Acknowledgement
Supported by : 농촌진흥청
References
- International Chicken Genome Sequencing Consortium. 2004. Sequence and comparative analysis of the chicken genome provide unique perspectives on vertebrate evolution. Nature 432: 695-716. https://doi.org/10.1038/nature03154
- Gibbs R. A., G. M. Weinstock, M. L. Metzker, D. M. Muzny, E. J. Sodergren, S. Scherer, G. Scott, D. Steffen, K. C. Worley, P. E. Burch, G. Okwuonu, S. Hines, L. Lewis, C. DeRamo, O. Delgado, S. Dugan-Rocha, G. Miner, M. Morgan, A. Hawes, R. Gil., Celera, R. A. Holt, M. D. Adams, P. G. Amanatides, H. Baden-Tillson, M. Barnstead, S. Chin, C. A. Evans, S. Ferriera, C. Fosler, A. Glodek, Z. Gu, D. Jennings, C. L. Kraft, T. Nguyen, C. M. Pfannkoch, C. Sitter, G. G. Sutton, J. C. Venter, T. Woodage, D. Smith, H. M. Lee, E. Gustafson, P. Cahill, A. Kana, L. Doucette-Stamm, K. Weinstock, K. Fechtel, R. B. Weiss, D. M. Dunn, E. D. Green, R. W. Blakesley, G. G. Bouffard, P. J. De Jong, K. Osoegawa, B. Zhu, M. Marra, J. Schein, I. Bosdet, C. Fjell, S. Jones, M. Krzywinski, C. Mathewson, A. Siddiqui, N. Wye, J. McPherson, S. Zhao, C. M. Fraser, J. Shetty, S. Shatsman, K. Geer, Y. Chen, S. Abramzon, W. C. Nierman, P. H. Havlak, R. Chen, K. J. Durbin, A. Egan, Y. Ren, X. Z. Song, B. Li, Y. Liu, X Qin, S. Cawley, K. C. Worley, A. J. Cooney, L. M. D'Souza, K. Martin, J. Q. Wu, M. L. Gonzalez-Garay, A. R. Jackson, K. J. Kalafus, M. P. McLeod, A. Milosavljevic, D. Virk, A. Volkov, D. A. Wheeler, Z. Zhang, J. A. Bailey, E. E. Eichler, E. Tuzun, E. Birney, E. Mongin, A. Ureta-Vidal, C. Woodwark, E. Zdobnov, P. Bork, M. Suyama, D. Torrents, M. Alexandersson, B. J. Trask, J. M. Young, H. Huang, H. Wang, H. Xing, S. Daniels, D. Gietzen, J. Schmidt, K. Stevens, U. Vitt, J. Wingrove, F. Camara, M. Mar Albà, J. F. Abril, R. Guigo, A. Smit, I. Dubchak, E. M. Rubin, O. Couronne, A. Poliakov, N. Hübner, D. Ganten, C. Goesele, O. Hummel, T. Kreitler, Y. A. Lee, J. Monti, H. Schulz, H. Zimdahl, H. Himmelbauer, H. Lehrach, H. J. Jacob, S. Bromberg, J. Gullings-Handley, M. I. Jensen-Seaman, A. E. Kwitek, J. Lazar, D. Pasko, P. J. Tonellato, S. Twigger, C. P. Ponting, J. M. Duarte, S. Rice, L. Goodstadt, S. A. Beatson, R. D. Emes, E. E. Winter, C. Webber, P. Brandt, G. Nyakatura, M. Adetobi, F. Chiaromonte, L. Elnitski, P. Eswara, R. C. Hardison, M. Hou, D. Kolbe, K. Makova, W. Miller, A. Nekrutenko, C. Riemer, S. Schwartz, J. Taylor, S. Yang, Y. Zhang, K. Lindpaintner, T. D. Andrews, M. Caccamo, M. Clamp, L. Clarke, V. Curwen, R. Durbin, E. Eyras, S. M. Searle, G. M. Cooper, S. Batzoglou, M. Brudno, A. Sidow, E. A. Stone, J. C. Venter, B. A. Payseur, G. Bourque, C. Lopez-Otín, X. S. Puente, K. Chakrabarti, S. Chatterji, C. Dewey, L. Pachter, N. Bray, V. B. Yap, A. Caspi, G. Tesler, P. A. Pevzner, D. Haussler, K. M. Roskin, R. Baertsch, H. Clawson, T. S. Furey, A. S. Hinrichs, D. Karolchik, W. J. Kent, K. R. Rosenbloom, H. Trumbower, M. Weirauch, D. N. Cooper, P. D. Stenson, B. Ma, M. Brent, M. Arumugam, D. Shteynberg, R. R. Copley, M. S. Taylor, H. Riethman, U. Mudunuri, J. Peterson, M. Guyer, A. Felsenfeld, S. Old, S. Mockrin, F. Collins, and Rat Genome Sequencing Project Consortium. 2004. Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution. Nature 428: 493-521. https://doi.org/10.1038/nature02426
- Hayashizaki Y. 2003a. RIKEN mouse genome encyclopedia. Mech. Ageing Dev1 24: 93-102. https://doi.org/10.1016/S0047-6374(02)00173-2
- Hayashizaki Y. 2003b. The Riken mouse genome encyclopedia project. C R Biol 326: 923- 929. https://doi.org/10.1016/j.crvi.2003.09.018
- Karger A. E. 1996. Separation of DNA sequencing fragments using an automated capillary electrophoresis instrument. Electrophoresis 17: 144-151. https://doi.org/10.1002/elps.1150170124
- Kleparnik K., F. Foret, J. Berka, W. Goetzinger, A. W. Miller, and B. L. Karger. 1996. The use of elevated column temperature to extend DNA sequencing read lengths in capillary electrophoresis with replaceable polymer matrices. Electrophoresis 17: 1860-1866. https://doi.org/10.1002/elps.1150171210
- Maxam A. M., and W. Gilbert . 1977. A new method for sequencing DNA. Proc Natl Acad Sci USA. 74: 560-564. https://doi.org/10.1073/pnas.74.2.560
- Sachs D. H. 1994. The pig as a potential xenograft donor. Vet Immunol Immunopathol 43: 185-191. https://doi.org/10.1016/0165-2427(94)90135-X
- Sanger F., G. M. Air, B. G. Barrell, N. L. Brown, A. R. Coulson, C. A. Fiddes, C. A. Hutchison, P. M. Slocombe, and M. Smith. 1977. Nucleotide sequence of bacteriophage phi X174 DNA. Nature 265: 687-695. https://doi.org/10.1038/265687a0
- Shibata K., M. Itoh, K. Aizawa, S. Nagaoka, N. Sasaki, P. Carninci, H. Konno, J. Akiyama, K. Nishi, T. Kitsunai, H. Tashiro, M. Itoh, N. Sumi, Y. Ishii, S. Nakamura, M. Hazama, T. Nishine, A, Harada, R. Yamamoto, H. Matsumoto, S. Sakaquchi, T. Ikeqami, K. Kashiwaqi, S. Fujiwake, K. Inoue, and Y. Toqawa. 2000. RIKEN integrated sequence analysis (RISA) system-384-format sequencing pipeline with 384 multicapillary sequencer. Genome Res 10: 1757-1771. https://doi.org/10.1101/gr.152600
- Watanabe H., A. Fujiyama, M. Hattori, T. D. Taylor, A. Toyoda, Y. Kuroki, H. Noguchi, A. BenKahla, H. Lehrach, R. Sudbrak, M. Kube, S. Taenzer, P. Galgoczy, M. Platzer, M. Scharfe, G. Nordsiek, H. Blocker, I. Hellmann, P. Khaitovich, S. Paabo, R. Reinhardt, H. J. Zheng, X. L. Zhang, G. F. Zhu, B. F. Wang, G. Fu, S. X. Ren, G. P. Zhao, Z. Chen, Y. S. Lee, J. E. Cheong, S. H. Choi, K. M. Wu, T. T. Liu, K. J. Hsiao, S. F. Tsai, C. G. Kim, S. OOta, T. Kitano, Y. Kohara, N. Saitou, H. S. Park, S. Y. Wang, M. L. Yaspo, and Y. Sakaki. 2004. DNA sequence and comparative analysis of chimpanzee chromosome 22. Nature 429: 382-388. https://doi.org/10.1038/nature02564
- Waterston R. H., K. Lindblad-Toh, E. Birney, J. Rogers, J. F. Abril, P. Agarwal, R. Agarwala, R. Ainscough, M. Alexandersson, P. An, S. E. Antonarakis, J. Attwood, R. Baertsch, J. Bailey, K. Barlow, S. Beck, E. Berry, B. Birren, T. Bloom, P. Bork, M. Botcherby, N. Bray, M. R. Brent, D. G. Brown, S. D. Brown, C. Bult, J. Burton, J. Butler, R. D. Campbell, P. Carninci, S. Cawley, F. Chiaromonte, A. T. Chinwalla, D. M. Church, M. Clamp, C. Clee, F. S. Collins, L. L. Cook, R. R. Copley, A. Coulson, O. Couronne, J. Cuff, V. Curwen, T. Cutts, M. Daly, R. David, J. Davies, K. D. Delehaunty, J. Deri, E. T. Dermitzakis, C. Dewey, N. J. Dickens, M. Diekhans, S. Dodge, I. Dubchak, D. M. Dunn, S. R. Eddy, L. Elnitski, R. D. Emes, P. Eswara, E. Eyras, A. Felsenfeld, G. A. Fewell, P. Flicek, K. Foley, W. N. Frankel, L. A. Fulton, R. S. Fulton, T. S. Furey, D. Gage, R. A. Gibbs, G. Glusman, S. Gnerre, N. Goldman, L. Goodstadt, D. Grafham, T. A. Graves, E. D. Green, S. Gregory, R. Guigó, M. Guyer, R. C. Hardison, D. Haussler, Y. Hayashizaki, L. W. Hillier, A. Hinrichs, W. Hlavina, T, Holzer, F. Hsu, A. Hua, T. Hubbard, A. Hunt, I. Jackson, D. B. Jaffe, L. S. Johnson, M. Jones, T. A. Jones, A. Joy, M. Kamal, E. K. Karlsson, D. Karolchik, A. Kasprzyk, J. Kawai, E. Keibler, C. Kells, W. J. Kent, A. Kirby, D. L . Kolbe, I. Korf, R. S. Kucherlapati, E. J. Kulbokas, D. Kulp, T. Landers, J. P. Leger, S. Leonard, I. Letunic, R. Levine, J. Li, M. Li, C. Lloyd, S. Lucas, B. Ma, D. R. Maglott, E. R. Mardis, L. Matthews, E. Mauceli, J. H. Mayer, M. McCarthy, W. R. McCombie, S. McLaren, K. McLay, J. D. McPherson, J. Meldrim, B. Meredith, J. P. Mesirov, W. Miller, T. L. Miner, E. Mongin, K. T. Montgomery, M. Morgan, R. Mott, J. C. Mullikin, D. M. Muzny, W. E. Nash, J. O. Nelson, M. N Nhan, R. Nicol, Z. Ning, C. Nusbaum, M. J. O'Connor, Y. Okazaki, K. Oliver, E. Overton- Larty, L. Pachter, G. Parra, K. H. Pepin, J. Peterson, P. Pevzner, R. Plumb, C. S. Pohl, A. Poliakov, T. C. Ponce, C. P. Ponting, S. Potter, M. Quail, A. Reymond, B. A. Roe, K. M. Roskin, E. M. Rubin, A. G. Rust, R. Santos, V. Sapojnikov, B. Schultz, J. Schultz, M. S. Schwartz, S. Schwartz, C. Scott, S. Seaman, S. Searle, T. Sharpe, A. Sheridan, R. Shownkeen, S. Sims, J. B. Singer, G. Slater, A. Smit, D. R. Smith, B. Spencer, A. Stabenau, N. Stange-Thomann, C. Sugnet, M. Suyama, G. Tesler, J. Thompson, D. Torrents, E. Trevaskis, J. Tromp, C. Ucla, A. Ureta-Vidal, J. P. Vinson, A. C. Von Niederhausern, C. M. Wade, M. Wall, R. J. Weber, R. B. Weiss, M. C. Wendl, A. P. West, K. Wetterstrand, R. Wheeler, S. Whelan, J. Wierzbowski, D. Willey, S. Williams, R. K. Wilson, E. Winter, K. C. Worley, D. Wyman, S. Yang, S. P. Yang, E. M. Zdobnov, M. C. Zody, E. S. Lander, and Mouse Genome Sequencing Consortium. 2002. Initial sequencing and comparative analysis of the mouse genome. Nature 420: 520-525. https://doi.org/10.1038/nature01262