한국정보처리학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference)
- 한국정보처리학회 2013년도 추계학술발표대회
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- Pages.1113-1116
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- 2013
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- 2005-0011(pISSN)
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- 2671-7298(eISSN)
DOI QR Code
문헌정보와 유전자 발현 및 상호 작용 데이터를 통합, 암의 단계를 고려한 질병 유전자 예측 방법
The gene prediction method considering stages of cancer, obtained by integrating gene expression, genetic interaction data and document
- Kim, Jungrim (Dept. of Computer Science, Yonsei University) ;
- Yeu, Yunku (Dept. of Computer Science, Yonsei University) ;
- Park, Sanghyun (Dept. of Computer Science, Yonsei University)
- 발행 : 2013.11.08
초록
유전체에 대한 관심이 크게 증가하면서, 이에 따른 다양한 연구가 이루어졌다. 그 결과 유전체와 관련된 다양한 종류의 데이터가 얻어졌으며, 그것을 해석하고 다른 데이터와 통합하는 것이 중요한 연구과제 중 하나가 되었다. 본 논문은 유전자 상호작용(genetic interaction) 데이터, 유전자 발현 데이터, 문헌으로부터 텍스트마이닝 기술을 통해 얻은 이종(heterogeneous) 데이터를 통합하여 암과 관련이 있는 유전자를 찾는 실험을 수행하였다. 또한, 단순히 질병(disease)-정상(normal)의 대조가 아니라 암의 단계(stage)를 고려한 실험을 수행하였다. 데이터를 통합하지 않거나 암의 단계를 고려하지 않았을 경우에 비하여 제안하는 방법이 더 높은 유전자 예측 성능을 나타냈다.
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