Asymmetry of Cotransduction Frequency Occured When the Transposon Is Used as a Marker

전위인자가 표식인자로 사용될때 발생하는 동시형질도입의 비대칭성

  • 김창훈 (한국과학기술원 생명과학과) ;
  • 박찬규 (한국과학기술원 생명과학과)
  • Published : 1992.04.01

Abstract

When the transposon is used as a selectable marker. the cotransduction frequency depends on the selection order of the markers. In this study. we adopted a mathematical approach to explain this phenomenon. At first, the formation of transducing particles were considered in five different configurations. Then the probability functions indicating the possibilities for a marker to be fixed were mathematically formulated on the basis of probability density concept. After actual values and useful assumptions were integrated into the Formula. resulting frequencies from theoretical calculations were compared with actual data. Such analysis let us conclude that the asymmetry in the frequency arose from the lack of homology required for homologous recombination due to the transposon insertion and from the suppression of recombination around the region where the transposon is inserted.

선택적 표식인자가 전위인자일때, 표식인자의 선택 순서에 따라 동시형질도가 달라진다. 본 연구에서는 이 현상을 설명하기 위하여 아래와 같은 수학적 접근을 시도하였다. 먼저, transducing particle 들의 형성과정을 다섯종류로 유별하였다. 그런다음, 하나의 표지가 고정될 가능성을 의미하는 확률함수들을 확률밀도 개념에 근거하여 수학적으로 정식화였다. 그리고 실제 값들과 유용한 가정들을 이식들에 결합하여 그로부터 얻어진 이론적인 빈도를 실측 값들과 비교하였다. 이려한 분석에 의하여 그 빈도의 상이성이 일반 재조합에 필요한 상용성을 전위인자가 제공하지 봇하고, 그 주변에 재조합 빈도를 거리에 의존하는 형태로 감소시키기 때문이라는 결론을 얻었다.

Keywords