Web based Text-mining and Biological Network Analysis System

웹기반 문헌분석 및 생물학적 네트워크 분석시스템 개발

  • 서동민 (한국과학기술정보연구원, 과학기술연합대학원대학교) ;
  • 조성훈 ((주)PDXen) ;
  • 안광성 ((주)PDXen) ;
  • 유석종 (한국과학기술정보연구원, 과학기술연합대학원대학교) ;
  • 박동일 (강북삼성병원)
  • Published : 2017.05.12

Abstract

다양한 위상학적 관계(topological relation)를 분석하는 네트워크 분석은 복잡한 데이터에서 숨어있는 특성과 사실을 발견하는 기술로 최근 빅데이터 분야에서 데이터 분석 핵심 기술로 급부상하고 있다. 본 연구에서는 질병연구에 핵심적인 생물학적 네트워크의 생성 및 사용자 친화적인 네트워크 분석시스템을 개발하였다. 개발한 시스템은 PubMed에서 특정 질병과 관련있는 논문 요약 정보를 자동 수집후 텍스트마이닝을 통해 질병 관련 화합물, 유전자 그리고 상호작용 정보를 추출해 생물학적 네트워크를 생성하는 기능을 제공한다. 또한, 연구자가 손쉽게 생성된 네트워크에 대한 검색 및 다차원 분석을 수행할 수 있는 기능을 제공한다. 마지막으로 개발한 시스템의 우수성을 입증하기 위해 크론병(Crohn's Disease)에 대한 적용사례를 소개한다.

Keywords