Mitochondrial DNA Analysis of the Fleshy Prawn (Penaeus chinensis) for Stock Discrimination in the Yellow Sea

황해산 대하(Penaeus chinensis)의 계군분석을 위한 미토콘드리아 DNA 분석

The mitochondrial DNA (mtDNA) restriction fragment length polymorphi는 (RFLPs) of five populations were analyzed to delineate the stocks of Penaeus chinensis (Osbeck) in the Yellow Sea. Comparison of P. chinensis with P. japonicus to clarify the nucleotide divergence between two species was also carried out. Based on the fragment patterns, three composite haplotypes were analyzed in P. chinensis mtDNA as four naplotypes were in P. japonicus. Most individuals of each P. chinensis population are shared by one dominant haplotype. Another two haplotypes haying variations at the C/a I and hull sites were also distributed evenly in the Korean and Chinese populations. It is suggested that the gene exchange occurring between populations in the Yellow Sea is frequent. Average length of the mtDNA molecule was estimated to be about 16.44 kb in P. chinensis and 16.31 kb in P. japonicus, Sequence divergence (p) of mtDNA between two species estimated by using Upholt's (1977) fomula was $13.7\%$.

황해 서식 대하(P. chinenesis) 각 개체군의 유전 구조를 파악하기 위하여 미토콘드리아 DNA(mtDNA)를 추출한 후 BamHI등 15종의 제한효소를 이용한 제한효소 절편 다형 현상 (Restriction Fragment Length Polymer-phisms; RFLPs)을 분석하였으며 보리새우 (P. japonicus)와의 염기 치환 정도를 비교하기 위하여 일본 나가사키 1 집단의 절편 양상도 함께 분석하였다. 한국의 대천, 진도, 나로도 집단과 중국의 발해, 청도 집단 등 5개 집단을 분석한 결과, 대하에서는 3종의 haplotype이 발견되었으나 5개 집단 모두가 하나의 haplotype에 의해 지배되고 있는 것으로 나타났다. 나타난 변이는 2종류로 Cla I과 Pvu II 인식부위가 부가된 변이가 청도와 나로도 집단에서 출현하였을 뿐 전 집단에 대한 나머지 13종의 제한 효소 절편 양상은 모두 동일한 것으로 나타났다. 이와 같은 결과에서 보면 황해산 대하의 각 집단 사이에는 활발한 유전자 교류가 있는 것으로 판단되며, 3개 계군에 대한 지금까지의 구분은 재검토되어야 할 것으로 판단된다. 대하와 보리새우의 mtDNA 공통절편을 이용한 p 값에 의한 염기치환은 $13.7\%$ 정도인 것으로 나타났으며, 제한 효소별 절편의 크기를 비교한 결과 대하의 mtDNA의 크기는 평균 16.44kb였고 보리새우는 약 16.31kb였다.