한국콘텐츠학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korea Contents Association Conference)

한국콘텐츠학회 (The Korea Contents Association)
권호 표지

유전자 발현량 비교를 위한 RNA-seq 분석 파이프라인 설계

RNA-seq Analysis Pipeline for Differential Gene Expression

  • 정민아 (과학기술연합대학원대학교) ;
  • 김대수 (한국생명공학연구원)
  • Jung, Minah (University of Science and Technology) ;
  • Kim, Dae-soo (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology)
  • 발행 : 2018.05.11
PDF 다운로드
⟨ 이전 논문 다음 논문 ⟩

초록

여러 단계를 걸쳐 이루어지는 RNA-seq 분석 과정을 한 번에 처리할 수 있는 shell script 파이프라인을 구축하였다. 연구자들로 하여금 trimming, quality control, mapping, assembly, quantification 등 개별 과정을 거치지 않고, 한 줄의 커맨드 라인(command line) 만으로 유전자 발현량과 상대적 발현량 차이를 확인할 수 있는 fold change(FC) 값까지 얻을 수 있도록 하였다.

키워드