G 단백질 연결 수용체계(GPCR system)에서의 정전기적 포텐셜(Electrostatic Potential)에 따른 효과를 고려한 단백질과 리간드의 상호작용 예측(protein-ligand interaction prediction)

  • 최규홍 (서울대학교 농업생명과학대학 응용생물학전공) ;
  • 신웅희 (서울대학교 자연과학대학 화학부) ;
  • 이동선 (서울대학교 자연과학대학 화학부)
  • Published : 2013.04.17

Abstract

2012년 G 단백질 연결 수용체(G-Protein Coupled Receptors ; GPCR) 연구가 노벨 화학상을 받았다. 상당히 많은 병과 관련되어 있어 잠재력이 크고, 많은 연구가 진행 중이다. 현재 리간드와 단백질간의 정전기적 포텐셜 연구를 통한 예측 연구가 진행되고 있지만, GPCR과 리간드 간의 연구에서 아직 리간드의 전하를 통한 단백질과 리간드간의 상호작용 예측 연구가 되어 있지 않다. 그렇기 때문에 이번 연구에서는 8가지 방법으로 전하(charge)를 띠게 하여서 단백질과 리간드의 상호작용을 계산을 통하여 예측하여 보았다.

Keywords