한국정보처리학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference)
- 한국정보처리학회 2013년도 추계학술발표대회
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- Pages.1203-1206
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- 2013
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- 2005-0011(pISSN)
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- 2671-7298(eISSN)
DOI QR Code
리드 시퀀싱 시뮬레이터 비교 분석
Analysis of Read Sequencing Simulator
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탁해성
(부산대학교 컴퓨터공학과)
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- 이상민 (부산대학교 컴퓨터공학과) ;
- 박기정 (국가생명연구자원정보센터) ;
- 이도훈 (부산대학교 컴퓨터공학과) ;
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조환규
(부산대학교 컴퓨터공학과)
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Tak, Haesung
(Dept of Computer Science & Engineering)
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- Lee, Sang-min (Dept of Computer Science & Engineering) ;
- Park, Kiejung (Korean Bioinformation Center) ;
- Lee, Dohoon (Dept of Computer Science & Engineering) ;
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Cho, Hwan-gue
(Dept of Computer Science & Engineering)
- 발행 : 2013.11.08
초록
차세대 유전자 서열 시퀀싱 기법이 등장함에 따라 참조 유전자 서열로부터 리드를 생성하는 시퀀서의 기술이 다양화 되었다. 이전 시퀀싱 방식에 비해 비용 및 시간 측면에서 효율성이 증대 되었으나, 매핑도구의 검증을 위해서 다양한 생물학적 특이성을 반영하거나 비용이 소요되지 않는 방법을 연구하는 과정에서 리드 시퀀싱 시뮬레이터가 개발되었다. 본 논문에서는 현재 사용되고 있는 리드 시퀀싱 시뮬레이터에서 반영된 시퀀싱 기법을 분석하고 시뮬레이터의 기능적 특성을 분석하고자 한다. 이는 시뮬레이터 개발에 필요한 기능 설계 및 생물학적 특성을 반영하는데 활용하고자 한다.
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