16S rRNA 유전자 계통분석에 의한 한강수계의 세균 다양성

Bacterial Diversity of the Han River as Determined by 16S rRNA Gene Analysis

  • 한석균 (단국대학교 자연과학대학 생명과학부) ;
  • 이일규 (단국대학교 자연과학대학 생명과학부) ;
  • 안태영 (서울대학교 분자미생물학 연구센터)
  • Han, Suk-Kyun (Dept. of Microbiology, Dankook University) ;
  • Lee, Il-Gyu (Dept. of Microbiology, Dankook University) ;
  • Ahn, Tae-Young (Research Center for Molecular Microbiology, Seoul National University)
  • 투고 : 1998.05.07
  • 심사 : 1998.11.06
  • 발행 : 1998.12.01

초록

한강의 본류와 만나는 탄천과 중랑천에서 16S rDAN를 증폭하고 부분적인 염기서열 분석을 통하여 한강의 세균 다양성을 결정하였다. 총 27개의 클론을 분리하였으며 RFLP를 이용하여 7개의 group으로 나누었다. 탄천의 15개 클론은 4개의 group으로 나뉘어졌으며 가장 많은 클론을 포함하는 group(HT-1 클론)은 class Proteobacteria의 ${\delta}$-subdivision에 속하는 Acrobacter cryaerophilius와 높은 유사도를 보였으며, 다른 두 group(HT-6과 HT-9 클론)은 모두 clas Cytophagales에 속하였다. 중랑천의 12개의 클론은 3개의 group으로 나뉘어졌으며 가장 많은 클론을 보이는 group(HJ-1 클론)은 class Proteobacteria의 ${\alpha}$-subdivision에 속하는 Sphingomonas sp. 와 높은 유사도를 나타내었다. 전체적으로는 Proteobateria(alpha, beta and delta subdivision), Cytophagales와 Actinomycetales가 검출되었다.

Bacterial diversity was determined by amplification and sequencing of 16S rDNA at Tancheon and Jungrang in Han river. Twenty-seven clones constructed were divided 7 groups using RFLP. Fifteen clones were classified 4 groups in Tancheon and the group (HT-1 clone) including many clones was affiliated a high similarity with Aerobacter cryaerophilus (the class Proteobacteria including members of the delta subdivisions). The other two groups (HT-6 and HT-9 clone) including several clones were classified with the class Cytophagales in Tancheon. Twelve clones were classified 3 groups in Jungrang and the group (HJ-1 clone) including many clones was affiliated a high similarity with Sphingomonas sp. (the class Proteobacteria including members of the alpha subdivisions). As a whole results, the class Proteobacteria (alpha, beta and delta subdivision), the order Cytophagales, and the order Actinomycetales were detected.

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과제정보

연구 과제 주관 기관 : 서울대학교 분자미생물학 연구센타, 단국대학교