Genetic Variation of the Wild Strains of Lentinula edodes in Three Mountains of Korea

계방산, 오대산 및 지리산 야생 표고균주의 유전적 변이

  • Kim, Dool-Yi (Molecular Genetic Division, National Institute of Agricultural Science and Technology) ;
  • Bak, Won-Chull (Division of forest chemistry, Forestry Research Institute)
  • 김둘이 (농업과학기술원 분자유전과) ;
  • 박원철 (임업연구원 산림화학과)
  • Published : 2001.10.30

Abstract

Genetic variation of the wild strains of Lentinula edodes[(Berk.)Pegler] in three regions of Korea was investigated by analyzing random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. A total of 32 strains of L. edodes were collected from Mt. Kyebang (10 strains), Mt. Odae (11), and Mt. Jiri (11), respectively. The genomic DNA was amplified by polymerase chain reaction (PCR) using an arbitrary 10-mer primer. A total of 170 amplified fragments were observed, of which 161 fragments were polymorphic. The results of cluster analysis, performed on the basis of the presence or absence of amplified fragments of the same size, revealed that strains collected from both Mt. Kyebang and Mt. Odae in a single group. AMOVA analysis revealed that genetic variations between sites amounted to 12.5%, while 87.1% of total variations was explained by variations among strains within sites. Relatively high genetic relationships among the strains of Mt. Kyebang and Mt. Odae, which were high variance within populations. Whereas, all the strains of Mt. Jiri, which were low variance among populations from both Mt. Kyebang and Mt. Odae, which resulted in genetic isolation of the strains in Mt. Jiri.

RAPD 검정법을 이용하여, 우리 나라에 자생하고 있는 야생 표고균주의 지역간 유전변이에 관해 분석하였다. 사용된 야생 표고균주는 계방산 수집 10개, 오대산 수집 11개, 지리산 수집 11개의 야생 표고 총 32균주를 사용하였다. Genomic DNA를 추출하여 10개의 random primer를 사용하여 PCR 증폭시킨 후 전기영동 한 결과 170개의 밴드가 관찰되었으며, 그중 다형성 밴드는 161개가 검출되었다. 이들 전기영동 상에 나타난 밴드의 유무(1,0)로 cluster 분석을 한 결과, 계방산과 오대산 표고균주들이 하나의 그룹으로, 나머지 지리산 표고균주들이 다른 하나의 그룹으로 형성되었다. 또한 AMOVA 분석결과 세 지역의 집단간 유전적인 차이는 12.5%를 나타내었고, 각 균주들 간에는 87.5%임을 알 수 있었다. 이러한 결과는 계방산과 오대산 균주들은 그룹 내 분화가 큰 것이 주요 원인일 것으로 생각되며, 반면, 지리산 균주들은 계방산과 오대산과는 유전적 격리가 존재함을 알 수 있었다.

Keywords

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