A Systematic Relationship of the Korean Symplocaceae Based on RAPD analysis

RAPD에 의한 한국산 노린재나무과 식물의 유연관계 분석

  • 박상홍 (대전대학교 생명과학과) ;
  • 이중구 (한국생명공학연구원 천연물의약연구센터) ;
  • 김주환 (대전대학교 생명과학과)
  • Received : 2007.05.07
  • Accepted : 2007.08.31
  • Published : 2007.09.30

Abstract

In order to estimate the genetic relationships among four taxa of Korean Symplocaceae and their regional populations, RAPDs analysis was performed. The length of the amplified DNA fragments ranged from 150 to 1,900 bp. Ninety-two RAPD bands were scored for 11 primers and the genetic distance was calculated with by Nei-Li's genetic dissimilarity. Deciduous and evergreen groups were clearly separated in the UPGMA analysis. Symplocos coreana was clustered as a distinct group, and S. sawafutagi and S. tanakana were also clustered at specific level, respectively. The RAPD data was useful to cognize the genetic variation and to discuss the relationships among Korean Symplocaceae

한국산 노린재나무과의 종간 및 지역별 개체군 집단간의 유연관계를 객관적으로 분석하고자 자생지와 식물원에서 채집된 4분류군 23집단을 대상으로 RAPD 연구를 수행하였다. PCR과정을 통하여 증폭된 RAPD 절편들은 150bp에서 1,900bp 사이의 구간에서 주로 관찰되었으며 총 11개의 oligoprimer를 이용한 효소중합반응에서 92개의 유전적 표식밴드를 확인할 수 있었고 Nei-Li의 유전적 거리지수를 이용하여 분석하였다. 또한 이러한 자료에 근거하여 종간에 대한 UPGMA 유집분석 실시하였다. RAPD 분석결과를 기초로 UPGMA방법에 의한 유집분석을 수행한 결과 한국산 노린재나무과의 낙엽성 분류군과 상록성 본류군의 뚜렷한 유집군을 형성하였다. 또한 낙엽성 분류군에서 지역별 개체군 간의 유연관계보다 종간 유연관계가 밀접한 것으로 조사되었으며 섬노린재 개체군들은 독립적인 유집군을 형성하였고 노린재나무와 검노린재는 각기 다른 유집군을 형성하였다. 본 연구에서 사용한 RAPD 분석방법은 한국산 노린재나무과의 종간 유연관계을 파악하기 위한 매우 유용한 것으로 나타났다.

Keywords

Acknowledgement

Supported by : 환경부, 과학기술부

References

  1. Brand, A. 1901. SymPlocaceae. Das Pflanzenreich 6. Wilhelm Engelmann, Leipzig
  2. Cronquist, A. 1981. An Intergrated System of Classification of Flowering Plants. Columbia University Press, New York
  3. Doyle. J. J. and J. L. Doyle. 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochem. Bull. 19: 11-15
  4. Hemsley W. B. and F. B. Forbes 1889. Styraceae. Bot. J. Linn. Soc. 26: 72-75
  5. Miquel, F.A.G. 1867. Symplocos. Ann. Mus. Lugduno-Batavi 3: 101-103
  6. Mori, T. 1921. An. Enumeration of Plants hitherto Known From Corea. Gov. Chos
  7. Nagamasu, H. 1993. The Symplocaceae of Japan. Contrib. Biol. Lab. Kyoto Univ. 28:173-260
  8. Nakai, T. 1911. Flora Koreana II. J. Coll. Sci. Imp. Uni. Tokyo 31: 85
  9. Nakai, T. 1914. Saishu-to Narabini Kwan-to Shokubutsu Hokoku-sho. [Flora of Saishu and Kwan-Islands (Quelpaert)], 1 :1-156
  10. Nakai, T. 1915. Chiisan Shokobutsu Chosa Hokoku-sho 1-98
  11. Nakai, T. 1918. Notulae Plants Japonae et Korea XVIII. Bot. Mag. (Tokyo). 32: 227-228
  12. Nei, M. 1972. Genetic distance between populations. Amer. Nat. 106: 283-292 https://doi.org/10.1086/282771
  13. Nei, M. and W. H. Li. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proc. Natl, Acad. Sci. USA 76: 5269-5273
  14. Nooteboom, H.P. 1975. Revision of the Symplocaceae of the Old World. New Caledonia excepted Leid. Bot. ser. vol. 1. Universitaire Pers Leiden
  15. Ohwi, J. 1965. Flora of Japan. Smith. Inst. Washington. D. C. Pp.: 725-727
  16. Palibin, J. 1898. Symplocos crataegotdes. Consp. Fl. Kor. Vol. 2
  17. Park. S. H. 2002. A Taxonomic Study of Symplocaceae in Korea. MS Thesis. Daejeon. Univ Rehder. A. 1916. Symplocaceae. Pl. Wils. 2: 593-599
  18. Schneider, C. K. 1911. Illustriertes Handbuch der Laubholzkunde Jena, 2: 576-577
  19. Swofford. D. L. 2001. PAUP*. Phylogenetic Analysis Using Parsimonyt(*and other methods), version 4.0b8. Simmer. Sunderland
  20. Park. S. H. 2002. A Taxonomic Study of Symplocaceae in Korea. MS Thesis. Daejeon. Univ Rehder. A. 1916. Symplocaceae. Pl. Wils. 2: 593-599
  21. 안학수, 이춘녕, 박수현. 1982. 한국농식물자원명감. 일조각, 서울