Bulletin of the Korean Chemical Society

Korean Chemical Society (대한화학회)
권호 표지
DOI QR코드

DOI QR Code

Electronic Properties and Conformation Analysis of Phytochromobilins, Chromophore in Phytochrome

  • Kim, Cheol-Ju (Department of Chemistry, Chonbuk National University) ;
  • Yoo, Dong-Jin (Department of Chemistry, Seonam University)
  • Published : 2008.09.30
Download PDF
⟨ Previous Next ⟩

Abstract

Keywords

References

  1. Eichenberg, K.; Baeurle, I.; Paulo, N.; Sharrock, R. A.; Ruediger, W.; Schaefer, E. FEBS Letts. 2000, 470, 107 https://doi.org/10.1016/S0014-5793(00)01301-6
  2. Quail, P. H. Annu. Rev. Genet. 1995, 25, 389 https://doi.org/10.1146/annurev.ge.25.120191.002133
  3. Kneip, C.; Mosley, D.; Hildebrandt, P.; Gartner, W.; Braslavsky, S. E.; Schaffner, K. FEBS Letts. 1997, 414, 23 https://doi.org/10.1016/S0014-5793(97)00969-1
  4. Kneip, C.; Schlamann, W.; Hildebrandt, P.; Braslavsky, S. E.; Schaffner, K. FEBS Letts. 2000, 482, 256
  5. Matysik, J.; Hildebrandt, P.; Schlamann, W.; Braslavsky, S. E.; Schaffner, K. Biochemistry 1995, 34, 10497 https://doi.org/10.1021/bi00033a023
  6. Schmidt, P.; Westphal, U. H.; Worm, K.; Braslavsky, S. E.; Gartner, W.; Schaffner, K. J. Photochem. Photobiol. B: Biology 1996, 34, 73 https://doi.org/10.1016/1011-1344(95)07269-1
  7. Wagner, J. R.; Brunzelle, J. S.; Forest, K. T.; Vierstra, R. D. Nature 2005, 438, 325 https://doi.org/10.1038/nature04118
  8. Foerstendorf, H.; Mummert, E.; Schaefer, E.; Scheer, H.; Siebert, F. Biochemistry 1996, 35, 10793 https://doi.org/10.1021/bi960960r
  9. Kneip, C.; Hildebrandt, P.; Schlamann, W.; Braslavsky, S. E.; Mark, F.; Schaffner, K. Biochemistry 1999, 38, 15185 https://doi.org/10.1021/bi990688w
  10. Andel, F.; Lagarias, J. C.; Mathies, R. A. Biochemistry 1996, 35, 15997 https://doi.org/10.1021/bi962175k
  11. Borg, O. A.; Durbeej, B. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 11554 https://doi.org/10.1021/jp0727953
  12. von Thor, J. J.; Mackeen, M.; Kuprov, I.; Dwek, R. A.; Wormald, M. R. Biophys. J. 2006, 91, 1811 https://doi.org/10.1529/biophysj.106.084335
  13. Evans, K.; Grossmann, J. G.; Fordham-Sketton, A.; Papiz, M. Z. J. Mol. Biol. 2006, 346, 655
  14. Gorb, L.; Korkin, A.; Leszczynski, J. J. Mol. Struct. (Theochem) 1998, 454, 217 https://doi.org/10.1016/S0166-1280(98)00292-9
  15. Gorb, L.; Korkin, A.; Leszczynski, J.; Varneck, A.; Mark, F. J. Mol. Struct. (Theochem) 1998, 425, 137 https://doi.org/10.1016/S0166-1280(97)00165-6
  16. Marai, C. N. J.; Chass, A. A.; Doust, A. B.; Scholes, G. D. J. Mol. Struct. (Theochem) 2004, 680, 219 https://doi.org/10.1016/j.theochem.2004.04.040
  17. Korkin, A.; Merk, F.; Schaffner, K.; Gorb, L. J. Mol. Struc. (Theochem) 1996, 388, 121 https://doi.org/10.1016/S0166-1280(96)80026-1
  18. Zahedi, M.; Shaabani, A.; Safari, N. J. Mol. Struct. (Theochem) 1998, 452, 125 https://doi.org/10.1016/S0166-1280(98)00141-9
  19. Magdo, H.; Nemeth, K.; Mark, F.; Hidebrandt, P.; Schaffner, K. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 289 https://doi.org/10.1021/jp983101g
  20. Mroginsky, M. A.; Murgida, D. H.; Hidebrandt, P. Acc. Chem. Res. 2007, 40, 258 https://doi.org/10.1021/ar6000523
  21. Remberg, A.; Ruddat, A.; Braslavsky, S.; Gartner, W.; Schaffner, K. Biochemistry 1998, 37, 9983 https://doi.org/10.1021/bi980575x
  22. Lee, H. M.; Kim, J.; Kim, C. J.; Kim, K. S. J. Chem. Phys. 2002, 116, 6549 https://doi.org/10.1063/1.1459705
  23. Baik, J.; Kim, J.; Kim, K. S. J. Chem. Phys. 1999, 110, 9116 https://doi.org/10.1063/1.478833
  24. Majumdar, D.; Kim, J. J. Chem. Phys. 2000, 112, 101 https://doi.org/10.1063/1.480565
  25. Majumdar, D.; Kim, K. S. J. Chem. Phys. 2000, 113, 5259 https://doi.org/10.1063/1.1290016
  26. Lee, H. M.; Kim, K. S. J. Chem. Phys. 2001, 114, 461
  27. Kim, C. J. Bull. Korean Chem. Soc. 2002, 23, 330 https://doi.org/10.5012/bkcs.2002.23.2.330
  28. Hong, S. Y.; Marynick, D. S. Macromolecules 1992, 25, 3591 https://doi.org/10.1021/ma00039a045
  29. Ridley, J.; Zerner, M. C. Theor. Chim. Acta 1973, 32, 111 https://doi.org/10.1007/BF00528484
  30. Zerner, M. C.; Loew, G. H.; Kirchner, R. F.; Mueller-Westerhoff, U. T. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 589 https://doi.org/10.1021/ja00522a025
  31. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision B.05; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2003
  32. Gervasio, L.; Gardini, M.; Salvi, R.; Schettino, V. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 2131 https://doi.org/10.1021/jp9724636
  33. Boruck, B.; van Stetten, D.; Seibeck, S.; Lamparter, T.; Michael, N.; Mroginsk, M. A.; Otto, H.; Murgida, D. H.; Heyn, M. P.; Hidebrandt, P. J. Biol. Chem. 2005, 280, 34358 https://doi.org/10.1074/jbc.M505493200
  34. Mora, M. E.; Bar, S. E.; Awruch, J.; Delfino, J. M. Bioorganic & Med. Chem. 2003, 11, 4661 https://doi.org/10.1016/S0968-0896(03)00479-6
  35. Koglin, M.; Behrends, S. Biochem. Pharm. 2002, 64, 109 https://doi.org/10.1016/S0006-2952(02)01056-0
  36. Belletete, M.; Mazerolle, L.; Desrosiers, N.; Leclere, M.; Durocher, G. Macromolecules 1995, 28, 8587 https://doi.org/10.1021/ma00129a018
  37. Dicesare, N.; Belletete, M.; Leclere, M.; Durocher, G. J. Mol. Struct. (Theochem) 1999, 467, 259 https://doi.org/10.1016/S0166-1280(99)00002-0
  38. Dicesare, N.; Belletete, M.; Raymond, F.; Leclere, M.; Durocher G. J. Phys. Chem. 1997, A101, 776
  39. Dicesare, N.; Belletete, M.; Leclere, M.; Durocher, G. J. Phys. Chem. 1998, A102, 5142
  40. Kneip, C.; Hildebrandt, P.; Schlamann, W.; Nemeth, K.; Mark, F.; Schaffner, K. Chem. Phys. Lett. 1999, 311, 479 https://doi.org/10.1016/S0009-2614(99)00868-4
  41. Dabbagh, H. A.; Chemahini, A. R. N.; Madaresi-Alam, A. R. M. Bull. Korean Chem. Soc. 2005, 26, 1229 https://doi.org/10.5012/bkcs.2005.26.8.1229
  42. Lee, M. J.; Kim, D. H. Bull. Korean Chem. Soc. 2006, 27, 39 https://doi.org/10.5012/bkcs.2006.27.1.039
  43. Staub, J. M.; Deng, X.-W. Photochem. Photobiol. 1996, 64, 897 https://doi.org/10.1111/j.1751-1097.1996.tb01853.x
  44. Smith, H. Annu. Rev. Plant. Physiol. Mol. Biol. 1995, 167, 330
  45. Schmidt, P.; Westphal, U. H.; Worm, K.; Braslavsky, S. E.; Gartner, W.; Schaffner, K. J. Photochem. Photobiol. B: Biology 1996, 34, 73 https://doi.org/10.1016/1011-1344(95)07269-1
  46. Buchler, R.; Hermann, G.; Lap, D. V.; Rentsch, S. Chem. Phys. Lett. 1995, 233, 514 https://doi.org/10.1016/0009-2614(94)01496-I
  47. Tokutomi, S.; Sugimoto, T.; Mimuro, M. Phothochem. Photobiol. 1992, 56, 542
  48. Jang, S.; Jin, S. I.; Park, C. R. Bull. Korean Chem. Soc. 2007, 28(12) 2343 https://doi.org/10.5012/bkcs.2007.28.12.2343