Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference (한국정보처리학회:학술대회논문집)
- 2012.11a
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- Pages.115-117
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- 2012
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- 2005-0011(pISSN)
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- 2671-7298(eISSN)
DOI QR Code
Parallel Processing of BLAST Using Hadoop and Its Performance Evaluation
하둡을 이용한 BLAST의 병렬 처리 및 성능 분석
- Choi, Hoon (Dept. of Software Research, KISTI) ;
- Um, Jungho (Dept. of Software Research, KISTI) ;
- Yoon, Hwa-mook (Dept. of Software Research, KISTI) ;
- Choi, Yun-Soo (Dept. of Software Research, KISTI) ;
- Lee, Minho (Dept. of Software Research, KISTI) ;
- Lee, Won-Goo (Dept. of Software Research, KISTI) ;
- Song, Sa-Kwang (Dept. of Software Research, KISTI) ;
- Jung, Hanmin (Dept. of Software Research, KISTI)
- 최동훈 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실) ;
- 엄정호 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실) ;
- 윤화묵 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실) ;
- 최윤수 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실) ;
- 이민호 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실) ;
- 이원구 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실) ;
- 송사광 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실) ;
- 정한민 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실)
- Published : 2012.11.22
Abstract
차세대 시퀀싱 장비는 기존의 컴퓨팅 방법으로 처리할 수 없을 만큼 많은 양의 시퀀스 데이터를 생성하고 있다. 본 논문에서는 차세대 시퀀스 데이터의 정렬을 위해 널리 사용되고 있는 BLAST의 병렬 처리 방법을 하둡을 사용하여 제시하며, 이의 성능 개선 효과를 분석한다.
Keywords