폭약 TNT를 분해하는 세균인 Pseudomonas SP. HK-6에서 분리정제된 Nitroreductase의 특성연구

Characterization of Nitroreductase Purified from TNT-degrading Bacterium, Pseudomonas sp. HK-6.

  • 호은미 (순천향대학교 생명과학부) ;
  • 강형일 (순천대학교 환경교육과) ;
  • 오계헌 (순천향대학교 생명과학부)
  • 발행 : 2004.09.01

초록

균주 Pseudomonas sp. HK-6로부터 2,4,6-trinitrotoluene (TNT)의 대사 과정에서 유도되는 nitroreductase (NTR)를 분리 및 정제하여 다양한 특성조사를 실시하였다. NTR은 균주 HK-6의 세포추출물로부터 ammonium sulfate 침전, DEAE-sepharose, 그리고 Q-sepharose chromatography의 일련의 과정을 통하여 분리되었고, NTR의 활성을 가지는 세개의 다른 fractions를 확인하였다. 균주 HK-6의 NTR fractions I, II, 그리고 III의 비 활성은 각각 4.85 unit/mg, 5.47 unit/mg, 5.01 unit/mg으로 측정되었으며, 세포추출물에 비해 각각 9.0배, 10.1배, 9.3배 농축된 것으로 나타났다. SDS-PAGE에서 측정된 균주 HK-6의 NTR fractions I, II 그리고 III의 분자량은 모두 약 27 kDa으로 확인되었다. 정제된 NTR의 활성에 온도, pH, 금속 이온, 억제 물질의 효과와 기질 특이성 등에 대한 물리화학적 특성 조사를 실시하였다. 균주 HK-6의 NTR fractions I, II, 그리고 III의 적정온도는 $25~35^{\circ}C$ 확인되었고, 모두 $30^{\circ}C$에서 최대 활성을 나타내었으며, 이들 효소 활성의 적정 pH는 7.0~8.0이었고, 최적 pH는 7.5로 확인되었다. TNT에 대한 HK-6의 NTR fractions I, II, 그리고 III의 활성은 금속 이온 $Ag^{+}$ , $Cu^{2+}$ , 그리고 $Hg^{V}$ 에 의해서 약 70%이상 저해되었으며, $Mn^{2+}$ 또는 $Ca^{2+}$ 에 의해서 약 20~50%로 활성이 억제되었다. 그러나 $Fe^{2+}$ /첨가 시에는 효소의 활성에 크게 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. NTR의 활성에 대한 억제물질의 영향은 $\beta$-mercaptoethanol 첨가 시에 효소의 활성이 모두 억제되었고, dithiothreitol, EDTA, 그리고 NaCl 첨가시에도 활성이 감소하는 것으로 확인되었다. TNT와 그 유사기질을 이용하여 HK-6에서 분리된 NTR의 기질 특이성을 조사한 결과, TNT, nitrobenzene, 그리고 RDX에 대해서는 비교적 활성이 높게 나타났으나 2,6-DNT와 2,4-DNT에서는 낮은 활성을 나타내는 것으로 확인되었다.

In this study nitroreductase from Pseudomonas sp. HK-6 capable of degrading 2,4,6-trinitrotoluene (TNT) was characterized. Through a series of purification process including ammonium sulfate precipitation, DEAE-sepharose, and Q-sepharose, three different fractions I, II, and III having the enzyme activity of NTRs whose molecular weights were approximately 27 kDa were detected in fractions from HK-6 cells. Specific activity of the three fractions were approximately 4.85 unit/mg, 5.47 unit/mg, and 5.01 unit/mg, and concentrated to 9.0-, 10.1-, and 9.3-fold compared to crude extract, respectively. The optimal pH and temperature for the three NTR fractions were approximately 7.5 and $30^{\circ}C$, respectively. Metal ions, $Ag^{+}$ , $Cu^{ 2+}$, $Hg^{2+}$ inhibited approximately 70% of enzymes activities of all NTR, while $Fe^{2+}$ did not stimulate or inhibit the activities. Monitoring the effect of chemicals on the enzyme activity revealed that those NTR fractions lost enzyme activity in presence of $\beta$-mercaptoethanol, but were a little influenced by dithiothreitol, EDTA and NaCl. The three NTR fractions demonstrated enzyme activities for nitrobenzene and RDX as well as TNT.

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참고문헌

  1. Protein method(2nd ed.) Bollag, D. M.;M. D. Razycki;S. J. Edelstein
  2. Anal. Biochem. v.72 A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding Bradford, M. M. https://doi.org/10.1016/0003-2697(76)90527-3
  3. Free Radic. Biol. Med v.5 DT-diaphorase-catalyzed two-electron reduction of various p-benzoquinone- and 1,4-naphthoquinone epoxides Brunmark, A.;E. Cadenas;A.J. Segura;C. Lind;L. Ernster https://doi.org/10.1016/0891-5849(88)90076-7
  4. J. Biol. Chem. v.266 Purification and characterization of an oxygen-insensitive NAD(P)H-nitroreductase from Enterobacter cloacae Bryant, C.;M. DeLuca
  5. Appl. Microbiol. Biotechnol. v.65 Characterization of Pseudomonas sp. HK-6 cells reponding to explosive RDX (hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine) Chang, H. W.;H. Y. Kahng;S. I. . Kim;J.W. Chun;K. H. Oh.
  6. Appl. Environ. Microbiol. v.64 Aerobic degradation of 2,4,6-trinitrotoluene by Enterobacter cloacae PB2 and by pentaerythritol tetranitraten reductase French, C. E.;S. Nicklin;N. C. Bruce
  7. J. Biol. Chem. v.277 Structure of nitroreductase in three states Haynes, C. A.;R. L. Koder'A.-F. Miller;D. W. Rodgers. https://doi.org/10.1074/jbc.M111334200
  8. Can. J. Microbiol. v.46 Type I nitroreductase in soil enterobacteria reduce TNT (2,4,6-trinitrotoluene) and RDX (hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine) Kitts, C. L.;C. E. Green;R. A. Otley;M. A. Alvarez;P. J. Unkefer https://doi.org/10.1139/cjm-46-3-278
  9. Biochemistry v.96 Nitroreductase A is regulated as a member of the soxRS regulon of Escherichia coli Liochev, S. L.;A. Hauslanden;J. Fridocich
  10. Arch. Biochem. Biophys. v.385 Quantitativa structure-activity relationships in two-electron reduction of nitroaromatic compounds by Enterobacter cloacae NAD(P)H:nitroreductase Nivinskas, H.;R. L. Koder;Z. Anusevieius;J. Sarlauskas;A. F. Miller;N. Cenas https://doi.org/10.1006/abbi.2000.2127
  11. Mutat. Res. v.508 Identification and characterization of SnrA, an inducible oxyzen-insensitive nitroreductase in Salmonella enterica serovar typhimurium TA1535 Nokhbeh, M. R.;S. Boroumandi;N. Pokorny;P. Koziarz;E. S. Paterson;I. B. Lambert. https://doi.org/10.1016/S0027-5107(02)00174-4
  12. Bull. Environ. Contam. Toxicol v.61 Degradation of explosive2,4,6-trinitrotoluene by s-triazine degrading bacterium isolated from contaminated soil Oh, K. H.;Y. J. Kim. https://doi.org/10.1007/s001289900818
  13. Environ. Sci. Technol. v.34 Enzymatic reduction of 2,4,6-trinitrotoluene and related nitroarenes: Kinetics linked to one-electron redox potentials Riefler, R. G.;B. F. Smets. https://doi.org/10.1021/es991422f
  14. J. Bacteriol. v.177 Purification and characterization of nitrobenzene nitroreductase from Pseudomonas pseudoalcaligenes JS45 Somerville, C. C.;S. F. Nishion;J. C. Spain. https://doi.org/10.1128/jb.177.13.3837-3842.1995
  15. Arch. Environ. Contam. Toxicol. v.42 Interaction of 2,4,6-trinitrotolueneb (TNT) and 4-amino-2,6-dinitrotoluene with humic monomers in the presence of oxidative enzymes Wang, C.-J.;S. Thiele;J. -M. Bollag. https://doi.org/10.1007/s002440010284
  16. J. Biol. Chem. v.273 Purification and characterization of wild-type and mutant "classical" nitroreductase of Salmonella typhimurium L33R mutation greatly diminishes bunging of FMN to the nitroreductase of S. typhimurium Watanabe, M.;T. Nishion;T. Nohmi https://doi.org/10.1074/jbc.273.37.23922
  17. J. Bacteriol. v.178 Biochemical characterization of NfsA, the Escherichia coli major nitroreductase exhibiting a high amino acid sequence homology to Frp, a Vibrio harveyi flavin oxidoreductase Zeno, S.;H. Koike;A. N. Kumar;R. jayaraman;M. Tanokura;K. Saigo. https://doi.org/10.1128/jb.178.15.4508-4514.1996