Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2012.06a
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  • Pages.30-32
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  • 2012
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

A Genomes Analysis Benchmark in High Performance Computing

고성능 컴퓨팅 환경에서 유전체 서열 분석 벤치마크

  • Choi, Jae-Hun (Electronics and Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Jung, Ho-Youl (Electronics and Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Park, Soo-Jun (Electronics and Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Choi, Wan (Electronics and Telecommunications Research Institute(ETRI))
  • Published : 2012.06.22

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Abstract

본 논문에서는 고성능 컴퓨팅 환경에서 유전체 서열 분석 도구들을 벤치마크 하기 위한 시스템을 개발하고 실제 유전체 데이터를 이용하여 성능을 비교하였다. 이 벤치마크 시스템은 유전체 분석 파이프라인 절차에 따라 다양한 분석 도구들을 CPU 멀티 코어와 GPU 매니 코어 환경에서 선택적으로 구동할 수 있도록 지원한다. 따라서, 서로 다른 환경에서 수행된 다양한 유전자 분석 도구의 성능을 실제 유전체 서열 데이터를 이용하여 비교하고 시각화할 수 있다.

Keywords