Genetic variance of Tuchomonns uaginclis isolates by Southern hybridization

Southern hybridization에 의한 질편모충의 유전학적 다양성

In the present study, genomic DNAs were purified from Korean isolates (KT8, KT6, KT-Kim and KT-Lee) and foreign strains (CDC85, IR78 and NYH 286) of 1Trichomonas voslnalis, and hybridized with a probe based on the repetitive sequence cloned from T. uqfinolis to observe the genetic differences. By Southern hybridization, all isolates of T. uoSinoLis except the NYH386 strain had 11 bands. Therefore all isolates examined were distinguishable into 3 groups according to their banding patterns; i) KT8, KT6 and KT-Kim isolates had 11 identical bands such as 1 kb, 1.2 kb, 1.6 kb, 1.9 kb, 2.3 kb. 27 kb, 3.2 kb, 2.4 kb, 3.8 kb, 4.9 kb and 6.0 kb, ii) The metronidazole-resistant IR78 strain had the some bands as KT-Lee isolate at bands of 1 kb, 1.2 kb, 1.6 kb. 1.8 kb, 2.1 kb, 2.5 kb, 2.7 kb, 2.9 kb, 3.4 kb, 5.0 kb and 6.0 kb, Bands of CDC85, metronidazole-resistant strain, were similar to those of IR78 and KT-Lee, except that 3.2 kb replaced 2.9 kb. iii) NYH286 particularly had 12 bands and bun patterns were similar to IR78 with a few exceptions as follows; i) 6.2 kb in place of 6.0 kb, ii) 2.0 kb and 2.2 kb instead of 2.1 kb. Through the results obtained, genetic variance of T. uoginnlis isolates was demonstrated by Southern hybridization.

질편모충 7개 분리주 (국내분리주 UT8, KT6, UT-Kim 및 fr-Lee, 외국 분리주 CDC85, IR78 및 NYH286주)의 유전학적 차이점을 관찰하고자 Southemhybridization을 하였다. 탐침 (probe) 은 질편모충 DNA에 있는 반복적인 염기서열을 기초로 하여 337 bp의 탐침을 제작하였다. 질편모충 각 분리주를 클로닝하고 각각의 원충을 따로 배양하여 DNA를 분리하여 제한효소를 처리한 후 전기영동하고 Southemhybridization을 하였다. 질편모충 분리주에 관계엄이 11개 내외의 븐회이 관찰되었다. 콜로니가 2개 형성된 KT8, IR78 및 KT-Lee 분리주에서는 클로닝하기 전의 분리주와 클로닝하여 형성된 콜로니를 배양한 질편모충에서 같은 bandpattem이 관찰되었다. 사용된 모든 질편모충을 bandpattem에 따라 3군으로 나눌 수 있었는데, KT8 분리주는 국내 분리주인 KT6, KT-Kim 분리주와 같은 band pattern을 보여 1 kb, 1,2 kb, 1.6 kb, 1.9 kb, 2.3 kb, 2.7 kb, 3.2 kb, 3.4 kb, 3.8 kb, 4.9 kb 및 6.0 kb의 11개의 공통 분획을 보였다. 외국분리주로 metronidazole에 내성인 IR78 분리주는 국내 분리주인 fr-Lee 분리주와 같은 분획을 보여 1 kb, 1.2 kb, 1.6 kb, 1.8 kb, 2.1 kb, 2.5 kb, 2.7 kb, 2.9 kb, 3.4 kb, 5.0 kb 및 6.0 kb의 분획을 보였으며 IR78과 같이 약제 내성이 있다고 알려진 CDC85의 경우 IR78, KT-Lee 분리주와 비슷한 분획을 보였으나 2.9 kb가 없고 3.2 kb의 분획이 관찰되었다. 세번째 군에 해당되는 NYH286주는 12개의 분획을 보였는데 IR78, KT-Lee 분리주와 유사한 분획을 보였으나 그 차이점 은 6.0 kb 대신 6.2 kb를, 2. 1 kb 대신 2.0 kb와 2.2 kb를 나타냈다. 이상의 결과로 질편모충 여러 분리주의 유전학적 다양성이 관찰되었다.