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Analysis of rDNA ITS Region from Trametes spp. in Kangwon Province, Korea

강원도 지역 구름버섯균의 rDNA의 ITS 부위 염기서열 분석

  • 이미정 (강릉대학교 자연과학대학 생물학과) ;
  • 전상철 (강릉대학교 자연과학대학 생물학과) ;
  • 황일기 (강릉대학교 자연과학대학 생물학과) ;
  • 최한구 (강릉대학교 자연과학대학 생물학과) ;
  • 김규중 (강릉대학교 자연과학대학 생물학과)
  • Published : 2005.06.30

Abstract

Nineteen strains of Trametes species were collected from the area of Kangwon Province, Korea. They have a variety of color hands and line-up markings on fruit bodies. Most strains were categorized into four types based on color bands, that is, dark brown, light brown, dark gray and light gray. They also have line-up marking shapes from sparse to compact on fruit bodies. In this study, we tried to investigate the relationship between the genetic variation and morphological appearance of these species using the nuclear ribosomal ITS1-5.8S-ITS2 region sequence, we used nineteen strains collected in nature and four species of five standard strains (T. versicolor KCTC16781, KCTC26203, T. villosa KCTC06866, T. suaveolens KCTC26205 and T. hirusta KCTC26200). The data of ITS sequences indicated that nineteen strains of T. versicolor have the difference of $1{\sim}6$ base pairs, comparing with standard strains of T. versicolor KCTC16781, and KCTC26203. Phylogenetic analysis of the Trametes species showed that they grouped into a wide range of single clade. Standard strains except T. versicolor KCTC16781 and KCTC26203, formed separated subgroup.

본 연구는 강원도 지역에서 채집한, 구름버섯균으로 예상되는 19종의 실험균주의 외부형태와 내부구조의 특징을 파악하여 동정하고, 구름버섯균(Trametes versicolor)의 형태적 특징과 rDNA상의 ITS염기서열간의 상관관계 유무를 확인하기 위하여 Trametes versicolor와 동일 속(Genus)에 속하며 계통학적 유연관계가 가까운 Trametes villosa KCTC06866, Trametes suaveolens KCTC 26205, Trametes hirusta KCTC26200, Trametes versicolor KCTC16781 및 KCTC26203의 4종-5균주와 함께 rDNA의 Internal Transcribed Spacers(ITS1 과 ITS2)영역의 염기서열을 비교 분석하였다. 분석결과, 채집된 실험균주는 Trametes versicolor KCTC16781 및 KCTC26203과의 염기차이가 $0{\sim}6$개로 매우 유사한 근연한 양상을 나타내었고 계통도를 분석한 결과, 구름버섯으로 예상된 실험균주들과 Trametes versicolor 종들이 단계통군을 이루어 실험균주는 모두 동일종으로 확인되었으며, Trametes hirusta KCTC26200, Trametes suaveolens KCTC26205 그리고 Trametes villosa KCTC06866는 측계통을 이루었다. 채집된 19종의 균주는 외형상 다양한 채색과 무늬를 갖고 있으나 ITS1과 ITS2 영역의 염기서열을 분석한 계통수에서는 Trametes versicolor간의 색깔이나 무늬는 ITS1 및 ITS2의 염기서열과는 직접적인 유연관계가 없었다.

Keywords

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