Journal of Animal Science and Technology

Korean Society of Animal Sciences and Technology (한국축산학회)
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Genetic Variation and Population Specific Mitochondrial DNA Haplotype Found in the Jeju Native Pig Population

제주재래돼지 집단서 집단특이적 mtDNA Haplotype과 유전적 다양성

  • Han, S.H. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.) ;
  • Cho, I.C. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.) ;
  • Lee, C.E. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.) ;
  • Lee, S.S. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.) ;
  • Kang, S.Y. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.) ;
  • Choi, Y.L. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.) ;
  • Oh, W.Y. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.) ;
  • Sung, P.N. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.) ;
  • Ko, S.B. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.) ;
  • Oh, M.Y. (Department of Life Science, College of Natural Sciences, Cheju National University) ;
  • Ko, M.S. (National Institute of Subtropical Agriculture, R.D.A.)
  • 한상현 (농촌진흥청 난지농업연구소) ;
  • 조인철 (농촌진흥청 난지농업연구소) ;
  • 이종언 (농촌진흥청 난지농업연구소) ;
  • 이성수 (농촌진흥청 난지농업연구소) ;
  • 강승률 (농촌진흥청 난지농업연구소) ;
  • 최유림 (농촌진흥청 난지농업연구소) ;
  • 오윤용 (농촌진흥청 난지농업연구소) ;
  • 성필남 (농촌진흥청 난지농업연구소) ;
  • 고서봉 (농촌진흥청 난지농업연구소) ;
  • 오문유 (제주대학교 생명과학과) ;
  • 고문석 (농촌진흥청 난지농업연구소)
  • Published : 2004.12.31
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Abstract

Using PCR-RFLP haplotyping for the mitochondrial DNA(mtDNA) fragment containing the NADH dehydrogenase 2 gene(ND2) and three tRNA genes(tRNA-Met, tRNA-Trp and tRNA-Ala), we characterized the genetic diversity of five pig breeds including Jeju native pigs. mtDNA polymorphisms showing distinct cleavage patterns were found in the pig breeds. Two digestion patterns were detected when HaeIII- and Hinfl-RFLP, and four in the Tsp5091-RFLP analyses. Combining the three restriction enzyme digestion patterns found in five different pig breeds, four mtDNA haplotypes were observed and the haplotype frequencies were significantly different by the pig breeds. A monomorphic haplotype, mtWB, was observed in both Korean wild boars and Large White pigs. Both Duroc and Landrace pigs contained two haplotypes suggesting their multiple maternal lineages. Jeju native pig has two haplotypes(mtJN and mtJD). Of these, mtJN is identified as a Jeju native pig specific haplotype. This study suggested that more than two progenitor populations have been taken part in the domestication process of the Jeju native pig population, and/or probably subsequent crossing with other pig breeds from near east Asia. Unlike with our prediction, there was no direct evidence under molecular levels on the maternal introgression of Korean wild boar in the domestication of Jeju native pigs. In conclusion, specificity of mtDNA haplotypes related to pig breeds win be useful for identifying the maternal lineage as wen as constructing the genealogical pedigree in pigs.

미토콘드리아 ND2 유전자와 세 가지 tRNA (tRNA-M앙, tRNA-Trp, tRNA-Ala)들이 포함}는 mtDNA 절펀의 PCR-RFLP haplotyping 기법으로 제주도에서 사육하는 한국 재래돼지를 포함하는 5개 품종에 대한 유전적 다양성을 조사하였다. 몇몇 돼지 품종에서 mtDNA 상의 제한절편 길이의 다형성이 관찰되었다. HaeIll-와 Hinf1RFLP에서는 두 가지 제한절편 유형, Tsp509IRFLP에서는 네 가지 유형으로 각각 구분되었다. 발견된 제한절편 유형들을 조협하여 mtDNA haplotype으로 구분했을 때, 모두 네 가지 haplotype들이 발견되었고 집단에 따라 각기 다른빈도를 나타내였다. 하나의 동일한 haplotype mtWB가 한반도 야생멧돼지와 Large White 집단에서 관찰되었다. Duroc과 Landrace 품종들은 여러 모계 선조에서 유래되었을 것으로 추정되는 두 가지의 haplotype들을 가지고 있었다. 제주도에서 사육되고 있는 한국재래돼지 집단에서는 muD와 mtJN haplonpe들이 관찰되었는데, 이 중 mtJN은 빈도가 높고 집단 특이적이었다. 본 연구의 결과는 제주 돼지 집단의 형성에 적어도 둘 이상의 모계 선조가 참여했으며, 이후 동아시아 언근 돼지 품종들과의 인위적인 교잡아 이루어졌을 것으로 추정된다. 연구진의 예상과는 달리 한반도 야생멧돼지가 제주 재래돼지 집단의 모계 선조라는 증거는 확인되지 않았다. MtDNA haplotype과 돼지 계통간의 관계 에서의 특이성은 돼지 육종에 있어 모계 확인과 계보 구성에 매우 유용한 정보를 제공할 것으로 사료된다.

Keywords

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