm의 phenol과 205 mg/l의 indole인 것으로 보고되고 있으며[16], Pseudomonas sp. QM은 최적조건으로 phenol과 indole을 이용하여 27.2 mg/l의 indigo를 생산하는 것으로 보고되고 있다[17]. 따라서 Pseudomonas sp. BCNU 106은 호기적인 조건에서 30℃, 48 시간 배양시 20％의 p-xylene 존재 하에서 4 g/l의 indole을 이용하여 315.5 mg/l의 indigo를 생산함으로써 생합성 능력이 매우 뛰어난 균주임을 확인할 수 있었다. 또한 indole 유도체의 주요 생성물인 indigo와 indirubin 이외에도 다양한 pigments가 관찰되어 배양온도, 기질농도와 용매 등에 따라 이들 indole 유도체의 생산을 조절할 수 있을 것으로 판단되어, 보다 자세한 연구를 통해 산업적으로 다양한 indole 유도체 생성에 BCNU 106 균주를 활용 가능할 것으로 판단된다. 현재 indole 유도체의 다양한 기능에 대한 연구가 활발히 이뤄지고 있으며, 최근 alkaloid indigo의 알코올성 산화적 손상에 대한 기능이 보고되었고[10], isatin과 그 유도체는 항고혈압, 항균, 항종양 및 항염증 등의 기능이 보고되어 의약화학 분야에서 활발히 응용되고 있으며[2], indirubin은 백혈병을 비롯한 항암치료, 알쯔하이머와 같은 뇌조직 퇴화 관련 질병 치료에 효과가 매우 높은 것으로 알려져있다[8 12].

한편 유기용매 내성Pseudomonas sp. BCNU 106 균주를 사용한 persolvent fermentation에 의한 indole 변환반응은 독성물질인 indole 변환반응에 유기용매를 사용함으로써 고농도의 indole이 배지에는 적게 공급되도록 하고 있다[9, 12, 18]. 특히 BCNU 106 균주는 two-phase system에서 지속적으로 생물변환반응을 수행하면서도 세포독성은 회피할 수 있는 내성 균주로서 보다 많은 기질을 이용한 변환 반응을 수행하는데 유용한 생물자원이므로 산업적인 면에서 보다 광범위한 활용방안에 대한 추가적인 연구가 요구된다.