Abstract
The amino acid analysis of polyhedrin protein and nucleotide sequence of polyhedrin gene in H. cunea nuclear polyhedrosis virus (HcNPV) genome have been studied. Polyhedrin had three polypeptide bands in SDS - polyactylamide gel electrophoresis. The major polypeptide had a molecular weight of 25 kd. The polyhedrin was composed of 17 different amino acids. HcNPV DNA was digested with EcoRI restriction enzyme and hybridized with ($\alpha^{32}P$) -labelled AcNPV polyhedrin gene cDNA. The polyhedrin gene was located on the fragment of EcoRI-H. The EcoRI - H fragment containing polyhedrin gene was cloned into the EcoRI site of pUC8 vector which was confirmed with southern blotting, and the recombinant plasmid containg polyhedrin gene was designated as hPE-H. The promoter region of polyhedrin genomic DNA was sequenced. The sequences identified as the TATA box was found at the 5' flanking region of the polyhedrin genomic DNA approximately -79 bp upstream from the transcriptional start site. But CAAT-like box was not shown near the TATA-like box in the polyhedrin gene. Four tandem repeats with the sequence 5' -CTAATAT-3' and 5'-TAAATAA-3' were found between -141 and -108 or -83 upstream and -52 bp downstream from the translation start site. About -141 bp region upstream from the translational start site was highly AT (78%) rich. The coding region for the polyhedrin starts and ends with ATG and TAA, respectively.
H. cunea nuclear polyhedrosis virus (HcNPV) 의 polyhedrin 아미노산 및 polyhedrin gene 의 염기서열을 분석하였다. Polyhedrin 은 SDS-PAGE 상에서 3개의 polypeptide band 가 나타났고 주요 polypeptide 는 약 25 Kd 의 분자량을 갖고 있었다. 또한 polyhedrin 은 17 개의 다른 아미노산으로 구성되어 있었다. HcNPV DNA를 EcoRI 효소로 절단하여 $\alpha^{32}P$로 labelling 된 Autographa californica (AcNPV) polyhedrin gene cDNA 의 probe DNA를 이용하여 hybridization 한 결과 polyhedrin gene은 EcoRI 절편들중 H 절편에 양성반응을 나타냈다. 또한 polyhedrin gene 을 포함하고 있는 EcoRI-H 절편을 pUC8 벡터에 cloning한 다음 이를 hPE-H라고 이름하였다. HcNPV genome DNA 의 promoter 부위를 sequence한 결과 TATA box의 염기배열은 polyhedrin gene 전사 개시위치로부터 위쪽으로 -79 bp 의 5' flanking 부위에서 발견되었다. polyhedrin gene 내 CAAT box는 TATA box 측면 염기 배열에서 나타나지 않았고, 4개의 tandem repeat 5'-CTAATAT-3' 와 5'-TAAATAA-3'의 염기는 polyhedrin gene내 전이 개시 위치로 부터 위쪽으로 -141 과 -108 bp 또는 -83 bp 부위에 존재하였으며, 다른 하나는 전이 개시위치로 부터 아래쪽으로 -52 bp 부위에서 발견되었다. 그리고 polyhedrin gene 내 전이 개시위치로 부터 위쪽으로 -141 bp 부위는 다량의 AT (78%) 염기가 존재하였다. 또한 polyhedrin 의 개시 coding region 은 ATG 였고 종결 coding region은 TAA 였다.