초록
참외와 멜론의 다양성 분석을 위하여 RAPD 분석 최적조건과 군집분석하였다. 참외와 멜론계통의 DNA 추출은 0.5% SDS 방법이 가장 순수하고 많은 DNA를 얻을 수 있었으며 DNA 증폭시 최적 반응조건은 총 volum $15{\mu}L$ 중 DNA 10ng, Primer 270nM, dNTP $200{\mu}M$, dynazyme 0.3unit. 10x buffer $1.5{\mu}l$이였으며 나머지는 3차 증류수로 보충된다. PCR기기의 최적 setting은 DNA denaturation $94^{\circ}C$ 30초, primer annealing $39^{\circ}C$ 30초, DNA extension $72^{\circ}C$ 30초이며 최적 증폭 횟수는 40 cycle 이었다. 사용된 12개의 primer 만들어진 총 123개의 band 중 신뢰도가 높은 25개(20%)의 polymorphic band를 선발하여 이용하였으며 평균 polymorphic band 수는 2.1개로 나타났고, 그룹내 polymorphic band 수가 그룹간보다 적어 그룹내의 유전적변이가 적음을 보여주었다. 군집분석 결과 크게 참외와 멜론그룹으로 나뉘었고 멜론그룹은 다시 net melon 과 no-net melon으로 나뉘었으며 이러한 결과는 기존의 표현형질에 의한 분류와 일치하였다. 재래종 참외와 멜론 그룹은 8개의 marker에 의해 구분되었고 net melon 그룹과 no-net melon 그룹은 4개의 marker에 의해 구분되었다.
RAPD markers were analyzed in order to detect the genetic variation and diversity of the fifty-two melon lines. SDS extraction method produced more and purer DNA than CTAB method. RAPD reaction conditions were optimized as follows ; 10ng template DNA, 270nM primer, $200{\mu}M$ each of dATP, dCTP, dGTP and dTTP, $0.3{\mu}unit$ dynazyme and 10x buffer brought to $15{\mu}l$ final volume with distilled water. The adequate annealing temperature was $39^{\circ}C$ and forty cycles of amplification produced the best RAPD band patterns. Among a total of 123 bands from 12 random primers, 25 polymorphic bands(20%) were selected as reliable markers. The average number of polymorphic bands per primer was 2.1 among the 52 lines. Intragroup genetic relationship based on the marker difference was closer than intergroup genetic relationship. The 52 lines could be grouped into two major group (Korean landraces and melon lines) and then melon group subdivided into two subgroups (net melon lines and no-net melon). This result corresponded to morphological grouping. Eight RAPD markers separated the Korean landraces and melon groups and four RAPD markers separated net melon and no-net melon groups.