Prediction of epitope for Malaria based on bioinformatics

생물정보학기반 말라리아 항원부위의 예측

말라리아에 의한 감염 중 95% 이상을 차지하는 것은 열대열 원충과 삼일열 원충에 의한 감염이다. 각 원충들에 의한 감염은 초기증상이 유사하지만 각각의 치료방법이 다르게 적용되기 때문에 어떤 원충에 의한 발병인지 정확하고 빠른 진단이 필요하다. 본 연구에서는 생명정보학을 기반으로 각 원충에 특이적으로 발현되는 단백질 정보를 중심으로 epitope를 예측하고자 하였다. 먼저 NCBI에서 문헌조사 및 서열정보를 얻었으며, 두 원충에 대한 서열을 multiple alignment를 통해서 비교한 결과 90.2%의 유사성을 보였다. 확보된 특이 부위를 ProtScale Tool 프로그램을 이용하여 hydrophilicity를 분석하고 진단키트 제작에 사용할 수 있는 epitope를 예측하였다.