Selenocysteine을 포함한 polypeptides의 단동위질량을 결정하는 실험

Experiments of Determining Monoisotopic Mass for Selenocysteine-containing Polypeptides

  • 발행 : 2012.06.22

초록

생물학에서 특정 단백질을 구성하는 아미노산 서열을 결정하는 것은 매우 중요하다. 이를 위해 펩타이드의 단동위질량을 결정하는 것은 매우 중요한 문제이다. 하지만 Selenocysteine(Sec)이 가지고 있는 특이 성질 때문에 기존의 알고리즘으로 Sec를 포함한 펩타이드의 단동위질량을 결정하는 것은 쉽지 않다. J.W.Kim et.al.은 Sec의 특성을 고려하여 새로운 모델을 제시하고 그에 맞는 알고리즘을 보였다. 이 논문에서는 실험을 통해 J.W.Kim et.al.이 제안한 알고리즘을 실제 프로그램으로 구현하여 실행할 때 고려해야 할 주요 파라미터 및 함수에 대한 분석을 수행한다.

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