Abstract
The technique known as proteomics is useful for characterizing the protein expression pattern of a particular tissue or cell type as well as quantitatively identifying differences in the levels of individual proteins. In present study, we carried out the comparative expression patterns of white and red muscles. We used the two-dimensional electrophoresis(2-DE) for analyzing the protein expression. Proteins isolated from porcine white and red muscles were separated by 12% poly-acrylamide gel and then were detected by coomassie blue and silver staining. More than 600 protein spots were detected on each 2-DE gel. By visual analysis of the stained gel, five proteins were identified to be differentially expressed in the white vs red muscle. By database searching based on the molecular weights and pI(isoelectric point) of the five proteins, three of them were found to be most close to troponin I, T and myoglobin. However, further researche is needed for identification and functional analysis of the unidentified proteins. In conclusion, we found five proteins, which are differentially expressed in the white vs red muscle. The functional analysis of the differentially expressed proteins will provide valuable information on biochemical characteristics of the muscle type.
근육의 생화학적 특성을 단백질 수준에서 분석하기 위하여 3원교잡종 돼지 3개체를 선발하고, white muscle은 longissimus dorsi muscle을 red muscle은 soleus muslce을 분리하여 분석에 이용하였다. 각 근육조직은 수용성, 불수용성 단백질 및 총단백질로 분리하여 추출하였고, 이차원전기영동 분석을 위하여 17cm 길이의 immobilized pH gradient strip (Bio-Rad, 3-10NL)과 12% acrylamide gel을 이용하여 전개하였다. 각각의 gel은 coomassie stain과 silver stain을 통하여 가시화 하였고, PDQuest software을 통하여 단백질 발현양상을 분석하였다. 하나의 gel에서 평균 600개 이상의 단백질 spot을 관찰하였으며, 반복실험을 통하여 white muscle과 red muscle간에 발현의 차이를 보이는 5개의 단백질 spot을 확인할 수 있었다. 5개의 spot 중 4개의 단백질은 측정된 분자량과 pI값이 troponin I, T 및 myoglobin의 수치값과 유사한 것으로 확인되었다. 그러나, 1개의 spot은 오차범위 내에서 유사한 단백질을 확인할 수 없었다. 5개의 단백질 spot중 1개(spot 1)는 white muscle에서, 4개의 spot(spot 2~5)은 red muscle에서 높게 발현됨을 확인하였으며, 특히 spot 4의 경우 white muscle 보다 red muscle에서 평균 14.6배 높게 발현됨을 확인하였다. 본 연구는 근육의 생화학적 특성을 이해하는데 중요한 기초 자료로 활용될 수 있으며, 앞으로 white muscle과 red muscle의 단백질 발현 분석을 통하여 단백질 수준에서의 생화학적 특성에 관한 연구가 충분히 진행되어야 할 것이다.