Journal of Mushroom (한국버섯학회지)

The Korean Society of Mushroom Science (한국버섯학회)
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Phylogenetic relationships of Armillaria spp. on the basis of ITS region sequences

rDNA의 ITS 부위 염기서열 분석에 의한 Armillaria 속 수집 균주의 유전적인 유연관계 분석

  • Oh, Jin-A (Division of Chemical Safety, National Academy of Agricultural Science, RDA) ;
  • Lee, Chan-Jung (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, RDA) ;
  • Cheong, Jong-Chun (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, RDA) ;
  • Yoo, Young-Bok (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, RDA)
  • 오진아 (국립농업과학원 화학물질안전과) ;
  • 이찬중 (국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 정종천 (국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 유영복 (국립원예특작과학원 버섯과)
  • Received : 2012.09.03
  • Accepted : 2012.09.21
  • Published : 2012.09.30
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Abstract

Armillaria spp are well known as a symbiotic fungus with Gastrodia elata. This study was carried out to identify and analyze the genetic relationships among 83 strains of Armillaria spp.. The amplified internal transcribed spacer(ITS) region of the rDNA was about 500~750 bp long and identified by 9 strains; A. mellea, A. tabescens, A. ostoyae, A. gallica, A. novae-zenlandia, A. cepistipes, A. nabsnona, A. gemina, A. sinapina. Sequence analysis showed that 52% of strains were different with original identification. A. gallica, A. cepistipes and A. gemina were so close phylogenetic relationship, that was difficult to classify using ITS region. In A. gallica, 12 strains including ASI10104 were showed a close phylogenetic relationship with A. gallica, A. cepistipes and A. gemina. ASI10017 and ASI10114 were classified as the A. sinapina group, ASI10045 was the A. borealis group, ASI10002 and ASI10025 were the A. ostoyae group. So more studies need for more accurate identification and determine the phylogenetic relationships of Armillaria spp.

수집한 83개의 뽕나무버섯속 균주의 rDNA의 ITS 영역을 증폭하여 염기서열을 분석한 결과 수집한 균주목록과 종이 다르게 동정된 균주가 52%였으며. 같은 종으로 분류한 균주들 간에도 균사 및 균사체의 배양 특성에 많은 차이를 보였다. 수집 균주간의 유전적인 유연관계 분석 결과 A. tabescens, A. mellea, A. novae-zelandia, A. gallica, A. ostoyae 등으로 분류되었고, A. gallica, A, cepistipes, A, gemina는 매우 가까운 유연관계를 보여 ITS 유전자 수준에서 종을 동정하기는 어려웠다. ASI10104 등 12균주는 A. gallica, A, cepistipes, A, gemina와 매우 가까운 유연관계를 보였으며, ASI10017과 ASI10114는 A. sinapina, ASI10045는 A. borealis, ASI10002와 ASI10025는 A. ostoyae와 같은 그룹으로 분류되었다. 따라서 뽕나무버섯속 균주에 대한 보다 정확한 동정을 위해서는 보다 많은 종류의 유전적인 분석이 필요할 것으로 판단된다.

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