Korean Journal of Microbiology (미생물학회지)

The Microbiological Society of Korea (한국미생물학회)
권호 표지

Molecular Cloning and Nucleotide Sequence of the N Protein of a Korean Isolate of Infectious Hematopoietic Necrosis Virus

한국에서 분리된 전염성 조혈괴저바이러스의 N 단백질의 유전자 클로닝과 염기서열 분석

  • Mun, Chang-Hoon (Department of Biological Science, University of Ulsan) ;
  • Kim, Hyun-Ju (Department of Biological Science, University of Ulsan) ;
  • Park, Jeong-Min (Department of Biological Science, University of Ulsan) ;
  • Cho, Wha-Ja (Department of Biological Science, University of Ulsan) ;
  • Cha, Seung-Ju (Department of Biological Science, University of Ulsan) ;
  • Yoon, Won-Joon (Department of Biological Science, University of Ulsan) ;
  • Park, Jeong-Jae (Department of Biological Science, University of Ulsan) ;
  • Lee, Eun-Hee (Department of Molecular Biology, Pusan National University) ;
  • Kang, Hoe-Sung (Department of Molecular Biology, Pusan National University) ;
  • Kim, Han-Do (Department of Molecular Biology, Pusan National University) ;
  • Park, Jeong-Woo (Department of Biological Science, University of Ulsan)
  • 문창훈 (울산대학교 생명과학부) ;
  • 김현주 (울산대학교 생명과학부) ;
  • 박정민 (울산대학교 생명과학부) ;
  • 조화자 (울산대학교 생명과학부) ;
  • 차승주 (울산대학교 생명과학부) ;
  • 윤원준 (울산대학교 생명과학부) ;
  • 박정재 (울산대학교 생명과학부) ;
  • 이은희 (부산대학교 분자생물학과) ;
  • 강호성 (부산대학교 분자생물학과) ;
  • 김한도 (부산대학교 분자생물학과) ;
  • 박정우 (울산대학교 생명과학부)
  • Received : 1998.03.18
  • Accepted : 1998.05.18
  • Published : 1998.06.01
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Abstract

We have cloned and analyzed cDNA coding for nucleocapsid protein N from infectious hematopoietic necrosis virus(IHNV), IHNV-PRT, which was isolated in Korea. The N gene had open reading frame of 1,176 bp that encoded a 391 amino acids with a molecular weight of 42.3 kDa. The deduced amino acid sequence of N protein was 75-90% identical to those of foreign isolates, IHNV, but was 43% and 38% identical to those of other species of fish rhabdovirus, hirame rhabdovirus(HRV) and viral hemorrahagic septicemia virus(VHSV), respectively. However, it revealed high levels of sequence identity between 214-265 amino acid sequences among all species of fish rhabdovirus.

한국에서 분리된 전염성 조혈괴저바이러스(infectious hematopoietic necrosis virus, IHNV)인 IHNV-PRT의 nucleocapsid(N)를 암호화하고 있는 cDNA를 클로닝하여 분석하였다. N 유전자는 391개의 아미노산으로 구성된 42.3 kDa의 분자량을 가진 단백질을 암호화하는 1,176 bp 크기의 open reading frame을 가지고 있었다. N 단백질의 아미노산 서열을 다른 외국에서 분리한 IHNV들의 N과 비교한 결과 75-90% 정도의 유사성을 보였으나 다른 종의 fish rhabdovirus인 hirame rhabdovirus(HRV) 및 viral hemorrhagic septicemia virus(VHSV)와는 각각 43%와 38%의 유사성을 보였다. 그러나 아미노산 서열 214-265의 52개의 아미노산들은 모든 종의 fish rhabdovirus간에 매우 높은 유사성을 보여 주었다.

Keywords

Acknowledgement

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