The Number of Nucleotide Substitutions per Sites of Mitochondrial DNA in the Four Pleuronectid Species

미토콘드리아 DNA에 의한 붕넙치과 어류 4종간의 염기치환수

  • PARK Jung-Youn (Genetics and Breeding Division, National Fisheries Research and Development Agency) ;
  • KIM Yoon (Genetics and Breeding Division, National Fisheries Research and Development Agency)
  • 박중연 (국립수산진흥원 유전육종과) ;
  • 김윤 (국립수산진흥원 유전육종과)
  • Published : 1995.09.01

Abstract

In order to estimate the level of genetic differences among the pleuronectid species, mitochondrial DNAs were isolated from four species: brown sole, Limanda herensteini; marbled sole, Limanda Yokohamae; stone flounder, Kareius bicoloratus; starry flounder, Platichthys stellatus, and the number of nucleotide substitutions was calculated by the restriction fragment length polymorphisms (RFIPs) generated by f4 sin base recognition restriction endonucleases. Total lengths of the mitochondrial DNA were measured as about 17.6 kbp in all species. Ten different composite genotypes were observed in brown sole, four different genotypes in marbled sole, and two different genotypes in starry flounder. However, only one genotype was observed in stone flounder. The calculated haplotypic diversity value of brown sole was higher than that of marbled sole. The average number of nucleotide substitutions per sites in four species was estimated to be 0.0045 in the intraspecies, 0.0344 in the interspecies, and 0.0457 in the genera, respectively. From these results, we could estimate that the genetic differences among interspecies were not influenced by nucleotide substitutions but genetical discontinuous.

붕넙치과 어류의 종간에 있어서의 유전적 분화정도를 DNA level에서 관찰하기 위하여 참가자미, 문치가자미, 돌가자미, 강가자미의 미토콘드리아 DNA를 분리하고, 6염기인식의 14제한효소로써 절단한 절단단편의 염기치환수를 계산하였다. 1) mtDNA 총염기대수는 4종 모두 17.6kbp 부근으로 나타나 동일한 염기대수를 가지는 것으로 추정되었다. 2) 14종류의 제한효소로써 절단한 절단단편의 pattern으로 4종의 종내 및 종간의 haplotype수를 조사한 결과, 참가자미에서는 10개, 문치가자미에서는 4개, 강가자미에서는 2개, 돌가자미에서는 1개의 haplotype이 관찰되었으며, 종간에 있어서는 공통적인 haplotype가 전혀 관찰되지 않았다. 3) mtDNA의 유전적 변이성을 나타내는 haplotype 다양도 (h)는 참가자미에서 0.588, 문치가자미에서 0.371로 나타나 참가자미에서 높은 변이성을 나타내었다. 4) 4종의 유전적 분화의 정도를 mtDNA haplotype간의 제한 부위당 염기치환수 (d)로써 살펴 본 결과, 종내의 평균은 0.0045, 종간의 평균은 0.0344, 속간의 평균은 0.0457로 되어 종간, 속간의 값이 종내에 비해 현저하게 높은 수치를 나타내었다. 5) 4종간의 mtDNA haplotype는 1개 또는 2개의 염기치환에 의한 차이가 아니고 유전적 불연속을 나타내었다.

Keywords